Стресс-белки и пептиды и способы их применения
Формула / Реферат
1. Выделенный пептид, содержащий приблизительно от 10 до 30 аминокислотных остатков, характеризующийся тем, что по меньшей мере 9 аминокислотных остатков пептида состоят из последовательностей, показанных в перечне последовательностей как SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20 или SEQ ID NO: 23.
2. Выделенный пептид по п.1, отличающийся тем, что пептид связывается с подтипами АЧЛ DR1, DR4 и DR7.
3. Выделенный пептид по п.1 или 2, отличающийся тем, что аминокислотная последовательность выбрана из аминокислотной последовательности из белка теплового шока человека или бактериального белка теплового шока.
4. Выделенный пептид по п.3, отличающийся тем, что бактериальный белок теплового шока представляет собой белок теплового шока микобактерий.
5. Выделенный пептид по любому из пп.1-4, отличающийся тем, что пептид имеет степень идентичности не менее 70% с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы, включающей последовательности SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.
6. Выделенный пептид по любому из пп.1-5, отличающийся тем, что пептид имеет степень идентичности не менее 80% с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы, включающей последовательности SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.
7. Выделенный пептид по любому из пп.1-6, отличающийся тем, что пептид имеет степень идентичности не менее 90% с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы, включающей последовательности SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.
8. Выделенный пептид по любому из пп.1-7, отличающийся тем, что пептид имеет степень идентичности не менее 95% с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы, включающей последовательности SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.
9. Выделенный пептид, характеризующийся тем, что пептид имеет аминокислотную последовательность, выбранную из группы, включающей последовательности SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.
10. Выделенный пептид по п.4, отличающийся тем, что белок теплового шока микобактерий представляет собой hsp60.
11. Выделенный пептид по п.3, отличающийся тем, что белок теплового шока человека представляет собой hsp60.
12. Выделенный пептид по любому из пп.1-4, отличающийся тем, что фрагмент имеет длину приблизительно от 15 до 25 аминокислот.
13. Выделенный пептид по любому из пп.1-4, отличающийся тем, что фрагмент имеет длину приблизительно от 15 до 20 аминокислот.
14. Выделенный пептид по любому из пп.1-13, отличающийся тем, что пептид имеет одну или более D-аминокислот.
15. Выделенный пептид по любому из пп.1-8 и 10-14, отличающийся тем, что содержит консервативное замещение аминокислот по меньшей мере в одной аминокислотной позиции в пептиде.
16. Выделенный пептид по любому из пп.1-15, отличающийся тем, что пептид ковалентно присоединён к адъюванту.
17. Выделенный пептид по п.16, отличающийся тем, что адъювант представляет собой гемоцианин входного отверстия улитки, бычий сывороточный альбумин, человеческий сывороточный альбумин или изологичный IgG.
18. Фармацевтическая композиция, содержащая пептид, как он определен в любом из пп.1-17, в фармацевтически приемлемом носителе.
19. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что она дополнительно содержит модификатор биологической реакции.
20. Композиция по п.19, отличающаяся тем, что модификатор биологической реакции выбран из цитокина, хемокина, гормона, стероида или интерлейкина.
21. Композиция по п.19, отличающаяся тем, что модификатор биологической реакции представляет собой интерферон.
22. Композиция по п.19, отличающаяся тем, что модификатор биологической реакции выбран из IL-1 (a или b), IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-11, IL-12, GM-CSF, M-CSF, G-CSF, LIF, LT, TGF-b, g-ИФН, TNF-a, BCGF, CD2 или ICAM.
23. Применение пептида, как он определен в любом из пп.1-17, в производстве медикамента для лечения или предотвращения опосредованного иммунитетом заболевания у индивидуума, нуждающегося в таком лечении.
24. Применение по п.23, отличающееся тем, что индивидуум является млекопитающим.
25. Применение по п.24, отличающееся тем, что млекопитающее является человеком.
26. Применение по любому из пп.23-25, отличающееся тем, что опосредованное иммунитетом заболевание представляет собой аутоиммунное заболевание.
27. Применение по любому из пп.23-25, отличающееся тем, что опосредованное иммунитетом заболевание выбрано из группы, состоящей из рассеянного склероза, ревматоидного артрита, красной волчанки, диабета I типа, склеродермии, миастении гравис и язвенного колита.
28. Применение по п.23, отличающееся тем, что опосредованное иммунитетом заболевание представляет собой рак.
29.Применение по п.28, отличающееся тем, что рак выбран из группы, состоящей из меланомы, лейкемии, лимфомы, плотных опухолей лёгких, печени, почки, мозга, мочевого пузыря, ретинобластомы, саркомы и рака соединительной ткани.
30. Применение по п.23, отличающееся тем, что опосредованное иммунитетом заболевание представляет собой инфекционное заболевание.
31. Применение по любому из пп.23-30, отличающееся тем, что выделенный пептид имеет последовательность, выбранную из группы, включающей SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 или SEQ ID NO: 9.
32. Применение эффективного количества связывающегося с подтипами DR антигена человеческих лейкоцитов (АЧЛ) выделенного пептида, содержащего фрагмент стрессового белка, который связывается с одной или более молекулами II класса главной системы тканевой совместимости, в производстве медикамента для модуляции иммунного ответа.
33. Применение по п.32, отличающееся тем, что пептид связывается с подтипами АЧЛ DR1, DR4 и DR7.
34. Применение по п.32 или 33, отличающееся тем, что индивидуум является млекопитающим.
35. Применение по п.34, отличающееся тем, что млекопитающее является человеком.
36. Применение по любому из пп.32-35, отличающееся тем, что иммунный ответ связан с опосредованным иммунитетом заболеванием, выбранным из группы, состоящей из рассеянного склероза, ревматоидного артрита, красной волчанки, диабета I типа, склеродермии, миастении гравис и язвенного колита.
37. Применение по любому из пп.32-35, отличающееся тем, что иммунный ответ связан с инфекционным заболеванием.
38. Применение по любому из пп.32-35, отличающееся тем, что иммунный ответ связан с опосредованным иммунитетом раковым заболеванием, выбранным из группы, состоящей из меланомы, лейкемии, лимфомы, плотных опухолей лёгких, печени, почки, мозга и мочевого пузыря, ретинобластомы, саркомы и рака соединительной ткани.
39. Применение по любому из пп.32-38, отличающееся тем, что выделенный пептид имеет последовательность, выбранную из группы, включающей SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 или SEQ ID NO: 9.
40. Выделенный пептид по п.1, отличающийся тем, что аминокислотная последовательность представляет собой аминокислотную последовательность из белка теплового шока млекопитающего.
41. Выделенный пептид по любому из пп.1-17, отличающийся тем, что пептид получен путем химического синтеза.
42. Выделенный пептид по любому из пп.1-17, отличающийся тем, что пептид получен путем рекомбинантной экспрессии.
43. Выделенный пептид по любому из пп.1-17, отличающийся тем, что пептид гликозилирован.
44. Композиция по любому из пп.18-22, отличающаяся тем, что пептид содержится в жидкой композиции.
45. Композиция по любому из пп.18-22, отличающаяся тем, что пептид содержится в твердой композиции.
46. Выделенный пептид, характеризующийся тем, что аминокислотная последовательность пептида состоит из аминокислотной последовательности, выбранной из группы, включающей SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 или SEQ ID NO: 6.
47. Композицшя, характеризующаяся тем, что она включает фармацевтически приемлемый носитель и выделенный пептид, как он определен в п.46.
Текст
006650 Область техники Настоящее изобретение относится к новым пептидам, связанным со стрессом, и способам их применения. В частности предлагаются пептидные последовательности белков теплового шока (БТШ), пригодные для модуляции воспалительных реакций при опосредованных иммунитетом заболеваниях, распространяющихся от аутоиммунных заболеваний до рака и до инфекционных заболеваний. Предшествующий уровень техники Млекопитающие обладают способностью формировать иммунный ответ как защитную реакцию против патогенов окружающей среды, а также против аберрантных клеток - таких, как опухолевые клетки, развивающихся внутри организма. Эта реакция может принимать форму врожднного иммунитета, в котором участвуют клетки - природные убийцы ("natural killer" - NK), нейтрофилы и клетки родословной моноцит/макрофаг, или же форму приобретенного или активного иммунитета против специфических антигенов, опосредованную лимфоцитами. Активные иммунные реакции могут быть далее подразделены на две ветви: гуморальную реакцию, которая влечт за собой продукцию специфических антител, предназначенных для нейтрализации циркулирующих в организме антигенов и помогающих захвату их специализированными клетками фагоцитов, и клеточную ветвь, которая необходима для распознавания внутри организма инфицированных или аберрантных клеток. Часто эти иммунные реакции проявляются в заболеваниях и недомоганиях, представляющих опасность для самого организма. Такие нарушения связаны с распознаванием собственных белков и клеток как чужеродных, и вследствие этого начинается атака на такие клетки или клеточные белки. Распространнные аутоиммунные заболевания включают,например, псориаз, артрит, волчанку, диабет и иные заболевания, известные в данной области. Один из наиболее вероятных сценариев развития патогенеза аутоиммунного заболевания, подобного диабету 1-го типа, может начинаться с патологической регуляции аутореактивных Т-клеток - либо путм активации соседними клетками, либо вследствие молекулярной мимикрии. Например, вирусная инфекция или контакт с супер-антигеном может привести к достаточной костимуляции, результатом которой будет активация немногих низкоаффинных аутореактивных Т-клеток, спасшихся после селекции в тимусе. Патологическая подавительная регуляция таких аутореактивных ответов может приводить к распространению патогенных Т-клеток, просачивающихся в тот орган, где имеется распознаваемый антиген. Переходу от непатогенной аутореактивности к аутоиммунному заболеванию способствуют несколько зависящих от хозяина факторов: размытая центральная негативная селекция, обеспечивающая спасение большего числа аутореактивных предшественников; усиленная периферическая толерантность вследствие ненормальностей, затрагивающих рецепторы или лиганды, которые посредничают в подавительной регуляции активности лимфоцитов, смещение в сторону генерации провоспалительных реакций ТН 1 в противоположность более сбалансированным реакциям ТН 1/ТГН 2; высокая частота и ненормальная активность специализированных антиген-предъявляющих клеток (АПК). Локальное воспаление и прямое разрушение клеток хозяина запускают высвобождение антигена, его захват специализированными АПК и предъявление специфическим Т-клеткам, что закрепляет позитивный контроль с обратной связью, обостряющий аутоиммунность. Одновременно на фоне активации специализированных антигенпредъявляющих клеток и высвобождения антигена могут становиться экспонируемыми связанные с органами антигены, в норме скрытые. Это приводит к активации Т-клеток, специфичных к этим другим собственным антигенам. Реализация дополнительной специфичности может ускорять развитие болезни,особенно в условиях, способствующих общей разбалансировке ТН 1/ТН 2. Широко распространено мнение о том, что в то время как цитокины ТН 1, подобные интерферону- (ИФН-), дают вклад в патогенез аутоиммунности, цитокины ТН 2, подобные интерлейкинам IL-4 и IL-10, могут подавлять активность патогенных клеток ТН 1 или Тс 1. Белки теплового шока (БТШ) (heat shock proteins, hsp) являются высоко консервативными белками,играющими важную роль в различных клеточных процессах. БТШ являются стрессовыми белками(стресс-белками), образование которых при клеточном стрессе обычно активационно регулируется(upregulated). Кроме этого, было показано, что БТШ являются иммунодоминантными. Эти уникальные качества БТШ (эволюционная консервативность, иммунодоминантность и активационная регуляция при стрессе) сделали их привлекательными кандидатами в качестве центров внимания (мишеней) для иммунотерапии и вакцинации. Действительно, сейчас предполагают, что иммунореактивность к БТШ играет важную роль во многих заболеваниях, начиная от рака и до инфекционных заболеваний и аутоиммунных заболеваний. Наиболее веское свидетельство роли БТШ в иммунной регуляции воспалительных заболеваний было получено на моделях хронического артрита. Это исследование показало, что иммунизация белками теплового шока hsp10, hsp60 и hsp70 может во всех случаях создать защиту фактически во всех моделях экспериментального артрита. В модели адъювантного артрита иммунореактивность к БТШ играет роль как в индукции болезни, так и в защите от болезни. С одной стороны, было показано, что адъювантный артрит может быть индуцирован с помощью клона Т-клеток, носящего название А 2b и специфичного к участку 180-188 белка hsp60 микобактерий. С другой стороны, более поздние исследования показали, что предварительная иммунизация белком hsp60 микобактерий может эффективно предотвращать индукцию болезни. Однако было обнаружено, что после иммунизации hsp60 некоторые эпитопы распознаются иммунной системой. Интересно, что только один эпитоп (участок 256-270 hsp60 микобак-1 006650 терий) из восьми способен индуцировать защиту. Эта защита основывалась на индукции Т-клеток, перекрстно реактивных по отношению к собственным БТШ (self-hsp). Так на основании данных, полученных на животной модели адъювантного артрита, возникло представление о важной роли иммунореактивности к БТШ в регуляции артрита - как в защите, так и в индукции болезни. Тот факт, что различные эпитопы дают совершенно противоположные эффекты, подчеркнул важность различения пептидных эпитопов Т-клетками также и в человеческой системе. За последние 10 лет стало ясно, что иммунореактивность к БТШ играет также решающую роль в хроническом артрите человека, а именно в юношеском идиопатическом артрите (ЮИА) и ревматоидном артрите (РА). Во-первых, в синовиальных выстилающих клетках индивидуумов с ЮИА и РА была обнаружена повышенная экспрессия hsp60. Во-вторых, при обоих заболеваниях была обнаружена реактивность Т-клеток по отношению к собственному и несобственному hsp60. Подобным же образом у индивидуумов с ЮИА и РА была зафиксирована иммунореактивность по отношению к другим БТШ -таким, какhsp70 и DnaJ. У детей с ЮИА иммунореактивность по отношению к собственному hsp60 является, повидимому, предсказующим фактором для успешного прогноза. Поэтому при заболеваниях, опосредованных иммунитетом, простирающихся от аутоиммунитета до рака и до инфекционных заболеваний, необходима модуляция воспалительных реакций. Сущность изобретения Настоящее изобретение позволяет преодолеть большое число проблем в данной области, обеспечивая существенно чистые связывающиеся с подтипами DR антигена человеческих лейкоцитов (АЧЛ) (human leukocyte antigen, HLA) пептиды, содержащие фрагмент стрессового белка, связывающийся с молекулами II класса главной системы тканевой совместимости (ГСТС). В одном из вариантов осуществления изобретение предлагает способы лечения или предотвращения опосредованного иммунитетом заболевания у индивидуума, имеющего заболевание или имеющего риск заболевания, включающие введение индивидууму эффективного количества существенно чистого пептида, содержащего в фармацевтически приемлемом носителе фрагмент стрессового белка, связывающийся с одной или более молекулами II класса ГСТС, причм пептид модулирует иммунный ответ,что приводит к лечению или предотвращению заболевания. В другом варианте осуществления настоящее изобретение предусматривает фармацевтическую композицию, содержащую в фармацевтически приемлемом носителе один или несколько пептидов, связывающихся с подтипами DR АЧЛ (HLA pan DR-binding peptides). Ещ в одном варианте осуществления настоящее изобретение предусматривает выделенные последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующие связывающиеся со всеми областями DR АЧЛ пептиды по настоящему изобретению. Ещ в одном варианте осуществления настоящее изобретение предусматривает способы индукции иммунного ответа у индивидуума, включающие введение пациенту эффективного количества существенно чистого связывающегося с подтипами DR АЧЛ пептида, содержащего фрагмент стрессового белка, связывающийся с молекулами II класса ГСТС. Краткое описание графических материалов На фиг. 1 представлена пролиферативная реакция Т-клеток на связывающиеся с подтипами DR АЧЛ пептиды hsp60 в клетках от 80 индивидуумов с юношеским идиопатическим артритом. По оси Y представлен индекс стимуляции (S), определяемый как результат деления среднего числа отсчтов в минуту в ячейках с клетками, культивируемыми с антигенами, на среднее число отсчтов в минуту в ячейках с клетками, культивируемыми только с питательной средой. По оси X приведены различные антигены, испытанные в данном анализе (слева направо): полный hsp60 микобактерий (Mhsp), полный hsp60 человека (Hhsp60), p1 (myc 254-268), р 2 (hum 280-294), р 3 (myc 216-230), р 4 (hum 242-256), р 5 (myc 210224), р 6 (hum 236-250), р 7 (myc 503-507) и р 8 (hum 535-546). На фиг. 2 представлена специфичная по отношению к антигену продукция IL-10 при культивировании клеток in vitro с пептидами hsp60, связывающимися с подтипами DR. По оси Y представлена продукция IL-10 (в пг/мл) в ответ на различные пептиды. На оси X представлены различные антигены, использованные в этом исследовании (слева направо): полный hsp60 микобактерий (М hsp), полный hsp60 человека (Н hsp), антиген столбняка (тетанус) и различные связывающиеся с pan DR пептиды р 1-р 8 [р 1(myc 254-268), р 2 (hum 280-294), р 3 (myc 216-230), р 4 (hum 242-256), р 5 (myc 210-224), р 6 (hum 236-250),р 7 (myc 503-507) и р 8 (hum 535-546)]. На фиг. 3 представлена антиген-специфическая продукция интерферона- (ИФН-) при культивировании клеток in vitro с пептидами hsp60, связывающимися с подтипами DR. По оси Y представлена продукция интерферона- (в пг/мл) в ответ на различные пептиды. На оси X представлены различные антигены, использованные в этом исследовании (слева направо): полный hsp60 микобактерий (М hsp), полный hsp60 человека (Н hsp), антиген столбняка (тетанус) и различные связывающиеся с участками DR пептиды (р 1-р 8). Пептид 256-270 hsp60 микобактерий, использованный в качестве негативного контроля,не индуцировал никакой продукции цитокина. На фиг. 4 показана антиген-специфическая продукция фактора некроза опухолей TNF- при культивировании клеток in vitro с пептидами hsp60, связывающимися с подтипами DR. По оси Y представлена продукция фактора некроза опухоли TNF- (в пг/мл) в ответ на различные пептиды. На оси X представлены различные антигены, использованные в этом исследовании: полный hsp60 микобактерий (Мhsp), полный hsp60 человека (Н hsp), антиген столбняка (тетанус) и различные связывающиеся с участками DR пептиды (р 1-р 8). Пептид 256-270 hsp60 микобактерий, использованный в качестве негативного контроля, не индуцировал никакой продукции цитокина. Фиг. 5 показывает иммунологическое распознавание (определяемое по пролиферации Т-клеток и/или продукции цитокинов) в ответ на пептиды hsr60 по настоящему изобретению в клетках от 18 индивидуумов с ЮИА. На фиг. 6 представлены результаты сравнения иммунологической реактивности, индуцированной пептидом 256-270 и двумя пептидами по настоящему изобретению, основанными на связывании с подтипами DR (p1 - myc 254-268; и р 2 - hum 280-294). На правой оси Y указан индекс стимуляции, а на левой оси Y указана продукция цитокинов в пг/мл. На фиг. 7 А-7 Е представлена серия графиков, показывающих индуцированную обработкой модуляцию реакции Т-клеток на dnaJP1. На фиг. 7 А показаны пролиферативные реакции Т-клеток: одноядерные клетки периферической крови (ОКПК) от пациентов (n = 7) стимулировали в течение 5 дней 10 мкг пептида dnaJP1. Оценку проводили с месячным интервалом. В контролях использовали фитогемагглютинин(ФГА) как стандартный митоген и dnaJpV. На фиг. 7 В-7 Е приведены результаты оценки методом FACS с месячным интервалом продукции внутриклеточного цитокина (стимулирующего воспаление - фиг. 7B7D; толерогенного - фиг. 7 Е) клетками ОКПК пациентов, которые при предварительном отборе (скрининге) были восприимчивы к пептиду dnaJPl. Фиг. 7 В: IL-2, n = 6; фиг. 7 С: ИФН-, n = 8; фиг. 7D: TNF-,n = 6; фиг. 7 Е: IL-4 и IL-10, n = 4. Результаты выражены отношением процентного содержания клетокCD3+ в культурах, стимулированных и нестимулированных dnaJP1 (звздочкойотмечены результаты с р 0,05). Фиг. 8 А представляет график, показывающий результаты анкетирования RADAR индивидуумов,которым вводили пептид dnaJ (звздочкойотмечены результаты с р 0,05). Фиг. 8 В-8 Е представляют графики, показывающие подсчт болезненных и распухших суставов (n = 13) у индивидуумов, которым вводили пептид dnaJ. На фиг. 8 В представлено число болезненных суставов; на фиг. 8 С представлено число распухших суставов. Измерения проводили с месячным интервалом(звздочкойотмечены результаты с р 0,05). Сведения, подтверждающие возможность осуществления изобретения Настоящее изобретение предусматривает новые пептидные последовательности, которые модулируют способность Т-клеток к реагированию вследствие разнообразного связывания и предъявления пептидов различным молекулам главной системы тканевой совместимости (ГСТС). В одном из вариантов осуществления повышенное предъявление пептидов по настоящему изобретению приводит к повышенной предпочтительности иммунологического распознавания, и поэтому такие пептиды являются идеальными кандидатами для молекул, которые модулируют иммунный ответ. Такими молекулами могут быть,например, вакцины и модуляторы воспалительных реакций, при действии которых иммунный ответ подавительно регулируется, а также лекарства против рака и инфекционных заболеваний, которые дают активационную регуляцию иммунного ответа для повышения способности организма бороться с аберрантными клетками. Противоречивая роль различных эпитопов hsp60 микобактерий делает настоятельно необходимым определение пептидных эпитопов hsp60 для Т-клеток у индивидуумов с ЮИА и РА. На основании данных, накопленных на животных моделях, делались различные попытки идентифицировать эпитопы для Т-клеток у индивидуумов с ЮИА. Однако предсказания потенциальных эпитопов на основании данных,полученных на модели адъювантного артрита, оказались неэффективными для идентификации эпитопов для Т-клеток у человека. В особенности в случае ЮИА, фон гетерогенных АЧЛ у субъектов с ЮИА препятствует предсказанию потенциальных эпитопов для Т-клеток у hsp60. Это делает невозможным прогнозирование, основанное на тестах связывания с молекулами ГСТС, и ничего не стоящим прогнозирование, основанное на теоретическом определении оптимального связывания с DR4. Настоящее изобретение идентифицирует смешанные эпитопы для специфичных к подтипам DR Тклеток. Эти пептиды соответствуют различным молекулам ГСТС, в особенности молекулам II класса ГСТС, и поэтому распознаются Т-клетками у подавляющего большинства индивидуумов. Для идентификации пептидов для связывания с различными подтипами DR была применена компьютерная программа,описанная в патенте США 6037135 (включнном в настоящее описание во всей полноте ссылкой),которая идентифицирует структурные лейтмотивы связывания пептидов с различными молекулами II класса ГСТС. Были сканированы последовательности и микобактериального, и человеческого hsp60 и сконструированы пептиды на основании предсказываемого связывания пептидных последовательностей с тремя подтипами DR АЧЛ - а именно DR1, DR4 и DR7 (таблица 1). Пептиды селектировали по уровню предсказываемого связывания с DR1, DR4 и DR7. Пептиды по настоящему изобретению, в том числе-3 006650 перечисленные в табл. 1, идентифицировали в тестах in vitro как обладающие способностью индуцировать пролиферацию аутореактивных Т-клеток или индуцировать секрецию цитокинов (например, лимфокинов) из этих Т-клеток, или индуцировать другие эффекторные функции - как, например, цитотоксичность. Как обсуждалось выше, БТШ являются мишенями для иммунной системы при опосредованном иммунитетом хроническом воспалении. Более конкретно, иммуномодуляция с применением БТШ, основанная на данных экспериментальных моделей, может предоставить новый способ терапии диабета, воспалительных заболеваний пищеварительного тракта, артрита и заболеваний, связанных с трансплантацией. Настоящее изобретение предусматривает пептиды и способы применения новых пептидов для модуляции, блокирования или ингибирования воспалительных реакций. Пептиды и способы полезны для первичного отбора (скрининга) пептидов или пептидных аналогов, которые модулируют (например, либо подавительно регулируют или активационно регулируют, либо сдвигают соотношение продуцируемых молекул ТН 1:ТН 2) патогенный иммунный ответ; для контролирования эффективности или терапевтического использования; и для идентификации других агентов, которые могут быть эффективны в подавительном регулировании или ингибировании иммунного ответа при лечении таких хронических воспалительных состояний. БТШ являются также мишенями для иммунной системы при опосредуемых иммунитетом раковых заболеваниях и патогенных инфекциях. В этой ситуации модуляция иммунитета с помощью БТШ, основывающаяся на экспериментальных моделях, может предоставить новые способы терапии для таких раковых состояний, как меланома, лейкемия, лимфома, плотные опухоли (лгкие, печень, почки, мозг, мочевой пузырь), ретинобластома, саркомы и другие опухоли соединительной ткани, и т.п. Опосредованные иммунитетом патогенные инфекции, которые можно лечить с помощью связывающихся с АЧЛ DR пептидов, включают такие опосредованные иммунитетом микробные инфекции, как туберкулз, проказа,бактериальные инфекции грамположительными и грамотрицательными микроорганизмами, ВИЧ/СПИД,инфекции вирусом Эпштейна-Барр и цитомегаловирусом, и протозойные инфекции как, например,лейшманиоз и подобные им. Настоящее изобретение предусматривает пептиды и способы применения новых пептидов для активационной регуляции иммунного ответа организма таким образом, чтобы модулировать, блокировать или ингибировать предраковые или раковые состояния и микробные инфекции. Пептиды и способы пригодны для скрининга пептидов или пептидных аналогов, которые активационно регулируют иммунный ответ организма таким образом, чтобы противодействовать развитию ракового состояния или микробной инфекции; для контролирования эффективности терапевтического применения таких пептидов; и для идентификации других агентов, которые могут быть эффективными в активационной регуляции или в модуляции иммунного ответа при лечении таких опосредованных иммунитетом предраковых или раковых состояний и микробных инфекций. Существенно чистые связывающиеся с АЧЛ DR пептиды (HLA pan DR-binding peptides) по настоящему изобретению содержат фрагмент стрессового белка (называемого также стресс-белком), который связывается с молекулой II класса ГСТС - например, АЧЛ DR1, DR4 и DR7. Связывающиеся с подтипами DR АЧЛ пептиды по настоящему изобретению могут быть получены, например, из белков теплового шока микобактерий (М hsp60) и белков теплового шока человека (Н hsp60). Позвоночные обладают способностью формировать иммунный ответ как защитную реакцию против патогенов окружающей среды, а также против аберрантных клеток - таких как раковые клетки, которые развиваются внутри организма. Эта реакция может принимать форму врожднного иммунитета, опосредованного клетками - природными убийцами ("natural killer" - NK), нейтрофилами и клетками родословной моноцит/макрофаг, или же форму приобретенного или активного иммунитета против специфических антигенов, опосредованную лимфоцитами. Активные иммунные реакции могут быть далее подразделены на две ветви: гуморальную реакцию, которая влечт за собой продукцию специфических антител, предназначенных для нейтрализации циркулирующих в организме антигенов и помогающих захвату их специализированными клетками фагоцитов, и клеточную ветвь, которая необходима для распознавания внутри организма инфицированных или аберрантных клеток. В обоих случаях специфический ответ регулируется внутриклеточным преобразованием (процессинг) и распознаванием антигена эффекторными Т-клетками. Зрелые цитолитические Т-лимфоциты(ЦТЛ) или Т-клетки помощники (Тп) (называемые также Т-клетки-хелперы) остаются в покоящемся состоянии до тех пор, пока они не встретятся с антигенами, которые могут распознать их рецепторы в связи с молекулами I или II класса ГСТС. При встрече со специфическими антигенами Т-клетки пролиферируют и выполняют эффекторные функции, результатом которых является удаление реагирующих антигенов. Если антиген преобразуется (процессинг) по цитоплазматическому пути, получающиеся пептиды связываются с вновь синтезированными молекулами I класса ГСТС, которые содействуют соответствующему предъявлению их эффекторным Т-клеткам. Предъявление антигена молекулами I класса ГСТС благоприятствует его распознаванию цитотоксическими Т-лимфоцитами, несущими лиганд CD8. Напротив, внутриклеточный процессинг путм эндоцитоза приводит к предъявлению на молекулах II класса-4 006650 ГСТС, и этот тип процессинга способствует реакции Т-клеток помощников, участвующих в стимуляции гуморальной ветви. Задача вакцинации состоит в запуске обеих реакций и формировании запоминающих Т-клеток, так что иммунная система становится подготовленной к реагированию на патогенную инфекцию. Активация Т-клеток влечт за собой продукцию набора химических сигналов (первичных цитокинов), что приводит к прямому действию или стимулирует другие клетки иммунной системы к действию. В случае активации антигеном с молекулами I класса ГСТС, ЦТЛ пролиферируют и действуют в направлении разрушения заражнных клеток, представляющих данный антиген. Гибель инфицированных клеток предотвращает размножение вируса и делает его восприимчивым к нейтрализующим антителам, что обеспечивает ликвидацию вируса. В противоположность этому, активация клеток Тп комплексами антигена с молекулами II класса ГСТС не приводит к разрушению предъявляющих антиген клеток (которые являются частью защитной системы организма), но скорее стимулирует клетки Тп к пролиферации и производству сигналов (опять же первичных цитокинов), действующих на различные клетки. Наряду с другими последствиями, передача сигналов приводит к стимуляции В-клеток, активации макрофагов,дифференциации ЦТЛ и развитию воспаления. Эта согласованная реакция относительно специфична и обычно нацелена на чужеродные элементы, содержащие пептиды, предъявляемые системой молекул II класса ГСТС. Если иммунная реакция развивается правильно, она поразительно эффективна в удалении микроскопических патогенов и, в меньшей степени, опухолевых клеток. Вообще говоря, сложные механизмы распознавания своего эффективны и обеспечивают направленность сильной реакции исключительно на чужеродные антигены. Регуляция различения свой/чужой, что является критической функцией иммунной системы, включает в течение развития и времени жизни Т- и В-лимфоцитов многие механизмы. Поскольку отсутствие в центральных лимфоидных органах реагирующих на свои антигены предшественников Т- и В-клеток приводит к удалению большинства аутореактивных клеток, считается, что периферические механизмы, для которых необходимы опосредованные Fas, IL-2R и CTLA-4 сигналы, являются решающими в поддержании иммунного гомеостаза. К сожалению, иммунная система иногда функционирует неправильно и обращается против собственных клеток хозяина, провоцируя таким образом аутоиммунную реакцию. Обычно аутоиммунность или аутореактивность возникает, если рецепторы антигенов на иммунных клетках распознают специфические свои антигены (например, собственные эпитопы) на клетках организма-хозяина и инициируют реакции, приводящие к разрушению хозяйских клеток. Во многих случаях аутоиммунным реакциям свойственно самоограничение в том смысле, что они прекращаются, когда исчезают провоцирующие их антигены. Однако в некоторых случаях аутореактивные лимфоциты выживают дольше, чем это необходимо, и продолжают индуцировать апоптоз или иным образом удаляют клетки хозяина. Примеры аутоиммунных расстройств или состояний включают рассеянный склероз (PC), ревматоидный артрит (имеющий, возможно, несколько механизмов), красную волчанку и диабет I типа. Благодаря последним достижениям в данной области, в особенности идентификации аллельспецифичных пептид-связывающих структурных лейтмотивов, ситуация здесь изменилась (Madden и др.,1991; Rotschke and Falk, 1991). Основываясь на этом, можно заново оценить структурный вклад связанной с ГСТС восприимчивости к аутоиммунным заболеваниям с такой степенью детальности, которая достаточна для разрешения давних вопросов в этой сфере. Структурные лейтмотивы связывания пептидов с определнными молекулами I и II класса ГСТС были определены путм анализа аминокислотных последовательностей пептидов, подвергшихся естественному процессингу, или с помощью мутационного анализа известных эпитопов. Было обнаружено, что связывающиеся с молекулами I класса ГСТС пептиды являются короткими (обычно 8-10 аминокислот) и имеют два доминантных аминокислотных остатка для якорного связывания с ГСТС; а связывающиеся с молекулами II класса ГСТС пептиды длиннее и более гетерогенны по размеру (Madden и др., 1991; Rotschke and Falk, 1991; Jardetsky и др., 1991; Chicz и др., 1993). Совсем недавно на основании кристаллической структуры AЧЛ-DR1 было установлено, что имеется доминантный гидрофобный якорный аминокислотный остаток вблизи N-конца пептида и что в некоторых других положениях в пептиде имеются вторичные якорные остатки (Brown и др., 1993). Белки теплового шока, которые входят в класс белков, известных как стрессовые белки, пригодные в практике применения настоящего изобретения, могут быть отобраны среди белков, входящих в число белков, которые удовлетворяют одному из следующих критериев. Белок теплового шока (БТШ) характеризуется тем, что его внутриклеточная концентрация повышается, когда на клетку действуют стрессовые раздражители; что он способен связывать другие белки или пептиды; что он способен высвобождать связанные белки или пептиды в присутствии аденозин-трифосфата (АТФ) или при низких рН; или тем, что он имеет не менее 35% гомологии с любым клеточным белком, имеющим любое из перечисленных выше свойств. К настоящему времени идентифицированы 3 основных семейства БТШ, различающихся молекулярным весом. Эти семейства были названы hsp60, hsp70 и hsp90, где числа соответствуют среднему молекулярному весу стрессовых белков в тысячах Дальтон (кДа). Белки hsp90 и др 96 млекопитающих оба являются членами семейства hsp90. Было затем обнаружено, что многие члены этих семейств индуциру-5 006650 ются в ответ на другие стрессовые раздражители, в том числе (но не ограничиваясь ими) на недостаток питания, метаболический распад, кислородные радикалы и заражение внутриклеточными патогенами// Annu. Rev. Genetics. 1988. Т. 22. С. 631-677; выводы этих работ включены в настоящее описание ссылкой на них). Ожидается, что БТШ/стрессовые белки, принадлежащие ко всем из этих трх семейств, могут быть применены в практике осуществления настоящего изобретения. В предпочтительном варианте осуществления для получения пептидов по настоящему изобретению используется белок hsp60 и белковая последовательность. Белки hsp60 при нормальных температурах имеются в изобилии в большинстве(но не во всех) клеток млекопитающих и дополнительно индуцируются нагреванием (Lai и др. // Mol.Cell. Biol. 1984. Т. 4. С. 2802-2810; van Bergen en Henegouven и др. // Genes Dev. 1987. Т. I. С. 525-531). Белки теплового шока являются белками с высокой степенью консервативности. Например, в семействах hsp60 и hsp90 обнаружена высокая степень внутрисемейственной консервативности. Кроме того, было установлено, что семейства hsp60, hsp70 и hsp90 состоят из белков, родственным белкам теплового шока по аминокислотной последовательности - например, они имеют степень аминокислотной идентичности выше 35%, однако, стресс не влияет на уровень их экспрессии. Поэтому ожидается, что определение стрессового белка, как оно использовано здесь, охватывает другие белки, мутантные белки,их аналоги и варианты, имеющие степень аминокислотной идентичности не менее, чем от 35 до 55%,предпочтительно от 55 до 75% и наиболее предпочтительно от 75 до 85% с белками - членами трх семейств, уровни экспрессии которых в клетке повышаются в ответ на стрессовое раздражение (см. патент США 5961979, который включн в настоящее описание ссылкой во всей своей полноте). Очистка стрессовых белков, принадлежащих к этим трм семействам, описана ниже. В одном из вариантов осуществления БТШ, использованный в соответствии с настоящим изобретением, представляет собой БТШ млекопитающего. В другом варианте осуществления БТШ, использованный в соответствии с настоящим изобретением для лечения аутоиммунного заболевания, является членом семейства hsp60. Белок теплового шока с молекулярным весом 60 кДа (hsp60) является стрессовым белком, который способен экспрессироваться во всех клетках организма. Однако у здоровых индивидуумов с высокой вероятностью появляются аутоиммунные Т-клетки, специфичные для своих эпитопов hsp60. Было установлено, что у здоровых мышей и людей имеются Т-клетки, нацеленные на их собственный антигенhsp60 (Kaufmann, 1990; Kaufmann и др., 1994; Young, 1989; Cohen, 1992b). Однако эти аутоиммунные Тклетки участвуют также в развитии опосредованных Т-клетками аутоиммунных заболеваний: высокая концентрация Т-клеток, нацеленных на собственный антиген hsp60, была обнаружена в аутоиммунных поражениях при хроническом артрите человека (Cohen, 1991; Res и др., 1989; van Eden и др., 1989), рассеянном склерозе (Selmaj и др., 1991), экспериментальном аутоиммунном энцефаломиелите (Selmaj и др.,1991) и адъювантном артрите (Hogervorst и др., 1992). Было также показано, что Т-клетки против hsp60 играют роль в диабетическом воспалении в модели не страдающих ожирением диабетических мышейCohen, 1991). Связывающиеся с подтипами DR АЧЛ пептиды по настоящему изобретению имеют аминокислотную последовательность, сохраняющуюся (консервативную) в соответствующих белках теплового шока при переходе от человека к другим, низшим организмам, в особенности они близки у белков теплового шока человека и бактерий или человека и микобактерий - у таких, как соответственно hsp60 и dnaJ. Термин выделенный или очищенный означает преобразованный, измененный руками человека из его естественного состояния; то есть, если это имеется в природе, это может быть изменено или удалено из его исходного окружения, или же и то, и другое. Например, имеющийся в природе полинуклеотид или полипептид, естественно наличествующий у живого животного в его природном состоянии,не является выделенным или очищенным, но тот же самый полинуклеотид или полипептид, отделнный от сосуществующих в его природном состоянии веществ, является выделенным или очищенным в том смысле, как этот термин применн здесь. Существенно чистый пептид является, вообще говоря, чистым, если он по меньшей мере на 60% по весу освобождн от белков и имеющихся в естественном состоянии органических молекул, с которыми он в естественном состоянии ассоциирован. Предпочтительно, чтобы препарат был очищен не менее,чем на 75%, более предпочтительно - не менее, чем на 90%, и наиболее предпочтительно - не менее, чем на 99% по весу, и имел последовательность, которая являются фрагментом последовательности, которая обозначена как SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 13 (например, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4,SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10). Существенно чистый пептид hsp60 настоящего изобретения может быть получен, например, экстракцией из природного источника, экспрессией рекомбинантной нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид полной длины (например, с последовательностью SEQ ID NO: 1 или с последовательностью SEQ ID NO: 13) с последующим расщеплением протеазой; экспрессией рекомбинантной нуклеиновой кислоты, кодирующей фрагмент последовательности SEQ ID NO: 1 или последовательности SEQ ID NO: 13 (например, SEQ IDNO: 9, SEQ ID NO: 10); или химическим синтезом пептидов согласно настоящему изобретению. Степень чистоты может быть измерена любым подходящим методом - например, с помощью колоночной хроматографии, электрофореза в полиакриламидном геле или высокоэффективной жидкостной хроматографии(ВЭЖХ). Пептиды белка теплового шока с молекулярным весом 60 кДа (hsp60) по настоящему изобретению включают фрагменты последовательности, обозначенной как SEQ ID NO: 1. Примеры фрагментов по настоящему изобретению (например, пептидов) белка теплового шока hsp60 включают пептиды, имеющие последовательности, приведнные в табл. 1 (Р 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 и 8 являются соответственно последовательностями SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7,SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9). Пептиды белка теплового шока dnaJ настоящего изобретения включают фрагменты последовательности, обозначенной как SEQ ID NO: 14, - такие, как пептиды, имеющие SEQID NO: 10. Такие пептиды или полипептиды настоящего изобретения могут быть существенно очищены. Термины полипептид, пептид или белок относятся к полимеру, в котором мономеры являются остатками аминокислот, соединнными друг с другом амидными связями. Если аминокислотами являются альфа-аминокислоты, могут быть использованы либо оптический L-изомер, либо оптический Dизомер, причм типичными являются L-изомеры. Подразумевается, что пептиды по настоящему изобретению охватывают фрагмент последовательности SEQ ID NO: 1. Специфические примеры фрагментов последовательности SEQ ID NO: 1 или последовательности SEQ ID NO: 13, охватываемые настоящим изобретением, включают последовательности, приведнные ниже как последовательности SEQ ID NO: 2,SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10, состоят из L- или D-аминокислот и включают модифицированные последовательности - такие, как гликопротеины. Соответственно, подразумевается, что пептиды по настоящему изобретению охватывают существующие в природе белки, а также белки, синтезированные рекомбинантным путм или являющиеся чисто синтетическими. Настоящим изобретением охватываются также пептиды,имеющие в основном такие же последовательности, как SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4,SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10, причем эти пептиды сохраняют функциональную активность той последовательности, которой они родственны. Имеющие в основном одну и ту же последовательность пептиды могут быть сконструированы на основе консервативных замещений аминокислот, при которых в соответствующей части сохраняется приблизительно 70-90%-ная гомология с исходным пептидом. Допускается ещ большая степень отклонения от гомологии, если консервативные замещения аминокислот подобиями аминокислот не воспринимаются как изменение последовательности. Длина пептидов составляет приблизительно 10-30 аминокислот; предпочтительно 15-25 аминокислот и более предпочтительно 15-20 аминокислот. Консервативная вариация означает замещение аминокислотного остатка другим, биологически подобным остатком. Примеры консервативных вариаций включают замещение одного гидрофобного остатка - такого, как изолейцин, валин, лейцин или метионин, другим гидрофобным остатком, или же замещение одного полярного остатка другим - например, такие как замещение аргинина лизином, глутаминовой кислоты аспарагиновой кислотой или глутамина аспарагином и т.п. Другие примеры, иллюстрирующие консервативные замещения, включают замены: аланина на серин; аргинина на лизин; аспарагина на глутамин или гистидин; аспартата на глутамат; цистеина на серин; глутамина на аспарагин; глутамата на аспартат; глицина на пролин; гистидина на аспарагин или глутамин; изолейцина на лейцин или валин; лейцина на валин или изолейцин; лизина на аргинин, глутамин или глутамат; метионина на лейцин или изолейцин; фенилаланина на тирозин, лейцин или метионин; серина на треонин; треонина на серин; триптофана на тирозин; тирозина на триптофан или фенилаланин; валина на изолейцин или лейцин. Термин консервативная вариация включает также использование замещнной аминокислоты вместо незамещнной исходной аминокислоты, при условии, что антитела, выработанные к замещнному полипептиду, являются также иммунореактивными по отношению к незамещнному полипептиду. Модификации и замещения не ограничиваются замещениями аминокислот. Для многих целей - таких, как повышение стабильности, растворимости или соображения конфигурации, специалист в данной области определит необходимость введения иных модификаций (путм удаления, замещения или добавления). Примеры таких иных модификаций включают введение редких аминокислот, декстрааминокислот, сайтов гликозилирования, цитозина для формирования специфического дисульфидного мостика. Модифицированные пептиды могут быть получены химическим синтезом или может быть осуществлена мутация в специфическом месте выделенного гена, или же синтетический ген может быть синтезирован и экспрессирован в бактериях, дрожжах, бакуловирусе, культуре ткани и т.д. В настоящем изобретении предполагается, что солями пептидов hsp60 по настоящему изобретению являются физиологически приемлемые органические и неорганические соли. Термин функциональные производные пептидов hsp60 в том смысле, как он использован в настоящем описании, охватывает производные, которые могут быть приготовлены известными в данной области способами с помощью функциональных групп, которые появляются как боковые группы аминокислотных остатков, или с помощью N- или С-концевых групп, и входят в настоящее изобретение по-7 006650 стольку, поскольку они остаются фармацевтически приемлемыми, то есть они не нарушают активность пептида, не привносят токсических свойств в содержащие их композиции и не влияют неблагоприятным образом на их антигенные свойства. Эти производные могут включать, например, алифатические эфиры карбонильных групп, полученные реакцией с аммиаком или с первичными или вторичными аминами амиды карбоксильных групп, Nацильные производные свободных аминогрупп аминокислотных остатков, полученные реакцией с ацильными частями молекул (например, алканоильными или карбоциклическими ароильными группами), или же О-ацильные производные свободных гидроксильных групп (например, указанных групп серильных или треонильных остатков), полученные реакцией с ацильными частями молекул. Для измерения степени гомологии или идентичности между известными и неизвестными последовательностями могут быть использованы алгоритмы секвенирования (определения и сравнения последовательностей мономеров). Такие методы и алгоритмы пригодны для идентификации соответствующих последовательностей,имеющихся в других организмах, а также для конструирования пептидов по настоящему изобретению. Степень гомологии или идентичности часто измеряют с помощью компьютерных программ анализа последовательностей (например, Sequence Analysis Software Package of the Genetics Computer Group, University of Wisconsin Biotechnology Center, 1710 University Avenue, Madison, WI 53705). Такая программа выстраивает подобные последовательности, приписывая степени гомологии различным делециям (выщеплениям), замещениям и другим модификациям. Термины гомология и идентичность в связи с двумя или несколькими нуклеиновыми кислотами, полипептидными или пептидными последовательностями относятся к двум или нескольким последовательностям или субпоследовательностям, которые являются одинаковыми или имеют определнный процент аминокислотных остатков или нуклеотидов, которые являются одинаковыми при их сравнении и параллельном сопоставлении для установления максимального соответствия в пределах окна сравнения или обозначенного участка, при этом степень гомологии и идентичности измеряются с использованием различных алгоритмов сопоставления последовательностей или же путм параллельного расположения последовательностей вручную и визуального обследования. Обычно для сравнения последовательностей одна из последовательностей принимается за референтную, с которой сопоставляют тестируемые последовательности. Если используется алгоритм сравнения последовательностей, тестируемые и референтную последовательности вводят в компьютер, при необходимости устанавливают координаты субпоследовательностей и вводят параметры программы алгоритма сравнения последовательностей. Можно использовать параметры несовпадений, или же можно задавать альтернативные параметры. Затем, на основании параметров программы, алгоритм сравнения последовательностей производит вычисление процента идентичности последовательностей для тестируемых последовательностей по отношению к референтной последовательности. Термин окно сравнения в том смысле, как он использован здесь, включает указание сегмента любого из наборов соседствующих позиций, выбранных из группы, состоящей из 8-10, 10-20, 20-600, обычно от приблизительно 50 до приблизительно 200, чаще от приблизительно 100 до приблизительно 150, в пределах которого последовательность может быть сопоставлена с референтной последовательностью такого же числа соседствующих позиций после того, как две последовательности оптимальным образом расположены параллельно. Методы параллельного расположения последовательностей хорошо известны в данной области. Оптимальное параллельное расположение последовательностей для сравнения может быть выполнено, например, с помощью алгоритма локальной гомологии (Smith and Waterman // Adv.Appl. Math. 1981. T. 2. С 482), алгоритма расположения по гомологиям (Niedleman and Wunsch // J. Mol.Biol. 1970. T. 48. С 443), метода поиска подобия (Lipman // Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA. 1988. T. 85. С 2444), с помощью компьютеризованного осуществления этих алгоритмов (GAP, BESTFIT, FASTA иDr., Madison, WT) или путм параллельного расположения последовательностей вручную и визуального обследования. Примерами полезных алгоритмов являются алгоритмы BLAST и BLAST 2.0, описанные соответственно в работах Altschul и др. // Nucleic Acids Res. 1977. Т. 25. С. 3389-3402 и Altschul и др. // J. Mol. Biol. 1990. Т. 215. С. 403-410. Программа для осуществления анализов с помощью BLAST предоставляетсяNational Center for Biotechnology Information (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/). Этот алгоритм включает первоначальную идентификацию пар нуклеотидов с высокой степенью регистрируемости (high scoring sequence pairs, HSP) по идентификации в исследуемой последовательности коротких слов длиной W, которые либо полностью соответствуют слову той же длины в последовательности из банка данных, либо удовлетворяют некоторому, имеющему положительную величину, пороговому значению отсчта Т. Величину Т называют порогом прочтения соседствующего слова (Altschul и др., см. выше). Эти исходные попадания на соседствующие слова служат отправными центрами для инициирования перебора с поиском содержащих их более длинных HSP. Найденные слова удлиняются в обоих направлениях вдоль каждой последовательности, пока не достигается увеличение значения кумулятивного параллельного подобия (cumulative alignment score). Кумулятивные значения вычисляются с использованием, для нуклеотидных последовательностей, параметров М (премиальное значение за пару соответствующих друг-8 006650 другу нуклеотидов, всегда больше нуля). Для аминокислотных последовательностей для расчта величины кумуляции используется счтная матрица. Удлинение слов в каждом из направлений прекращается,когда: кумулятивный отсчт параллельного соответствия падает на величину X ниже максимального достигнутого значения; кумулятивный отсчт падает до нуля и ниже вследствие появления одного или нескольких нуклеотидных сопоставлений, дающих отрицательный отсчт; или достигнут конец каждой последовательности. Параметры алгоритма BLAST W, Т и X определяют чувствительность и скорость параллельного выравнивания. Программа BLASTN (для нуклеотидных последовательностей) использует как предел несовпадения длину слова (W), равную 10, ожидание (Е), равное 10, М = 5, N = 4 и сопоставление обеих нитей. Для аминокислотных последовательностей программа BLASTP использует значения: предел по длине слова 3 и ожидание (Е) 10, а для счтной матрицы BLOSUM62 (см. Henikoff and(Е), равное 10, М = 5, N = 4 и сопоставление обеих нитей. Алгоритм BLAST производит также статистический анализ подобия между двумя последовательностями (см., например, Karlin and Altschul // Proc. Natl. Acad. USA. 1993. T. 90. С 5873). Одной из мер подобия, даваемой алгоритмом BLAST, является наименьшая суммарная вероятность (P(N, которая указывает вероятность, с которой совпадение между двумя нуклеотидными или аминокислотными последовательностями может являться случайным. Например, нуклеиновая кислота считается подобной по последовательности референтной последовательности, если при сравнении тестируемой нуклеиновой кислоты с референтной нуклеиновой кислотой наименьшая суммарная вероятность ниже, чем приблизительно 0,2, более предпочтительно ниже, чем приблизительно 0,01, и наиболее предпочтительно ниже,чем приблизительно 0,001. Кроме программы BLAST (Basic Local Alignment Search Tool, National Center for Biological Information), другие алгоритмы для определения степени гомологии или идентичности включают, например,ALIGN, AMAS (Analysis of Multiply Aligned Sequences), AMPS (Protein Multiple Sequence Alignment),ASSET (Aligned Segment Statistical Evaluation Tool), BANDS, BESTSCOR, BIOSCAN (Biological SequenceAlignment by Genetic Algorithm) и WHAT-IF. Такие программы выровненного расположения могут также использоваться для первичного просмотра (скрининга) геномных банков данных, чтобы идентифицировать полинуклеотидные последовательности, имеющие в основном идентичные последовательности. Имеется доступ к большому количеству геномных банков данных. Например, существенная часть генома человека доступна как часть проекта Human Genome Sequencing Project (J.Roach,http://weber.u.Washington.edu/roach/human genome progress2.html) (Gibbs, 1995). Уже был секвенирован по меньшей мере 21 из других геномов, в том числе, например, М. genitalium (Fraser и др., 1995), М. jannaschii (Bult и др., 1996), Н. influenzae (Fleischmann и др., 1995), Е. coll (Blattner и др., 1997), дрожжей (S.cerevisiae) (Mewes и др., 1997) и D. melanogaster (Adams и др., 2000). Значительный прогресс был достигнут также в секвенировании геномов таких служащих моделями организмов, как С. elegans, Arabidopsissp. и D. melanogaster. Некоторые банки данных, содержащие геномную информацию, сопровождаемую некоторой функциональной информацией, поддерживаются различными организациями и доступны через Интернет - например, http://www.tigr.org/tdb; http://www.genetics.wisc.edu: http://genomewww.stanford.edu/ball: http://hiv-web.lanl.gov: http://www.ncbi.nlm.nih.gov: http://www.ebi.ac.uk: http://Pasteur.fr/other/biology: и http://www.genome.wi.mit.edu. Кроме полипептидов согласно настоящему изобретению, данное изобретение охватывает также последовательности нуклеиновой кислоты (например, последовательности олигонуклеотида или полинуклеотида), кодирующей фрагменты последовательности SEQ ID NO: 1 или последовательности SEQ IDNO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10). Например, последовательности ДНК по настоящему изобретению можно получить несколькими способами. Например, последовательность нуклеиновой кислоты (например, ДНК или РНК) можно получить из последовательностей SEQ ID NO: 2,SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9,SEQ ID NO: 10 или SEQ ID NO: 12 с использованием вырожденности генетического кода и определить с помощью компьютерных алгоритмов и программ секвенирования. Существуют 20 природных аминокислот, большинству из которых соответствует более одного кодона. Поэтому все вырожденные нуклеотидные последовательности включаются в настоящее изобретение постольку, поскольку не происходит изменения функции аминокислотной последовательности пептида по настоящему изобретению, кодируемого последовательностью нуклеиновой кислоты.-9 006650 Полинуклеотид, олигонуклеотид или последовательность нуклеиновой кислоты относятся к полимерной форме нуклеотидов, и эти термины при использовании здесь взаимозаменяемы. Поэтому этот термин включает, например, рекомбинантную ДНК, которая внедрена в вектор, в автономно реплицирующуюся плазмиду или в вирус; или же в геномную ДНК прокариота или эукариота; или ДНК, которая существует как отдельная молекула (например, комплементарная ДНК, кДНК) независимо от других последовательностей. Нуклеотиды настоящего изобретения могут быть рибонуклеотидами, дезоксирибонуклеотидами или модифицированными формами любого нуклеотида. Кроме того, участвующая в продукции полипептидной цепи полинуклеотидная последовательность может содержать участки, предшествующие кодирующему участку или следующие за ним (лидер и последователь), а также, в зависимости от источника полинуклеотидной последовательности, внедрнные, разделяющие последовательности (интроны) между индивидуальными кодирующими сегментами (экзонами). Термин полинуклеотид(ы) вообще относится к любому полирибонуклеотиду или полидезоксирибонуклеотиду, который может быть немодифицированной РНК или ДНК, или модифицированной РНК или ДНК. Поэтому, например, термин полинуклеотиды, как он использован здесь, относится, наряду с прочим, к одно- и двунитевой ДНК; к ДНК, которая представляет собой смесь одно- и двунитевых участков; к одно- и двунитевой РНК; к РНК, которая представляет собой смесь одно- и двунитевых участков; к гибридным молекулам, содержащим ДНК и РНК, которые могут быть однонитевыми или, что более типично, двунитевыми или могут представлять собой смесь одно- и двунитевых участков. Кроме того, полинуклеотиды или последовательности нуклеиновой кислоты могут содержать одно или несколько модифицированных оснований. Так, ДНК или РНК со скелетными цепями, модифицированными для стабильности или с иными целями, являются полинуклеотидами в соответствии с тем,как этот термин здесь предложен. Более того, можно назвать для примера ДНК или РНК, содержащие необычные основания - такие, как гипоксантин, или модифицированные основания - такие, как меченые тритием основания, и они также являются полинуклеотидами в соответствии с тем, как этот термин здесь использован. Последовательность нуклеиновой кислоты (например, олигонуклеотид или полинуклеотид), кодирующая пептид согласно настоящему изобретению, включает комплементарные полинуклеотидные последовательности. Если последовательность представляет собой РНК, дезоксирибонуклеотиды A, G, С и Т заменяются соответственно на A, G, С и U. В изобретение включены также фрагменты (части) описанных выше последовательностей нуклеиновой кислоты, имеющие длину не менее 15 нуклеотидов, достаточную для обеспечения селективной гибридизации фрагментов с ДНК, кодирующей последовательность полипептида или пептида по настоящему изобретению. Термин селективная гибридизация в том смысле, как он использован здесь, относится к гибридизации при умеренно жестко заданных или с максимальной жесткостью заданных физиологических условиях, которая различает родственные нуклеотидные последовательности от неродственных (см., например, работу Maniatis и др. // Molecular Cloning. ALaboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y. 1989, включнную в настоящее описание ссылкой). В реакциях гибридизации нуклеиновых кислот условия, используемые для достижения заданного уровня точности, будут различными, в зависимости от природы подлежащих гибридизации нуклеиновых кислот. Например, при выборе условий гибридизации для гибридизующихся участков нуклеиновых кислот могут быть учтены длина, степень комплементарности, нуклеотидный состав (например, отношениеGC к AT) и тип нуклеиновой кислоты (например, РНК или ДНК). Дополнительно учитывается, иммобилизована ли одна из нуклеиновых кислот, например, на фильтре. Следующий пример показывает постепенное повышение жесткости условий: 2xSSC/0,1% SDS при температуре, близкой к комнатной (условия гибридизации); 0,2xSSC/0,1% SDS при температуре, близкой к комнатной (условия с малой жесткостью); 0,2xSSC/0,1% SDS при температуре около 42 С (умеренно жесткие условия) и 0,1xSSC при температуре около 68 С (высоко жесткие условия) (SSC -так называемый стандартный салин-цитрат, т. е. раствор 0,15 М хлористого натрия и 0,015 М цитрата натрия; SDS- додецилcульфат натрия). Промывку можно проводить с использованием только одного из этих условий- например, высоко жестких условий; или можно использовать все типы условий, например, в течение 10-15 мин каждое, в указанной выше последовательности, повторяя любой из перечисленных этапов или все этапы. Однако, как указывалось выше, оптимальные условия могут меняться, в зависимости от проводимой конкретной реакции гибридизации, и эти условия могут быть определены опытным путм. Процедуры скрининга, основанные на гибридизации нуклеиновых кислот, делают возможным выделение из любого организма последовательности любого гена, если имеется соответствующий зонд. Например, рассматривается возможность использования таких зондов для идентификации других гомологов в других организмах. При осуществлении этой задачи для скрининга геномных банков данных могут быть использованы алгоритмы выровненного расположения (как описано выше). В качестве альтернативы, олигонуклеотидные зонды, которые соответствуют части последовательности, кодирующей искомый белок, можно получать химическим синтезом. Для этого необходимо, чтобы были известны короткие, олигопептидные протяжнности аминокислотной последовательности (например, SEQ ID NO: 2,SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9- 10006650 или SEQ ID NO: 10). Последовательность ДНК, кодирующая белок, может быть выведена на основании генетического кода, однако, при этом следует принимать во внимание вырожденность кода. В настоящем изобретении последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующие SEQ ID NO: 2,SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10, могут быть внедрены в рекомбинантный экспрессирующий вектор. Термин рекомбинантный экспрессирующий вектор относится к плазмиде, вирусу или другому известному в данной области носителю, которые были преобразованы вставкой или введением последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6,SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10. Такие экспрессирующие векторы содержат промоторную последовательность, которая способствует эффективной транскрипции вставленной генетической последовательности. Обычно экспрессирующий вектор содержит начало репликации(origin), промотор, а также специфические гены, обеспечивающие фенотипическую селекцию трансформированной клетки (клеток). Пригодные для применения в настоящем изобретении векторы включают векторы, раскрытые в настоящем описании. Для конструирования экспрессирующих векторов, содержащих последовательности, кодирующие,например, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10 и соответствующие сигналы контроля транскрипции/трансляции, могут быть использованы методы, хорошо известные специалистам в данной области. Эти методы включают методику получения рекомбинантной ДНК in vitro, методики синтеза и методики рекомбинации/генетики in vivo (см., например, работу Maniatis и др. // Molecular Cloning. A LaboratoryManual. Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y. 1989). Можно осуществить генетическую конструкцию с целью получить дополнительные преимущества- такую, например, как добавление на С-конце или N-конце аминокислотных остатков, которые облегчат очистку путм удержания на колонке или при использовании антител. Все эти методики многообразны. Специалист в данной области сможет легко выбрать метод получения конкретной конструкции, исходя из практических соображений: размера необходимого пептида, доступности и стоимости исходных материалов и т.п. Все необходимые методики детально разработаны и хорошо известны в данной области(см., например, руководства Ausubel и др. // Current Protocols in Molecular Biology. 1987. Т. 1 и 2, с приложениями, и Maniatis и др. // Molecular Cloning. A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y. 1989). Известны и другие описанные технические примы, которые легко доступны специалисту в данной области. Можно создать последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют слитый (составной) белок и могут быть функционально (оперативно) связаны с последовательностями контроля экспрессии. Термин функционально связанные относится к расположению рядом друг с другом, когда описанные компоненты находятся во взаимоотношении, позволяющем им функционировать предназначенным образом. Например, кодирующая последовательность функционально связана с другой кодирующей последовательностью, когда РНК-полимераза транскрибирует две кодирующие последовательности в одну мРНК, которая затем транслируется в один полипептид, содержащий аминокислоты, которые ведут происхождение от обеих кодирующих последовательностей. Нет необходимости, чтобы кодирующие последовательности непосредственно соприкасались друг с другом, если экспрессированные последовательности в конце концов преобразуются (подвергаются процессингу) с образованием нужного продукта. Последовательность контроля экспрессии, функционально связанная с кодирующей последовательностью, связана с ней таким образом, что экспрессия кодирующей последовательности осуществляется при условиях, совместимых с экспрессией контрольных последовательностей, В том смысле, как он использован здесь, термин последовательности контроля экспрессии относится к последовательностям нуклеиновой кислоты, регулирующим экспрессию последовательности нуклеиновой кислоты, с которой они функционально связаны. Последовательности контроля экспрессии функционально связаны с последовательностью нуклеиновой кислоты, если последовательности контроля экспрессии контролируют и регулируют транскрипцию и, соответственно, трансляцию последовательности нуклеиновой кислоты. Таким образом, последовательности контроля экспрессии могут включать соответствующие промоторы, энхансеры, терминаторы транскрипции, стартовый кодон (то есть ATG) перед последовательностью нуклеиновой кислоты, кодирующей пептид или белок, сигналы сплайсинга для интронов, средства сохранения правильной рамки считывания данного гена, чтобы обеспечить правильную трансляцию мРНК, и стопкодоны. Подразумевается, что термин контрольные последовательности включает, как минимум, компоненты, присутствие которых может влиять на экспрессию, и может также включать дополнительные компоненты, присутствие которых полезно, - например, лидерные последовательности и партнрские последовательности для слияния. Последовательности контроля экспрессии могут включать промотор. Под промотором подразумевается минимальная последовательность, достаточная для включения транскрипции. В настоящее изобретение включены также промоторные элементы, достаточные для выполнения промотор-зависимой экспрессии генов, способной контролироваться или индуцироваться специфическими для типа клеток, ткане-специфическими внешними сигналами или агентами; такие элементы могут располагаться в 5'- или 3'-областях последовательности нуклеиновой кислоты. В исследованиеEnzymology. 1987. Т. 153. С. 516-544). Например, при клонировании в бактериальных системах могут быть использованы индуцибельные промоторы - такие, как pL бактериофага, plac, ptrp, ptac (гибридный промотор ptrp-lac) и подобные им. При клонировании в системах клеток млекопитающих могут быть использованы промоторы, происходящие из генома клеток млекопитающих (например, промотор металлотионеина) или из вирусов млекопитающих (например, длинный концевой повтор ретровируса; промотор поздних функций аденовируса; промотор гена белка 7,5 К вируса осповакцины). Для обеспечения транскрипции последовательностей нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению могут также использоваться промоторы, полученные с помощью методик рекомбинантной ДНК или методами химического синтеза. Последовательность нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению, включающая, например,последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую слитый белок, может быть вставлена в рекомбинантный экспрессирующий вектор. Рекомбинантный экспрессирующий вектор - это, как правило,плазмида, вирус или другой известный в данной области носитель, которые были преобразованы вставкой или введением последовательностей нуклеиновой кислоты. Например, рекомбинантный экспрессирующий вектор по настоящему изобретению содержит последовательность нуклеиновой кислоты, которая кодирует пептид, имеющей, например, последовательность, указанную далее среди последовательностей SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ IDNO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10. Экспрессирующий вектор обычно содержит начало репликации, промотор, а также специфические гены, обеспечивающие фенотипическую селекцию трансформированных клеток. Пригодные для применения в настоящем изобретении векторы включают (но не ограничиваются ими) экспрессирующий вектор на основе системы транскрипции Т 7 для экспрессии в бактериях (Rosenberg и др. // Gene. 1987. Т. 56. С. 125), экспрессирующий вектор pMSXND для экспрессии в клетках млекопитающих (Lee and Nathans // J. Biol. Chem. 1988. T. 263. C. 3521), происходящие от бакуловируса векторы для экспрессии в клетках насекомых, вирус мозаики цветной капусты CaMV, вирус табачной мозаики TMV. Последовательности нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению могут включать также локализационную последовательность для направления к конкретным местам в клетках путм слияния с соответствующими адресующими сигналами органелл или локализованными белками клеток-хозяев. Например, полинуклеотид, кодирующий локализационную последовательность или сигнальную последовательность, может быть использован в качестве репрессора и поэтому может быть пришит или слит на 5'-конце с последовательностью нуклеиновой кислоты, кодирующей пептид по настоящему изобретению, таким образом, что локализационный или сигнальный пептид располагается на содержащем аминогруппу конце полученного кодируемого слитого полипептида. Конструирование экспрессирующих векторов и экспрессия генов в трансфицированных клетках включают использование методов молекулярного клонирования, также хорошо известных в данной области (см., например, Sambrook и др. // Molecular Cloning - A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor,N.Y. 1989; и Current Protocols in Molecular Biology, Под ред. Ausubel M. и др. (Current Protocols, совместный проект Greene Publishing Associates, Inc. и John WileySons, Inc., самое последнее Приложение. Эти методы включают методику получения рекомбинантной ДНК in vitro, методики синтеза и методики рекомбинации/генетики in vivo (см. также Maniatis и др. // Molecular Cloning A Laboratory Manual, ColdSpring Harbor Laboratory, N.Y. 1989). В дрожжах могут быть использованы различные векторы, содержащие конститутивные или индуцибельные промоторы. Для обзора см.: Current Protocols in Molecular Biology. Под ред. Ausubel M. и др.T. I и II. Могут быть использованы конститутивный дрожжевой промотор - такой, как ADH или LEU2,или индуцибельный промотор - такой, как GAL (Rothstein "Cloning in Yeast". 4. 3 в DNA Cloning. Vol. 11.A Practical Approach, Под ред. D.M.Glover. IRL Press, Wash., D.C., 1986). В качестве альтернативы могут быть использованы векторы, которые способствуют интеграции чужеродной ДНК в дрожжевую хромосому. Система из насекомых представляет собой альтернативную систему, которую можно использовать для экспрессии пептида, имеющего, например, последовательность, выбранную из группы, включающей последовательности SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ IDNO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10. В одной из таких систем в качестве вектора для экспрессии чужеродных или мутированных последовательностей используется вирус ядерного полиэдроза Autographa californica (AcNPV). Вирус размножается в клетках Spodoptera frugiperda. Последовательность, кодирующую пептид настоящего изобретения, можно клонировать в участки (генома) вируса,не являющиеся необходимыми (например, ген полиэдрина) и помещать под контролем промотораAcNPV (например, промотора полиэдрина). Успешная вставка последовательностей, кодирующих пеп- 12006650 тид настоящего изобретения, приведт к инактивации гена полиэдрина и продукции незакрытого рекомбинантного вируса (т.е. вируса без белковой оболочки, кодируемой геном полиэдрина). Затем эти рекомбинантные вирусы используют для инфицирования клеток S. frugiperda, в которых экспрессируется вставленный ген (см. Smith и др. // J. Virol. 1983. Т. 46. С. 584; Smith, патент США 4215051). Векторы настоящего изобретения могут использоваться для трансформации клетки-хозяина. Под трансформированием или трансформацией подразумевается постоянное или преходящее генетическое изменение, индуцированное в клетке вслед за внедрением новой ДНК (т.е. ДНК, экзогенной по отношению к клетке). Если клетка является клеткой млекопитающего, постоянное генетическое изменение в общем случае достигается внедрением ДНК в геном клетки. В общем виде трансформированная клетка или клетка-хозяин обозначает клетку (например, прокариотическую или эукариотическую), в которую (или в предка которой) с помощью методик рекомбинантной ДНК была введена молекула ДНК, кодирующая пептид по настоящему изобретению или его аналог. Трансформация клетки-хозяина рекомбинантной ДНК может быть осуществлена с помощью обычных методик, хорошо известных специалистам в данной области. Если клетка является прокариотической - такой, как Е. соli, то компетентные клетки, способные воспринять ДНК, могут быть получены из клеток, собранных после фазы экспоненциального роста и затем обработанных методом СаСl2 с помощью методик, хорошо известных в данной области. В качестве альтернативы можно использовать MgCl2 или RbCl. Трансформацию можно осуществить также после получения протопластов клеток-хозяев или с помощью электропорации. Если хозяином является эукариота, методы трансфекции или трансформации с помощью ДНК включают соосаждение с фосфатом кальция, общепринятые механические методики - такие, как микроинъекция, электропорация, введение плазмиды, вставленной в вирусные векторы, и тому подобные; могут быть также использованы другие методы, хорошо известные в данной области. Эукариотические клетки могут быть совместно (одновременно) трансфицированы последовательностями ДНК, кодирующими пептид настоящего изобретения, и второй чужеродной молекулой ДНК, кодирующей селектирующий маркер - такой, как ген тимидин-киназы вируса простого герпеса. Другой метод состоит в использовании эукариотического вирусного вектора - такого, как обезьяний вирус 40 (SV40) или вирус бычьей папилломы, для преходящей инфекции или трансформации эукариотических клеток и экспрессии белка (Eukaryotic Viral Vectors. Под ред. Gluzman Cold Spring Harbor Laboratory, 1982). Обычно в качестве клетки-хозяина используют эукариотическую клетку-хозяина. Эукариотическая клетка может быть клеткой дрожжей (например, Saccharomyces cerevisiae), клеткой насекомого (например, Drosophilasp.) или может быть клеткой млекопитающего, в том числе клеткой человека. Эукариотические системы и системы экспрессии от млекопитающих позволяют осуществлять посттрансляционную модификацию экспрессированных белков млекопитающих. Следует использовать эукариотические клетки, имеющие клеточные механизмы для процессинга первичного транскрипта, гликозилирования, фосфорилирования и, что удобно, секреции продукта гена. Такие линии клеток-хозяев включают (но не ограничиваются ими) СНО, VERO, BHK, HeLa, COS, MDCK, Jurkat, HEK-293 и WI38. Могут быть сконструированы системы клеток млекопитающих, которые используют рекомбинантные вирусы или вирусные элементы для включения экспрессии. Например, при использовании аденовирусных экспрессирующих векторов последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая пептид настоящего изобретения, может быть присоединена к аденовирусному комплексу контроля транскрипции/трансляции - например, к позднему промотору (промотору поздних функций) и тройственной лидерной последовательности. Эту химерную последовательность можно затем вставить в аденовирусный геном с помощью рекомбинации in vitro или in vivo. Вставка в не являющуюся необходимой область вирусного генома (например, область Е 1 или Е 3), даст рекомбинантный вирус, который жизнеспособен и способен экспрессировать пептид настоящего изобретения в инфицированных клетках-хозяевах (например, см. Logan and Shenk // Proc. Natl. Acad. USA. 1984. T. 81. С. 3655-3659). В качестве альтернативы можно использовать промотор 7,5 К вируса осповакцины (например, см. Mackett и др. // Proc. Natl. Acad.Acad. USA. 1982. Т. 79. С. 4927-4931). Особенно интересны векторы на основе вируса бычьей папилломы, которые способны реплицироваться как внехромосомные элементы (Sarver и др. // Mol. Cell. Biol. 1981. Т. 1. С. 486). Вскоре после проникновения этой ДНК в мышиные клетки плазмида реплицируется с накоплением приблизительно 100-200 копий на клетку. Для транскрипции внедрнной кДНК не требуется интеграция плазмиды в хромосому хозяина, что дат высокий уровень экспрессии. Эти векторы можно использовать для стабильной экспрессии, вводя в плазмиду селектирующий маркер - такой, как генnео. В качестве альтернативы, можно модифицировать ретровирусный геном для использования его в качестве вектора, способного внедрить и включить экспрессию гена в клетках-хозяевах (Cone and Mulligan // Proc. Natl. Acad. USA. 1984. T. 81. С 6349-6353). Можно получить высокий уровень экспрессии также путм использования индуцибельных промоторов, в том числе (но не ограничиваясь ими) промотора металлотионина IIА и промоторов теплового шока.- 13006650 Для длительной продукции с высоким выходом рекомбинантных белков предпочтительна стабильная экспрессия. Вместо использования экспрессирующих векторов, содержащих вирусные начала репликации, можно трансформировать хозяйские клетки ДНК, кодирующей пептид настоящего изобретения(например, пептид, имеющий последовательность, выбранную из группы, включающей SEQ ID NO: 2,SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10), находящейся под контролем соответствующих элементов контроля экспрессии (например, промоторной, энхансерной последовательностей, терминаторов транскрипции, сайтов полиаденилирования и т.п.), и селектирующий маркер. Селектирующий маркер в рекомбинантном векторе привносит устойчивость к селекции и дат возможность клеткам интегрировать плазмиду в свои хромосомы и расти с образованием колоний, которые, в свою очередь, можно клонировать и превратить в клеточные линии. Например, после внедрения чужеродной ДНК сконструированным клеткам дают расти в течение 1-2 дней в обогащенной питательной среде, и затем меняют среду на селективную. Можно использовать большое число селектирующих систем, в том числе (но не ограничиваясь ими): гены тимидин-киназы вируса простого герпеса (Wigler и др. // Cell. 1977. Т. Ц. С. 223), гипоксантин-гуанин фосфорибозилтрансферазы (Szybalska and Szybalski // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1962. T. 48. С 2026) и аденин фосфорибозилтрансферазы (Lowy и др. // Cell. 1980. Т. 22. С. 817) соответственно в клетках tk-, hgprt- или aprt-. Можно использовать также устойчивость к антиметаболитам на основе селекции по генам дигидрофолат-редуктазы (dhfr), который придат устойчивость к метотрексату (Wigler и др. // Рrос. Natl. Acad. Sci.USA. 1980. Т. 77 С. 3567; O'Hare и др. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1981. Т. 8. С. 1527); gpt, придающему устойчивость к микофенольной кислоте (Mulligan and Berg // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1981. T. 78. С 2072); neo, придающему устойчивость к аминогликозиду G-418 (Colberre-Garapin и др. // J. Mol. Biol. 1981. Т. 150. С. 1); и hygro, придающему устойчивость к гигромицину (Santerre и др. // Gene. 1984. Т. 30. С. 147). Недавно были описаны дополнительные селектирующие гены, а именно trpB, который дат возможность клеткам использовать индол вместо триптофана; hisD, который дат возможность клеткам использовать гистинол вместо гистидина (Hartman and Mulligan // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1988. T. 85. С 8047); и ODC (ген орнитин-декарбоксилазы), который придат устойчивость к ингибитору орнитиндекарбоксилазы 2-(дифторметил)-DL-орнитину (DFMO) (McConlogue L. В Current Communications inMolecular Biology. Изд. Cold Spring Harbor Laboratory. 1987). В другом аспекте изобретение предусматривает антитела, которые специфически связываются с пептидом настоящего изобретения (имеющим, например последовательность из перечисленных последовательностей SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7,SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10). Например, антитела, которые специфически связываются с пептидом, имеющим SEQ ID NO: 2, не связываются с пептидом, имеющим SEQ ID NO: 4. Если пептид гликозилирован, тип гликозилирования может быть использован как часть схемы очистки путм,например, хроматографии на сорбенте с лектином. Такие антитела полезны для исследований и диагностики в изучении воспалительных расстройств и заболеваний (например, ревматоидного артрита, диабета и подобных им) и вообще связаны с патологиями. Такие антитела могут вводиться сами по себе или входить в состав фармацевтической композиции,содержащей антитела, специфически связывающиеся с аминокислотной последовательностью, указанной как одна из последовательностей SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ IDNO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10, и другие реагенты, эффективные в качестве модуляторов воспалительных реакций in vitro и in vivo. Термин эпитоп, как он использован здесь, относится к антигенному детерминанту на антигене такому, как пептид, имеющий последовательность, выбранную из группы, включающей SEQ ID NO: 2,SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10 настоящего изобретения. Антигенные детерминанты обычно состоят из химически активных поверхностных группировок молекул - таких как аминокислоты или боковые сахарные цепи, и могут иметь специфические трхмерные структурные характеристики, а также специфические зарядовые характеристики. Антитела, связывающиеся с пептидами настоящего изобретения, могут быть приготовлены при использовании интактных пептидов или их фрагментов (например, фрагментов последовательности SEQID NO: 1 или последовательности SEQ ID NO: 13, соответствующие последовательностям пептидов настоящего изобретения), содержащих малые целевые пептиды в качестве иммунизирующего антигена. Используемый для иммунизации животного полипептид или пептид может быть итогом трансляции кДНК или химического синтеза и может быть при необходимости конъюгирован с белком-носителем. Такие общеупотребимые носители, химически связанные с пептидом, включают гемоцианин входного отверстия моллюска (keyhole limpet hemocyanin, KLH), тироглобулин, бычий сывороточный альбумин(БСА) и анатоксин столбняка. Связанный пептид затем используют для иммунизации животного (например, мыши, крысы или кролика). При необходимости поликлональные или моноклональные антитела могут быть затем очищены,например, путм связывания-элюирования на носителе, к которому присоединн полипептид или пептид,к которому антитела были получены. Специалистам в данной области известны различные методики,- 14006650 общепринятые в области иммунологии, для очистки и/или концентрирования поликлональных антител и моноклональных антител (см., например, работу Coligan и др. Глава 9 в Current Protocols in Immunology.Wiley Interscience. 1991, включнную в настоящее описание ссылкой). Для получения моноклональных антител, имитирующих эпитоп, можно также использовать методику анти-идиотипа. Например, анти-идиотипические моноклональные антитела, полученные к первым моноклональным антителам, будут содержать в гипервариабельном участке связывающийся домен, который представляет собой образ эпитопа, связываемого первыми моноклональными антителами. Антитела по настоящему изобретению включают поликлональные антитела, моноклональные антитела и фрагменты поликлональных и моноклональных антител. Способы получения поликлональных антител хорошо известны специалистам в данной области. См., например, руководства: Green и др. "Production of Polyclonal Antisera" // В Immunochemical Protocols. Под ред. Manson. Humana Press, 1992. С 1-5; Coligan и др. "Production of Polyclonal Antisera in Rabbits,Rats, Mice and Hamsters // В Current Protocols in Immunology. 1992. Раздел 2.4.1, которые включены в настоящее описание ссылкой. Подобным же образом имеются общепринятые способы получения моноклональных антител. См.,например, работы: Kohler and Milstein // Nature. 1975. Т. 256. С. 495; Coligan и др. (1992), разделы 2.5.12.6.7; и Harlow и др. // Antibodies: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Pub., 1988. С 726, которые включены в настоящее описание ссылкой. В качестве альтернативы, антитела могут происходить от очеловеченных, т.е. приближенных к человеческому типу ("humanized") моноклональных антител. Такие приближенные к человеческому типу моноклональные антитела получают переносом в вариабельный домен антител человека мышиных областей, определяющих комплементарность, из тяжлой и лгкой вариабельных цепей иммуноглобулина мыши, и затем замещением человеческих аминокислотных остатков в рамочных участках мышиных двойников. Использование компонентов антител, происходящих от очеловеченных моноклональных антител устраняет потенциальные проблемы, связанные с иммуногенностью мышиных константных областей. Общие методики клонирования вариабельных доменов мышиного иммуноглобулина описаны, например, в работе Orlandi и др. // Proc. Natl. Acad. Sci.USA. 1989. Т. 86. С. 3833, которая включена в настоящее описание во всей полноте ссылкой на не. Методики получения очеловеченных моноклональных антител описаны, например, в работах: Jones и др. //Biotech. 1992. T. 12. С 437; и Singer и др. // J. Immunol. 1993. Т. 150. С. 2844, которые включены в настоящее описание ссылкой. В другом аспекте изобретение обеспечивает получение поколения аутореактивных клеток со способностью распознавать орган-специфические антигены и продуцировать медиаторы, подавляющие активность патогенных клеток вместо того, чтобы обладать потенциальной способностью содействовать развитию заболевания. Например, необходимо селективно стимулировать продукцию иммуномодулирующих соединений - таких как, например, цитокинов, подобных IL-4, IL-10, IL-9, IL-13 и TGF-. Понятно, что индукция таких иммуномодулирующих соединений может быть связана с идентичностью выбранного эпитопа в связи с репертуаром Т-клеток, фоном цитокинов при первичной индукции (прайминге) и режимом инокуляции. Что существенно, нужно понимать, что такая стратегия не ограничивается лишь теми антигенами, которые играют центральную роль в патогенезе аутоиммунного заболевания, но потенциально применима к любому орган-специфическому антигену. По существу, селективная индукция таких иммуномодулирующих соединений имеет несколько преимуществ в уменьшении интенсивности аутоиммунных расстройств. Например, для такого лечения не нужна идентификация тех эпитопов, которые запускают патогенез, скорее оно может дать косвенную супрессию на широкой основе Тклеток реагирующих с различными эпитопами. Более того, такая стратегия ограничивает риск обострения болезни вследствие фазы временной активации патогенных Т-клеток в ходе антигенной терапии, и она может нарушить устойчивость патогенных Т-клеток к механизмам периферической толерантности,участвующих в подавлении реакций и удалении клеток. В другом аспекте пептиды по настоящему изобретению применяются как иммунологические агенты в фармацевтической композиции, вводимой для модуляции (т.е. предотвращения или подавления) опосредованного иммунитетом заболевания (т.е. заболевания, связанного с иммунным ответом). Соответственно, подразумевается, что пептиды настоящего изобретения охватывают их соли и функциональные производные, а также аналоги пептида hsp60, до тех пор, пока сохраняется биологическая активность белка или пептида в смысле модуляции опосредованного иммунитетом заболевания (то есть заболевания, связанного с иммунным ответом). Пептиды по настоящему изобретению (например, пептид, имеющий последовательность, приведнную среди последовательностей SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ IDNO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10) предпочтительно вводят до развития опосредованного иммунитетом заболевания индивидууму с риском такого заболевания. Подразумевается, что термин до означает период времени, в течение которого такое лечение подавляет у хозяина реакцию, основанную на опосредованном hsp60 аутоиммунитете, предпочтительно это такое вре- 15006650 мя, когда оптимальная модуляция (то есть подавительная регуляция) совпадает с периодом воспалительной реакции. В качестве альтернативы, пептид по настоящему изобретению может быть введн вместе с другим противовоспалительным агентом, таким как противовоспалительный цитокин или анти-TNFI агент. В настоящем изобретении введение фармацевтической композиции, содержащей пептиды hsp60 или их аналоги как иммунологически активные агенты для модуляции воспаления у индивидуума, может производиться различными путями, известными в данной области, такими как местный, оральный, интраназальный, внутривенный, внутримышечный или подкожный пути введения. Предпочтительным является внутривенное введение, поскольку известно, что при нм индуцируется сдвиг ТН 1 ТН 2. Предпочтительная дозировка пептидов настоящего изобретения или их аналогов зависит от набора факторов,в том числе типа заболевания, возраста и веса индивидуума, а также остроты симптомов. Специалист в данной области может определить подходящую дозу эмпирически. Например, специалисты в данной области могут определить оптимальную дозировку и режим введения, измеряя сдвиг от реакции цитокинов ТН 1 к реакции цитокинов ТН 2. Пептиды настоящего изобретения или их аналоги можно вводить в ходе развития или после иммунологической или воспалительной реакции, чтобы далее модулировать (например, снижать или подавительно регулировать) воспалительную реакцию. Воспалительные реакции, к которым применимы способы и композиции настоящего изобретения, включают, например, аутоиммунные заболевания или расстройства (например, зависимый от инсулина диабетический мелит - insulin dependent diabetes mellitus(IDDM), рассеянный склероз, системную красную волчанку, синдром Шегрена, склеродермию, полимиозит, хронический активный гепатит, смешанные заболевания соединительной ткани, первичный жлчный цирроз, пернициозную анемию, аутоиммунный тиреоидит, идиопатическую болезнь Аддисона, витилиго, глютеновую энтеропатию, базедову болезнь (болезнь Грейвса), воспалительную болезнь кишечника, миастению, аутоиммунную нейтропению, идиопатическую пурпурную тромбоцитопению, ревматоидный артрит, цирроз, обыкновенную пузырчатку, аутоиммунное бесплодие, болезнь Goodpasture, пузырчатый пемпигоид, дискоидную волчанку, язвенный колит и болезнь плотных отложений). Перечисленные выше заболевания, как они здесь упоминаются, включают заболевания, проявляющиеся в животных моделях для этих заболеваний - таких, как, например, у не страдающих ожирением диабетических мышей для IDDM и мышей с экспериментальным аутоиммунным энцефаломиелитом (ЭАЭ) для рассеянного склероза. Способы настоящего изобретения могут быть применены для лечения таких аутоиммунных заболеваний и воспалительных заболеваний или расстройств путм модуляции (например, уменьшения или ликвидации) иммунной реакции на собственную (свою) ткань индивидуума или, альтернативно, путм уменьшения или ликвидации предсуществующей аутоиммунной реакции, направленной на ткани или органы, пересаженные для замены собственных тканей или органов, поврежднных аутоиммунной реакцией. Введение одного или нескольких пептидов настоящего изобретения (например, пептидов, имеющих последовательность из приведнного набора последовательностей SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ IDNO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10) предпочтительно совмещается с применением обычной противовоспалительной или иммунодепрессивной терапии. Ожидается, что различные эпитопы белка hsp60 - такие, как представленные в табл. 1 (например,SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8,SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10), у некоторых индивидуумов могут быть более эффективны в воспалительных реакциях. Поэтому может быть проведн скрининг пептидов настоящего изобретения на лимфоцитах периферической крови намечаемого индивидуума, чтобы определить, который из пептидов имеет оптимальный эффект по отношению к воспалению. Например, молекулы II класса ГСТС связываются с пептидами длиной 12-15 аминокислотных остатков (например, такими короткими, как 9 аминокислотных остатков), а молекулы I класса ГСТС связывают пептиды длиной 7-9 аминокислотных остатков. Поэтому можно легко провести скрининг пептидных фрагментов hsp60 - таких, как представленные в табл. 1, чтобы определить один или несколько оптимальных пептидов, которые можно ввести данному конкретному индивидууму или индивидууму с данным типом АЧЛ, чтобы модулировать у индивидуума иммунный ответ - например, чтобы сместить цитокинный ответ к типу ТН 2 и подавительно регулировать таким образом у него/нее воспалительную реакцию. Лимфоциты периферической крови (ЛПК) индивидуальной человеческой особи могут быть выделены из цельной крови центрифугированием в градиенте плотности Ficoll-Hypaque, как это хорошо известно в данной области. Этот образец лимфоцитов индивидуума можно тестировать на связывание пептидов, предназначенных к скринингу, в соответствии со способом, раскрытым в патенте США 5356779 (авторы Mozes и др.), или на пролиферацию Т-клеток in vitro и последующую реакцию Т-клеток на цитокины. Эти анализы позволят определить оптимальную или близкую к оптимальной пептидную последовательность для конкретного индивидуума.- 16006650 Другой путь скрининга набора пептидов состоит в тестировании лимфоцитов индивидуума на пролиферацию in vitro в присутствии каждого из пептидов набора, или в тестировании на переключение ТН 1 ТН 2, вызванного такими пептидами. Так, в различные моменты времени можно собрать надосадочные жидкости от Т-клеток, культивированных вместе с тестируемыми пептидами в концентрациях от 5 до 50 мкг/мл, и тестировать в них активность различных цитокинов - таких как ИФН- и IL-4, секретированных в культуральную жидкость, что может быть осуществлено количественно методом твердофазного иммуноферментного анализа ELISA с использованием стандартных прописей ELISA или в присутствии антител определнных классов. Клетки ТН 1 секретируют цитокины, которые индуцируют пролиферацию Т-клеток, и цитокины такие как ИФН-, которые участвуют в процессе воспаления тканей. С другой стороны, клетки ТН 2 секретируют IL-4, который помогает 9-клеткам секретировать антитела классов IgG и IgE и подавляют продукцию воспалительных цитокинов ТН 1, а также IL-10, который косвенно ингибирует активацию ТН 1, влияя на предъявление антигена и продукцию воспалительных цитокинов макрофагами. Поэтому измерение соотношения цитокинов, продуцируемых пролиферировавшимиin vitro Т-клетками, также послужит указанием на переключение и реакции Т-клеток ТН 1 на реакцию Тклеток ТН 2. Таким образом, переключение ТН 1 ТН 2 может служить индикатором при мониторинге реакции in vitro Т-лимфоцитов индивидуума на различные тестируемые пептиды с целью определить оптимальные или близкие к оптимальным пептиды. Терапевтические режимы и фармацевтические композиции настоящего изобретения могут быть применены совместно с дополнительными усилителями иммунного ответа или модификаторами биологической реакции, включая (но не ограничиваясь ими) цитокины ИФН-I, ИФН-, IL-2, IL-4, IL-6, TNF или другие цитокины, воздействующие на иммунные клетки. При применении in vivo один или несколько пептидов настоящего изобретения могут вводиться в слизистую оболочку (например, с помощью суппозитория, ингалятора или перорально), парентерально путм инъекции или постепенной перфузией в течение некоторого времени. Введение может быть оральным, внутривенным, внутрибрюшинным, внутримышечным, подкожным, внутриполостным или трансдермальным. Один или несколько пептидов настоящего изобретения могут также вводиться совместно с адъювантом, гормоном, цитокином, кортикостероидом и т.п. Для исследований in vitro агенты могут быть добавлены к или растворены в подходящем биологически приемлемом буфере и добавляться к клеткам или ткани. Препараты для парентерального введения включают стерильные водные или неводные растворы,суспензии и эмульсии. Примерами неводных растворителей являются пропиленгликоль, полиэтиленгликоль, растительные масла, такие как оливковое масло, и пригодные для инъекции органические эфиры такие, как этилолеат. Водные носители включают воду, спирто-водные растворы, эмульсии или суспензии, в том числе физиологический солевой раствор и забуференные среды. Парентеральные средства доставки включают раствор хлорида натрия, декстрозу Рингера, декстрозу и хлорид натрия, лактатные внутривенные растворы Рингера, в том числе заместители жидкости и питательных веществ, электролитные заместители (такие, как заместители на основе декстрозы Рингера) и подобные им. Могут также наличествовать консерванты и другие добавки, такие как антимикробные вещества, антиоксиданты, хелатные агенты, инертные газы и т.п. Предусматривается, что изобретение может быть применено для лечения патологий, связанных с опосредованными иммунитетом расстройствами - такими, как воспалительные и аутоиммунные расстройства, патогенные инфекции и раковые или предраковые состояния, путм модуляции иммунной реакции у подвергающегося воздействию индивидуума. Таким образом, настоящее изобретение охватывает способы снижения интенсивности расстройства, связанного с опосредованными иммунитетом заболеваниями, в том числе такими, которые связаны с антиген-специфической иммунной реакцией на свой антиген. Способы настоящего изобретения включают лечение индивидуума, находящегося в состоянии расстройства или заболевания, в месте проявления расстройства или болезненного состояния, с помощью одного или нескольких пептидов настоящего изобретения, имеющих, например, последовательность,указанную в наборе из последовательностей SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5,SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10, или их аналог. Вообще,термины воздействие, лечение и подобные им использованы здесь для обозначения воздействия на индивидуум, ткань или клетку для получения требуемого фармакологического и/или физиологического эффекта. Эффект может быть профилактическим в том смысле, что происходит полное или частичное предотвращение (предупреждение) заболевания или его признаков или симптомов, и/или может быть терапевтическим в том смысле, что происходит частичное или полное избавление от инфекции или заболевания и/или побочных эффектов, присущих инфекции или заболеванию. Термин воздействие, как он использован здесь, охватывает любое лечение или предотвращение заболевания у позвоночного, млекопитающего, в особенности у человека, и включает: (а) предотвращение появления расстройства у индивидуума, который может быть предрасположен к расстройству, но диагноз ещ не показал его наличия;(b) ингибирование расстройства, то есть задержку его развития; (с) ослабление или снижение тяжести заболевания, т.е. получение регрессии расстройства, или (d) модуляция протекающей иммунной реакции,- 17006650 которая является промежуточным звеном в расстройстве, таким образом, чтобы противодействовать развитию болезненного состояния или расстройства. Настоящее изобретение включает различные фармацевтические композиции, пригодные для снижения тяжести симптомов, присущих опосредованным иммунитетом расстройствам, как они здесь описаны. Согласно одному из вариантов осуществления изобретения, фармацевтические композиции получены переводом антител к пептиду, имеющему последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ IDNO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10, пептидному аналогу упомянутых выше последовательностей, пептиду-имитатору упомянутых выше последовательностей, лекарства, химического соединения или комбинации химических соединений или агента, модулирующего биологическую активность пептидов настоящего изобретения, в приемлемую для введения индивидууму форму путм использования носителей, наполнителей и добавок или вспомогательных веществ. Часто используемые носители или вспомогательные вещества включают карбонат магния, двуокись титана, лактозу, маннитол и другие сахара, тальк, молочный белок, желатин, крахмал, витамины, целлюлозу и е производные, животные и растительные масла, полиэтиленгликоль и растворители - такие, как воду, спирты, глицерин и многоатомные спирты. Носители при внутривенном введении включают заместители жидкости и питательных веществ. Консерванты включают антимикробные вещества, антиоксиданты, хелатирующие агенты и инертные газы. Другие фармацевтически приемлемые носители включают водные растворы,нетоксичные наполнители, в том числе соли, консерванты, буферные растворы и подобные им, как описано, например, в Remington's Pharmaceutical Sciences, 15-e издание. Mack Publishing Co. Easton, 1975. С. 1405-1412, 1461-1487; и The National Formulary XIV, 14-е издание. American Pharmaceutical Association.Washington, 1975; содержание этих работ включено в настоящее описание ссылкой. В фармацевтической композиции регулируют значение рН и точную концентрацию различных компонентов в соответствии с обычными для данной области примами (см. Goodman and Gilman. The Pharmacological Basis for Therapeutics, 7-е издание). Фармацевтические композиции предпочтительно готовят и вводят в виде стандартных доз. Тврдые стандартные дозы представляют собой таблетки, капсулы и суппозитории. Для лечения индивидуума необходимы различные суточные дозы, в зависимости от активности соединения, способа введения, природы и остроты расстройства, возраста и веса тела индивидуума. В некоторых случаях, однако, могут требоваться большие или меньшие суточные дозы. Введение суточной дозы может быть осуществлено или путм однократного введения в виде индивидуальной стандартной дозы, или введением нескольких меньших стандартных доз, а также многократным введением дробных доз через определнные интервалы времени. Фармацевтические композиции настоящего изобретения могут вводиться местно или системно в терапевтически эффективной дозировке. Конечно, эффективные для такого применения количества зависят от остроты заболевания и от веса и общего состояния индивидуума. Обычно используемые in vitro дозировки могут дать полезное руководство к определению количеств, пригодных для введения фармацевтической композиции in situ, и для определения эффективных дозировок в лечении конкретных расстройств могут быть использованы модельные исследования на животных. Различные соображения описаны, например, в работах Langer// Science. 1990. Т. 249. С. 1527; и труде под ред. Gilman и др. (1990),каждая из которых включена в настоящее описание ссылкой. В одном из вариантов осуществления настоящее изобретение предусматривает фармацевтическую композицию, пригодную для введения пептида настоящего изобретения или его аналога, или кодирующей пептид настоящего изобретения нуклеиновой кислоты индивидууму, нуждающемуся в таком лечении. Введение фармацевтической композиции настоящего изобретения может быть осуществлено любым из способов, известных специалистам в данной области. Предпочтительно индивидуум относится к млекопитающему, наиболее предпочтительно к человеку, но может быть любым организмом. Пептид или антитело настоящего изобретения могут вводиться орально, парентерально, в кишечник, путм инъекции, быстрого вливания, носоглоточной адсорбции, кожной адсорбции, ректально и орально. Препараты фармацевтически приемлемых носителей включают стерильные водные или неводные растворы, суспензии и эмульсии. Примерами неводных растворителей являются пропиленгликоль,полиэтиленгликоль, растительные масла, такие как оливковое масло, и пригодные для инъекции органические эфиры, такие как этилолеат. Для повышения кожной проницаемости и усиления связывания антигена могут использоваться носители для окклюзионных повязок. Жидкие формы дозировок для орального введения могут вообще представлять собой раствор, содержащий жидкую форму дозировки. Подходящие формы тврдых или жидких фармацевтических препаратов могут представлять собой, например,гранулы, порошки, таблетки, таблетки с покрытием, (микро)капсулы, суппозитории, сиропы, эмульсии,суспензии, кремы, аэрозоли, капли или пригодный для инъекции раствор в форме ампул, а также препараты с пролонгированным высвобождением активных компонентов, в которых применены наполнители и добавки и/или вспомогательные вещества, такие как дезинтегрирующие агенты, связующие вещества,покрывающие агенты, агенты для набухания, смазки, ароматизаторы, подслащивающие вещества и элик- 18006650 сиры, содержащие обычно используемые в данной области инертные разбавители, такие как очищенная вода. Другая система доставки для последовательностей нуклеиновой кислоты и пептида настоящего изобретения - это коллоидная дисперсная система. Коллоидные дисперсные системы включают макромолекулярные комплексы, нанокапсулы, микросферы, гранулы и подобные им. В другом варианте осуществления настоящее изобретение предусматривает способ идентификации агента, который взаимодействует с белком hsp60, или модулирует активность белка hsp60 или биологическую активность пептида настоящего изобретения, включающий инкубацию компонентов, представляющих собой агент и пептид настоящего изобретения (например, пептид, с последовательностью, указанной среди последовательностей SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ IDNO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10), или рекомбинантную клетку,экспрессирующую такой пептид, в условиях, достаточных для обеспечения взаимодействия агента и определения воздействия агента на активность полипептида или пептида. Термин воздействовать, как он использован здесь, охватывает любые способы, которыми может быть модулирована активность пептида, и включает измерение взаимодействия агента с пептидом физическими методами, в том числе, например, с помощью флуоресцентного детектирования связывания агента с пептидом. Агенты могут включать, например, полипептиды, имитаторы пептидов, химические соединения, небольшие молекулы и биологические агенты, как они здесь описаны. Инкубация включает условия, обеспечивающие контакт между используемым для тестирования агентом и пептидом настоящего изобретения, или с клеткой, экспрессирующей пептид настоящего изобретения. Контактирование включает взаимодействие в растворе и в тврдой фазе. Используемый для тестирования агент может по желанию быть комбинаторной библиотекой для скрининга множества агентов. Идентифицированные в способе настоящего изобретения агенты могут быть дополнительно оценены, детектированы, клонированы, секвенированы и т.п., либо в растворе, либо после связывания с тврдой подложкой, любым способом, обычно применяемым для обнаружения специфической последовательности ДНК - таким, как полимеразная цепная реакция (ПЦР), рестрикция олигомеров (Saiki и др. //Bio/Technology. 1985. Т. 3. С. 1008-1012), анализ сшивания олигонуклеотидов (oligonucleotide ligationassys, OLA) (Landegren и др. // Science. 1988. Т. 241. С. 1077) и подобные им. Обзор молекулярных методов для анализа ДНК дан в работе Landegren и др. // Science. 1988. Т. 242. С. 229-237. Областью исследования является разработка способов терапевтического воздействия. Предварительный просмотр (скрининг) идентифицирует агенты, которые модулируют биологическую активность пептида настоящего изобретения в организмах-мишенях. Особый интерес представляет поиск агентов,имеющих низкую токсичность или сниженное количество побочных эффектов у человека. Термин агент, как он использован здесь, описывает любую молекулу, например белок или фармацевтическое средство, обладающую способностью изменять или имитировать физиологическую функцию или экспрессию пептида, имеющего последовательность, выбранную из группы, включающейSEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8,SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10. Как правило, для получения зависимости реакции от концентрации агента готовят параллельно набор испытуемых смесей с различными концентрациями агента. Обычно одна из этих концентраций служит негативным контролем, то есть это нулевая концентрация или концентрация ниже уровня обнаружения. В другом варианте осуществления настоящее изобретение предусматривает способ идентификации агента, который модулирует (например, ингибирует) связанное с hsp60 расстройство (например, воспалительное расстройство или заболевание) при введении в клетку или индивидууму, имеющим связанное с hsp60 расстройство, эффективного количества композиции, содержащей пептид настоящего изобретения или его аналог, или агент (например, антитела, рибозим, антисмысловую молекулу или двунитевые интерферирующие молекулы РНК), которые взаимодействуют с hsp60 или подавляют симптомы связанного с hsp60 расстройства. Симптом может включать, например, продукцию цитокинов реакций типа ТН 1 или ТН 2, как они здесь определены, а также патологические процессы, связанные с воспалением(например, с опуханием, расширением сосудов и им подобными). Выявление полипептидов hsp60 и dnaJP1 in vivo и in vitro Ещ в одном варианте осуществления изобретение предусматривает способ выявления у индивидуума полипептида hsp60, включающий приведение в контакт клеточного компонента, содержащего или предположительно содержащего полипептид hsp60 или dnaJP1, с реагентом (например, с антителами,специфически связывающимися с пептидной последовательностью, выбранной из группы, включающейSEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8,SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10), который связывается с клеточным полипептидом (здесь и далее - клеточный компонент). Клеточный компонент может содержать, кроме полипептида hsp60 или dnaJPI, нуклеиновую кислоту, такую как ДНК или РНК. Если клеточный компонент - белок, то реагент обычно представляет собой зонд в виде антител. Зонды для обнаружения несут метку, например, радиоактивный изотоп, флуоресцентное соединение, биолюминесцентное соединение, хемилюминесцентное соединение,хелатор металлов или фермент. Специалистам, имеющим обычный опыт в данной области, известны и- 19006650 другие метки, пригодные для присоединения к зонду типа антитела или нуклеиновой кислоты, или они могут найти такие метки на основе обычного опыта. Специалистам, имеющим обычный опыт в данной области, известно большое количество различных меток и способов их введения. Примеры типов меток,которые могут быть применены в настоящем изобретении, включают ферменты, радиоактивные изотопы, коллоидные металлы, флуоресцентные соединения, хемилюминесцентные соединения и биолюминесцентные соединения. Для выявления антигена in vivo и in vitro полезны моноклональные антитела по настоящему изобретению к пептиду настоящего изобретения (например, к пептиду, имеющему последовательность,представленную последовательностями SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10). Меченые на достаточном для обнаружения уровне моноклональные антитела дают в диагностически эффективной дозе. Термин диагностически эффективная означает, что меченые на достаточном для обнаружения уровне моноклональные антитела вводят в количестве, достаточном для того, чтобы обеспечить выявление белков или полипептидного антигена, к которым специфичны моноклональные антитела. Концентрация вводимых индивидууму меченых на достаточном для обнаружения уровне моноклональных антител должна быть достаточной для того, чтобы можно было выявить связывание с этими клетками, биологическими жидкостями или тканями, содержащими последовательность полипептидаhsp60, в сравнении с фоном. Кроме того, желательно, чтобы эти меченые на достаточном для обнаружения уровне моноклональные антитела быстро выводились из кровеносной системы, чтобы отношение сигнала к фону было максимальным. Для диагностики in vivo радиоактивные изотопы могут быть связаны с иммуноглобулином либо прямо, либо с использованием промежуточной функциональной группы. Промежуточными функциональными группами, часто используемыми для присоединения к иммуноглобулинам радиоактивных изотопов, которые существуют в виде ионов металлов, являются бифункциональные хелатирующие (образующие клешневидную химическую связь) агенты - такие, как диэтилентриаминпентауксусная кислота(DTPA) и этилендиаминтетрауксусная кислота (EDTA), а также подобные молекулы. Типичными примерами ионов металлов, которые могут быть присоединены к моноклональным антителам настоящего изобретения, являются 111In, 97Ru, 67Ga, 68Ga, 72As, 89Zr и 201 ТI. Моноклональные антитела настоящего изобретения можно также пометить парамагнитным изотопом для целей диагностики in vivo с помощью магниторезонансной томографии (МРТ) или электронного парамагнитного резонанса (ЭПР). Как правило, может быть использован любой традиционный метод диагностической визуализации. Обычно для визуализации с помощью регистрирующей радиоактивное излучение камеры используют радиоактивные изотопы, испускающие гамма-излучение или позитроны, а для МРТ используют парамагнитные изотопы. Элементы, особенно полезные для этих методов, включают 157Gd, 55Mn, 162Dy, 52Cr и 56Fe. В некоторых случаях может быть выгодно доставлять и экспрессировать пептидную последовательность настоящего изобретения локально (например, в конкретной ткани или конкретном типе клеток). Например, это может быть локальная экспрессия пептида настоящего изобретения (например, пептида, имеющего последовательность, выбранную из группы, представленной последовательностями SEQSEQ ID NO: 9) в хрящевых тканях, ткани поджелудочной железы, кожной ткани или кишечной ткани животного. Например, в ткань или клетки может быть прямо доставлена последовательность нуклеиновой кислоты. Такие способы доставки известны в данной области и включают электропорацию, вирусные векторы и прямое внедрение ДНК. Например, конструкции нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению содержат молекулы нуклеиновой кислоты в форме, пригодной для внедрения в клетки-мишени в ткани хозяина. Нуклеиновые кислоты могут быть в виде голых молекул ДНК или РНК, когда молекулы могут содержать один или несколько структурных генов, один или несколько регуляторных генов, антисмысловые нити, способные к образованию триплексов нити или подобные им элементы. Обычно конструкция нуклеиновой кислоты включает по меньшей мере один структурный ген под контролем транскрипции и трансляции со стороны подходящей регуляторной области. Чаще конструкции нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению представляют собой нуклеиновые кислоты, включнные в средство доставки для повышения эффективности трансфекции, причм средство доставки распределено внутри частиц большего размера, содержащих высушенный материал гидрофильного наполнителя. Одно из таких средств доставки представляет собой вирусные векторы, такие как ретровирусы,аденовирусы и адено-ассоциированные вирусы, которые были инактивированы, чтобы предотвратить собственную репликацию, но которые сохраняют способность исходного вируса связываться с хозяйской клеткой-мишенью, доставлять генетический материал в цитоплазму хозяйской клетки-мишени и включать экспрессию структурных или иных генов, внедрнных в частицу. Подходящие ретровирусные векторы для направленного переноса генов описаны в работе Каhn и др. // Circ. Res. 1992. Т. 71. С. 15081517, выводы которой включены в настоящее описание ссылкой. Подходящие аденовирусные средства доставки генов описаны в работе Rosenfeld и др. // Science. 1991. Т. 252. С. 431-434, выводы которой- 20006650 включены в настоящее описание ссылкой. Ретровирусные и аденовирусные средства доставки описаны в работе Friedman // Science. 1989. Т. 244. С. 1275-1281, выводы которой включены в настоящее описание ссылкой. Пример 1. Идентификация пептида. Для идентификации разнообразных связывающихся с подтипами DR пептидов был использован компьютерный алгоритм, описанный в патенте США 6037135 (включнный в настоящее описание во всей полноте ссылкой), который идентифицирует структурные лейтмотивы связывания пептидов с различными молекулами II класса ГСТС. Сканировали последовательности hsp60 как микобактерий, так и человека, и на основании предсказанного связывания пептидных последовательностей к трм подтипам АЧЛ-DR, а именно DR1, DR4 и DR7, конструировали пептиды (табл. 1). Проводили селекцию пептидов по уровню предсказываемого связывания с DR1, 4 и 7. Пептиды настоящего изобретения, включая входящие в список табл. 1, были идентифицированы с помощью тестов in vitro на способность индуцировать пролиферацию аутореактивных Т-клеток или индуцировать секрецию цитокинов (например, лимфокинов) из этих Т-клеток, или индуцировать другие эффекторные функции, такие как цитотоксичность. Идентифицированный с помощью компьютерного алгоритма эпитоп считался подходящим, если предсказывалось, что он будет иметь достаточное сродство к участкам АЛЧ DR1, DR4 и DR7 (показатель сродства к вариантам DR равен 3). Затем был сконструирован 15-звенный пептид таким образом, чтобы с обеих сторон предсказанного сердцевинного эпитопа наличествовали по меньшей мере два, но предпочтительно три, фланкирующих аминокислотных остатка. После этого каждый пептид, содержащий эпитоп связывания с подтипами DR, сопоставляли с его гомологичным двойником (человеческим или микобактериальным). Таким путм были сконструированы 8 пептидов - 4 микобактериальных пептида (р 1, р 3,р 5, р 7) и 4 гомологичных человеческих пептида (р 2, р 4, р 6, р 8). Пептиды представлены в табл. 1. Пример 2. Пролиферация Т-клеток. Для испытаний на пролиферацию Т-клеток осуществляли контакт первичной культуры одноядерных клеток периферической крови (ОКПК) с пептидами из табл. 1. Обследовали свыше 80 индивидуумов с ЮИА. Группу составляли на основании случайной выборки из пациентов со всеми подтипами ЮИА,на различных стадиях активного проявления заболевания и лечения. ОКПК индивидуумов исследовали в стандартном тесте на пролиферацию. ОКПК отделяли от гепаринизованной крови с помощью центрифугирования в градиенте плотности Ficoll Isopaque. ОКПК культивировали в среде RPMI с добавлением 15% сыворотки АВ в планшетах с 96 ячейками с круглым плоским дном. Каждая ячейка содержала 200000 клеток в 200 мкл среды (Т 1). Клетки культивировали в течение 6 дней (120 ч) при 37 С в 5% СO2 при относительной влажности 100%. В течение последних 16 ч культивирования в каждую ячейку был внесн меченый тритием тимидин с активностью 1 тКи (37 мБк). Включнную радиоактивность измеряли с помощью жидкостного сцинтилляционного счтчика и выражали в импульсах в минуту (имп/мин). Степень пролиферативной реакции выражали в имп/мин и характеризовали показателем стимуляции(ПС), равным отношению среднего числа имп/мин в клетках, культивируемых с антигеном, к среднему числу имп/мин в клетках, культивируемых только с питательной средой. Реакцию на антиген считали положительной, если ПС был равен 2 или больше. Результаты представлены на фиг. 1. У большинства индивидуумов пролиферативная реакция Т-клеток была положительной на полный белок hsp60 как человека, так и микобактерий, как и следовало ожидать на основании предварительных данных. Все пептиды hsp60 индуцировали пептидоспецифические реакции пролиферации Т-клеток у 40-60% индивидуумов с ЮИА. В меньшей группе из 18 индивидуумов с ЮИА анализ пролиферации Е-клеток соединяли с измерением антиген-специфической продукции цитокина. ОКПК культивировали, как описано выше, в планшетах с 96 ячейками при количестве клеток на ячейку 200000 в 200 Т 1. Через 72 ч отбирали надосадочные жидкости и определяли продукцию цитокина с помощью стандартного метода ELISA в соответствии с предписаниями производителя (BD). Оценивали продукцию следующих цитокинов: IL-4, IL-10,ИФН-, TGF-, TNF-I и IL-1RA. На фиг. 2-4 представлена антиген-специфическая продукция IL-10,ИФН- и TNF-I через 72 ч культивирования с пептидами, связывающимися с участками DR. И вновь у большинства индивидуумов могла быть выявлена антиген-специфическая продукция цитокинов в ОКПК, культивируемых in vitro в присутствии пептидов. Не было выявлено никакой антигенспецифической продукции IL-4, что, возможно, является следствием недостаточной чувствительности метода ELISA для этого цитокина. Иммунологическое распознавание антигена может быть определено как антиген-специфическая пролиферация Т-клеток и/или антиген-специфическая продукция цитокинов после культивирования клеток со специфическими антигенами. Кроме того, у очень большой части индивидуумов (от 60 до 100%) можно было выявить распознавание Т-клетками этих пептидов hsp60 со связыванием с вариантами DR(фиг. 5). Эту процентную долю следует считать чрезвычайно высокой, если принять во внимание неудачи предыдущих попыток определить эпитопы для Т-клеток при ЮИА и высокий фон гетерогенных АЧЛ у индивидуумов с ЮИА.- 21006650 Если сравнить эти идентифицированные пептиды с пептидами, которые ранее были идентифицированы в мышиной модели артрита, становится очевидным преимущество данного способа. В предварительных исследованиях на модели адъювантного артрита было показано, что микобактериальный пептидhsp60, содержащий аминокислоты 256-270, может индуцировать защиту от адъювантного артрита. Вслед за обнаружением этого эффекта было предпринято много попыток идентифицировать у индивидуумов с ЮИА наличие Т-клеток, специфических к последовательности 256-270. На основании данных, выданных компьютерным алгоритмом, авторами заявки был сконструирован новый пептид, который был сопоставлен с пептидом из аминокислотных остатков 256-270. Этот новый пептид, а именно фрагмент hsp60 микобактерий с аминокислотами 254-268 (р 1) у большинства индивидуумов с ЮИА индуцировал реакцию Т-клеток, определнную по пролиферации Т-клеток, и продукцию цитокинов; в тоже время пептид 256270 не был обнаружен у индивидуумов с ЮИА. Эти данные представлены на фиг. 6. Таким образом, использование предсказываемого связывания с DR1, DR4 и DR7 дат намного более эффективный путь идентификации эпитопов для Т-клеток у индивидуумов с ЮИА. Пример 3. Идентификация dnaJPI как предшествующего воспалению эпитопа у пациентов с ревматоидным артритом. Пептид белка теплового шока dnaJ был ранее идентифицирован как агент, инициирующий (включающий) пролиферацию Т-клеток и продукцию предшествующих воспалению цитокинов в клетках периферической крови и синовиальной жидкости пациентов с РА. Этот пептид (dnaJP1:QKRAAYDQYGHAAFE) (SEQ ID NO: 10) имеет гомологию аминокислотной последовательности с общим эпитопом ("shared epitope") - протяжнностью из 5 аминокислот, одинаковой в аллелях HLA,связанных с РА. Это исследование представляет собой I фазу изучения иммунной толерантности, проводимого для определения того, участвует ли при РА взаимодействие между АЧЛ и происходящими изdnaJ пептидами в поддержании и стимуляции Т-клеток, участвующих в развитии аутоиммунного воспаления. Изучение (завершено у 13 пациентов) было спланировано так, чтобы удовлетворить 20 критериям оценки эффективности, разработанным American College of Rheumatology (ACR). Данные I фазы: Результаты, приведнные на фиг. 7 А-7 Е и 8 А-8 Е, получены в I фазе исследования, в которой 13 людям - пациентам с РА вводили в течение 6 месяцев три различных дозы dnaJPI qd po. Иммунологические данные. С интервалами в 1 мес проводили мониторинг реакций Т-клеток in vitro на dnaJPI путм измерения пролиферации Т-клеток и продукции цитокинов у пациентов, получавших пептид настоящего изобретения dnaJPI, и у пациентов контрольной группы. В контрольной группе вводили митогены (фитогемагглютинин, ФГА) и не имеющие отношения к тестируемым эффектам пептидыdnaJpV (DERAAYDQYGHAAFE) (SEQ ID NO: 11) - изменнный пептид-лиганд, не обладающий стимулирующим действием у пациентов, и PADRE -сконструированный связывающийся с участками DR пептид (KXVAAWTLKAA) (SEQ ID NO: 12). Результаты измерения пролиферативных реакций Т-клеток в ОКПК 7 пациентов, стимулированных в течение 5 дней 10 тг/мл пептида dnaJPI, представлены на фиг. 7 А-7 Е (измерения методом FACS проводили с интервалом 1 мес). Контрольные опыты (результаты не показаны), параллельные анализу продукции цитокинов методом FACS на фиг. 7 А-7 Е, включали измерения методом FACS продукции предвоспалительных внутриклеточных цитокинов IL-2, ИФН- и TNF-I в ОКПК от 4 пациентов клинического этапа исследований, которым вводили PADRE. Контроли также включали измерения методом FACS продукции толерогенных внутриклеточных цитокинов IL-4 и IL-10 в ОКПК от 4 пациентов клинического этапа исследований, которым вводили PADRE. Учитывая циклическую природу РА, с ремиссиями и рецидивами, и небольшое количество обследованных пациентов, важно показать, что обнаруженные иммунные изменения были вызваны введением препарата и не были связаны с более общим состоянием активации группы пациентов, которые случайно находятся в одной стадии цикла. Были также получены результаты измерений методом FACS продукции внутриклеточных толерогенных цитокинов IL-4 и IL.-10 в ОКПК от 4 не подвергавшихся лечению пациентов, отобранных в 3 различных момента времени и стимулированных dnaJP1. Результаты исследования толерогенности показали, что показанные на фиг. 7 А-7 Е иммунные изменения являются специфичными к введнному препарату и индуцированными введением препарата. На фиг. 8 А-8 Е приведены результаты тестов в соответствии с нормативами Rapid Assessment ofDisease Activity in Rheumatology (RADAR), выполняемых самими пациентами (n = 13), стимулированными dnaJP1, методом самооценки. Хотя были предприняты все усилия, чтобы сохранить объективность оценок, необходимо подчеркнуть, что по самой сути незашифрованного обследования, подобного описанной здесь I фазе, оно может лишь дать тенденцию, относящуюся к эффективности лечения. Согласно 20 критериям ACR, 84,6% пациентов могут быть классифицированы как респонденты. Хотя описанные выше способы и композиции являются типичными способами и композициями,которые могут быть использованы для выполнения определнных аспектов изобретения, могут быть применены и другие процедуры, известные специалистам в данной области. Кроме того, в свете изложенных выше положений возможны многочисленные модификации и вариации настоящего изобретения, поэтому, в пределах сферы охвата приложенной формулы, изобретение- 22006650 может быть осуществлено иными путями, чем конкретно были описаны. Должно быть понятно, что хотя изобретение было описано со ссылкой на приведнное выше детальное описание, подразумевается, что предшествующее описание иллюстрирует, но не ограничивает сферу изобретения. Иные аспекты, преимущества и модификации изобретения входят в сферу действия нижеследующей формулы. Все публикации, патентные заявки, патенты и другие приведнные здесь упоминания включены в настоящее описание в своей полноте ссылкой. Таблица 1 В табл. 1 представлен набор пептидов, отобранных по связыванию с подтипами DR АЧЛ. Таблица показывает (слева направо): номер пептида; происхождение (человеческий или микобактериальный); состав пептидов (жирным шрифтом выделен сердцевинный эпитоп); предсказываемое связывание с DR1,DR4, DR7; показатель связывания со всеми подтипами DR. Пределы отсечения для того, чтобы ещ считать эпитоп хорошо связывающимся, были следующими: DR11,570; DR42,617; DR7 9,106. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ 1. Выделенный пептид, содержащий приблизительно от 10 до 30 аминокислотных остатков, характеризующийся тем, что по меньшей мере 9 аминокислотных остатков пептида состоят из последовательностей, показанных в перечне последовательностей как SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20 или SEQ ID NO: 23. 2. Выделенный пептид по п.1, отличающийся тем, что пептид связывается с подтипами АЧЛ DR1,DR4 и DR7. 3. Выделенный пептид по п.1 или 2, отличающийся тем, что аминокислотная последовательность выбрана из аминокислотной последовательности из белка теплового шока человека или бактериального белка теплового шока. 4. Выделенный пептид по п.3, отличающийся тем, что бактериальный белок теплового шока представляет собой белок теплового шока микобактерий. 5. Выделенный пептид по любому из пп.1-4, отличающийся тем, что пептид имеет степень идентичности не менее 70% с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы, включающей последовательности SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9. 6. Выделенный пептид по любому из пп.1-5, отличающийся тем, что пептид имеет степень идентичности не менее 80% с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы, включающей последовательности SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9. 7. Выделенный пептид по любому из пп.1-6, отличающийся тем, что пептид имеет степень идентичности не менее 90% с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы, включающей последовательности SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9. 8. Выделенный пептид по любому из пп.1-7, отличающийся тем, что пептид имеет степень идентичности не менее 95% с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы, включающей последовательности SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9. 9. Выделенный пептид, характеризующийся тем, что пептид имеет аминокислотную последовательность, выбранную из группы, включающей последовательности SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQID NO: 8 и SEQ ID NO: 9. 10. Выделенный пептид по п.4, отличающийся тем, что белок теплового шока микобактерий представляет собой hsp60. 11. Выделенный пептид по п.3, отличающийся тем, что белок теплового шока человека представляет собой hsp60. 12. Выделенный пептид по любому из пп.1-4, отличающийся тем, что фрагмент имеет длину приблизительно от 15 до 25 аминокислот.- 23006650 13. Выделенный пептид по любому из пп.1-4, отличающийся тем, что фрагмент имеет длину приблизительно от 15 до 20 аминокислот. 14. Выделенный пептид по любому из пп.1-13, отличающийся тем, что пептид имеет одну или более D-аминокислот. 15. Выделенный пептид по любому из пп.1-8 и 10-14, отличающийся тем, что содержит консервативное замещение аминокислот по меньшей мере в одной аминокислотной позиции в пептиде. 16. Выделенный пептид по любому из пп.1-15, отличающийся тем, что пептид ковалентно присоединн к адъюванту. 17. Выделенный пептид по п.16, отличающийся тем, что адъювант представляет собой гемоцианин входного отверстия улитки, бычий сывороточный альбумин, человеческий сывороточный альбумин или изологичный IgG. 18. Фармацевтическая композиция, содержащая пептид, как он определен в любом из пп.1-17, в фармацевтически приемлемом носителе. 19. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что она дополнительно содержит модификатор биологической реакции. 20. Композиция по п.19, отличающаяся тем, что модификатор биологической реакции выбран из цитокина, хемокина, гормона, стероида или интерлейкина. 21. Композиция по п.19, отличающаяся тем, что модификатор биологической реакции представляет собой интерферон. 22. Композиция по п.19, отличающаяся тем, что модификатор биологической реакции выбран из IL1 ( или ), IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-11, IL-12, GM-CSF, M-CSF, G-CSF, LIF,LT, TGF-, -ИФН, TNF-, BCGF, CD2 или ICAM. 23. Применение пептида, как он определен в любом из пп.1-17, в производстве медикамента для лечения или предотвращения опосредованного иммунитетом заболевания у индивидуума, нуждающегося в таком лечении. 24. Применение по п.23, отличающееся тем, что индивидуум является млекопитающим. 25. Применение по п.24, отличающееся тем, что млекопитающее является человеком. 26. Применение по любому из пп.23-25, отличающееся тем, что опосредованное иммунитетом заболевание представляет собой аутоиммунное заболевание. 27. Применение по любому из пп.23-25, отличающееся тем, что опосредованное иммунитетом заболевание выбрано из группы, состоящей из рассеянного склероза, ревматоидного артрита, красной волчанки, диабета I типа, склеродермии, миастении гравис и язвенного колита. 28. Применение по п.23, отличающееся тем, что опосредованное иммунитетом заболевание представляет собой рак. 29. Применение по п.28, отличающееся тем, что рак выбран из группы, состоящей из меланомы,лейкемии, лимфомы, плотных опухолей лгких, печени, почки, мозга, мочевого пузыря, ретинобластомы,саркомы и рака соединительной ткани. 30. Применение по п.23, отличающееся тем, что опосредованное иммунитетом заболевание представляет собой инфекционное заболевание. 31. Применение по любому из пп.23-30, отличающееся тем, что выделенный пептид имеет последовательность, выбранную из группы, включающей SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 или SEQID NO: 9. 32. Применение эффективного количества связывающегося с подтипами DR антигена человеческих лейкоцитов (АЧЛ) выделенного пептида, содержащего фрагмент стрессового белка, который связывается с одной или более молекулами II класса главной системы тканевой совместимости, в производстве медикамента для модуляции иммунного ответа. 33. Применение по п.32, отличающееся тем, что пептид связывается с подтипами АЧЛ DR1, DR4 иDR7. 34. Применение по п.32 или 33, отличающееся тем, что индивидуум является млекопитающим. 35. Применение по п.34, отличающееся тем, что млекопитающее является человеком. 36. Применение по любому из пп.32-35, отличающееся тем, что иммунный ответ связан с опосредованным иммунитетом заболеванием, выбранным из группы, состоящей из рассеянного склероза, ревматоидного артрита, красной волчанки, диабета I типа, склеродермии, миастении гравис и язвенного колита. 37. Применение по любому из пп.32-35, отличающееся тем, что иммунный ответ связан с инфекционным заболеванием. 38. Применение по любому из пп.32-35, отличающееся тем, что иммунный ответ связан с опосредованным иммунитетом раковым заболеванием, выбранным из группы, состоящей из меланомы, лейкемии,лимфомы, плотных опухолей лгких, печени, почки, мозга и мочевого пузыря, ретинобластомы, саркомы и рака соединительной ткани.- 24006650 39. Применение по любому из пп.32-38, отличающееся тем, что выделенный пептид имеет последовательность, выбранную из группы, включающей SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ IDNO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 или SEQ ID NO: 9. 40. Выделенный пептид по п.1, отличающийся тем, что аминокислотная последовательность представляет собой аминокислотную последовательность из белка теплового шока млекопитающего. 41. Выделенный пептид по любому из пп.1-17, отличающийся тем, что пептид получен путем химического синтеза. 42. Выделенный пептид по любому из пп.1-17, отличающийся тем, что пептид получен путем рекомбинантной экспрессии. 43. Выделенный пептид по любому из пп.1-17, отличающийся тем, что пептид гликозилирован. 44. Композиция по любому из пп.18-22, отличающаяся тем, что пептид содержится в жидкой композиции. 45. Композиция по любому из пп.18-22, отличающаяся тем, что пептид содержится в твердой композиции. 46. Выделенный пептид, характеризующийся тем, что аминокислотная последовательность пептида состоит из аминокислотной последовательности, выбранной из группы, включающей SEQ ID NO: 2, SEQID NO: 3 или SEQ ID NO: 6. 47. Композиция, характеризующаяся тем, что она включает фармацевтически приемлемый носитель и выделенный пептид, как он определен в п.46.
МПК / Метки
МПК: C07K 16/18, A61P 19/02, C07K 7/06, A61K 38/10, C07K 7/08, C07K 14/47, A61P 3/10, C07K 14/35, A61K 39/04
Метки: способы, применения, стресс-белки, пептиды
Код ссылки
<a href="https://eas.patents.su/30-6650-stress-belki-i-peptidy-i-sposoby-ih-primeneniya.html" rel="bookmark" title="База патентов Евразийского Союза">Стресс-белки и пептиды и способы их применения</a>
Предыдущий патент: Способ получения антиидиотипических антител к альфа-фетопротеину
Следующий патент: Агонисты гуанилатциклазного рецептора для лечения тканевого воспаления и канцерогенеза
Случайный патент: Подвесной зажим для подвески проводов высоковольтных воздушных кабелей на опорную конструкцию