Антитела к белку steap-1 и их применение
Номер патента: 14870
Опубликовано: 28.02.2011
Авторы: Фейрис Мэри, Чаллита-Эйд Пиа М., Этессами Соудабех, Гьюдас Джин, Цзя Сяо-Чи, Якобовиц Айя, Райтано Артур Б., Перес-Вильяр Хуан Х., Моррисон Карен Дж.
Формула / Реферат
1. Антитело или его фрагмент, содержащие:
(a) определяющую комплементарность область (CDR) из антитела, обозначенного как Х92.1.30.1.1 (1) (АТСС РТА-5802), или из антитела, обозначенного как Х120.545.1.1 (АТСС РТА-5803);
(b) последовательность SEQ ID NO: 50 вариабельной области тяжелой цепи или
(c) последовательность вариабельной области легкой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 54 и SEQ ID NO: 56,
причем антитело или фрагмент антитела согласно (а), (b) или (с) связывается с белком STEAP-1, имеющим последовательность SEQ ID NO: 3.
2. Антитело или его фрагмент по п.1, где антитело является моноклональным антителом.
3. Антитело или его фрагмент по п.2, где антитело представляет собой антитело Х92.1.30.1.1 (1) АТСС РТА-5802.
4. Антитело или его фрагмент по п.2, где антитело представляет собой Х120.545.1.1 (АТСС РТА-5803).
5. Антитело или его фрагмент по п.2, где моноклональное антитело является гуманизированным антителом.
6. Антитело или его фрагмент по п.1, где фрагмент представляет собой фрагмент Fab, F(ab')2, Fv или Sfv.
7. Рекомбинантный белок, содержащий антигенсвязывающий участок антитела по п.1.
8. Антитело или его фрагмент по п.1, связанные с детектируемым маркером, токсином или терапевтическим средством.
9. Антитело или его фрагмент по п.8, где детектируемый маркер выбран из радиоактивного изотопа; соединения, образующего хелатные комплексы с металлами; фермента; флуоресцентного соединения; биолюминесцентного соединения или хемилюминесцентного соединения.
10. Антитело или его фрагмент по п.9, где радиоактивный изотоп выбран из 212Bi, 131I, 131In, 90Y, 186Re, 211At, 125I, 188Re, 153Sm, 213Bi, 32P и Lu.
11. Антитело или его фрагмент по п.8, связанные с токсином.
12. Антитело или его фрагмент по п.11, где токсин выбран из рицина, А-цепи рицина, доксорубицина, даунорубицина, маутанзиноида, таксола, бромида этидия, митомицина, этопозида, тенопозида, винкристина, винбластина, колхицина, дигидроксиантрациндиона, актиномицина, дифтерийного токсина, экзотоксина Pseudomonas (РЕ) А, РЕ40, абрина, А-цепи абрина, А-цепи модексина, альфа-сарцина, гелонина, митогеллина, ретстриктоцина, феномицина, эномицина, курицина, кротина, калихимицина, ингибитора Sapaonaria officinalis, глюкокортикоида, ауристатина, ауромицина, иттрия, висмута, комбрестатина, дуокармицинов, долостатина, сс1065 и цисплатина.
13. Антитело или его фрагмент по п.12, связанные с ауристатином.
14. Трансгенное животное, которое продуцирует моноклональное антитело по п.2.
15. Гибридома, которая продуцирует моноклональное антитело по п.2.
16. Вектор, содержащий полинуклеотид, кодирующий моноклональное антитело по п.2.
17. Вектор по п.16, где антитело, кодируемое полинуклеотидом, представляет собой одноцепочечное моноклональное антитело, содержащее вариабельные области тяжелой и легкой цепей.
18. Фармацевтическая композиция, которая содержит антитело или его фрагмент по п.1 в стандартной лекарственной форме для применения человеком.
19. Способ детектирования наличия белка STEAP-1 в биологическом образце, включающий приведение в контакт указанного образца с антителом по п.1 и детектирование белка STEAP-1 в образце по его связыванию с антителом.
20. Способ по п.19, где указанный биологический образец взят у пациента, который имеет или который предположительно имеет злокачественное заболевание ткани, приведенной в табл. I.
21. Способ по п.20, где указанный биологический образец представляет собой сыворотку.
22. Способ по п.20, в котором биологическим образцом является ткань предстательной железы.
23. Способ по п.20, в котором биологическим образцом является периферическая кровь.
24. Способ по п.23, в котором периферическая кровь содержит раковые клетки предстательной железы.
25. Способ ингибирования роста клеток, экспрессирующих STEAP-1, у субъекта, включающий введение указанному субъекту вектора по п.17, где одноцепочечное моноклональное антитело экспрессируется в указанных клетках.
26. Способ доставки цитотоксического или диагностического средства к клетке, которая экспрессирует белок STEAP-1, включающий получение цитотоксического или диагностического средства, конъюгированного с антителом или его фрагментом по п.1, с образованием конъюгата антитело-средство или фрагмент-средство и воздействие на клетку конъюгатом антитело-средство или фрагмент-средство.
27. Способ по п.26, где цитотоксическое или диагностическое средство выбрано из группы, состоящей из детектируемого маркера, токсина и терапевтического средства.
28. Способ по п.27, где диагностическое средство представляет собой детектируемый маркер, выбранный из радиоактивного изотопа; соединения, образующего хелатные комплексы с металлами; фермента; флуоресцентного соединения; биолюминесцентного соединения и хемилюминесцентного соединения.
29. Способ по п.28, где радиоактивный изотоп выбран из 212Bi, 131I, 131In, 90Y, 186Re, 211At, 125I, 188Re, 153Sm, 213Bi, 32P и Lu.
30. Способ по п.27, где доставляют цитотоксическое средство.
31. Способ по п.30, где цитотоксическое средство представляет собой токсин, выбранный из рицина, А-цепи рицина, доксорубицина, даунорубицина, майтанзиноида, таксола, бромида этидия, митомицина, этопозида, тенопозида, винкристина, винбластина, колхицина, дигидроксиантрациндиона, актиномицина, дифтерийного токсина, экзотоксина Pseudomonas (РЕ) А, РЕ40, абрина, А-цепи абрина, А-цепи модексина, альфа-сарцина, гелонина, митогеллина, ретстриктоцина, феномицина, эномицина, курицина, кротина, калихимицина, ингибитора Sapaonaria officinalis, глюкокортикоида, ауристатина, ауромицина, иттрия, висмута, комбрестатина, дуокармицинов, долостатина, сс1065 и цисплатина.
32. Способ по п.31, в котором токсином является ауристатин.
33. Способ детектирования белка STEAP-1 в тестируемом образце, включающий приведение в контакт тестируемого образца, полученного у пациента, который имеет или который предположительно имеет злокачественную клетку, экспрессирующую STEAP-1, с антителом или фрагментом антитела по п.1 и определение количества STEAP-1 в тестируемом образце по связыванию с антителом или фрагментом антитела.
34. Способ по п.33, дополнительно предусматривающий сравнение количества STEAP-1, связанного с антителом или фрагментом антитела, из тестируемого образца с количеством STEAP-1 из контрольного образца.
35. Способ по п.33, в котором тестируемым образцом является образец крови, мочи, семенной жидкости, предстательной железы, толстой кишки, мочевого пузыря, поджелудочной железы, яичника, шейки матки, семенника, молочной железы, кости, лимфатического узла, легкого, печени, мозга, сыворотки или клеточного препарата.
36. Способ по п.33, в котором тестируемым образцом является образец периферической крови.
37. Способ по п.36, в котором периферическая кровь содержит раковые клетки предстательной железы.
38. Способ по п.34, дополнительно включающий взятие тестируемого образца и контрольного образца у пациента, который имеет или предположительно имеет злокачественное заболевание ткани, приведенной в табл. I.
39. Способ ингибирования роста клеток, которые экспрессируют STEAP-1, предусматривающий воздействие на клетки антителом или фрагментом антитела по п.1.
40. Способ по п.39, в котором клетками являются раковые клетки.
41. Способ по п.40, в котором раковые клетки представляют собой раковые клетки предстательной железы.
42. Способ лечения рака у субъекта, предусматривающий введение субъекту фармацевтической композиции, содержащей антитело или его фрагмент по п.1.
43. Способ по п.42, где раком является рак предстательной железы.
44. Способ ингибирования роста раковых клеток, которые экспрессируют STEAP-1, предусматривающий воздействие на клетки антителом или фрагментом антитела по п.11.
45. Способ по п.44, где антитело или его фрагмент связаны с токсином, выбранным из рицина, А-цепи рицина, доксорубицина, даунорубицина, майтанзиноида, таксола, бромида этидия, митомицина, этопозида, тенопозида, винкристина, винбластина, колхицина, дигидроксиантрациндиона, актиномицина, дифтерийного токсина, экзотоксина Pseudomonas (РЕ) А, РЕ40, абрина, А-цепи абрина, А-цепи модексина, альфа-сарцина, гелонина, митогеллина, ретстриктоцина, феномицина, эномицина, курицина, кротина, калихимицина, ингибитора Sapaonaria officinalis, глюкокортикоида, ауристатина, ауромицина, иттрия, висмута, комбрестатина, дуокармицинов, долостатина, сс1065 и цисплатина.
46. Способ по п.45, в котором токсином является ауристатин.
47. Способ по п.44, где раковые клетки представляют собой раковые клетки злокачественного заболевания ткани, приведенной в табл. I.
48. Способ по п.47, где раковые клетки представляют собой раковые клетки предстательной железы.
49. Способ лечения рака у субъекта, предусматривающий введение субъекту фармацевтической композиции, содержащей антитело или его фрагмент по п.11.
50. Способ по п.49, где антитело или его фрагмент связаны с токсином, выбранным из рицина, А-цепи рицина, доксорубицина, даунорубицина, майтанзиноида, таксола, бромида этидия, митомицина, этопозида, тенопозида, винкристина, винбластина, колхицина, дигидроксиантрациндиона, актиномицина, дифтерийного токсина, экзотоксина Pseudomonas (РЕ) А, РЕ40, абрина, А-цепи абрина, А-цепи модексина, альфа-сарцина, гелонина, митогеллина, ретстриктоцина, феномицина, эномицина, курицина, кротина, калихимицина, ингибитора Sapaonaria officinalis, глюкокортикоида, ауристатина, ауромицина, иттрия, висмута, комбрестатина, дуокармицинов, долостатина, сс1065 и цисплатина.
51. Способ по п.50, в котором токсином является ауристатин.
52. Способ по п.49, где раком является рак предстательной железы.
53. Антитело или его фрагмент, содержащие все определяющие комплементарность области (CDR) тяжелой цепи и легкой цепи из антитела, обозначенного Х92.1.30.1.1 (1) (АТСС РТА-5802), или антитела, обозначенного Х120.545.1.1 (АТСС РТА-5803), причем антитело или фрагмент антитела связывается с белком STEAP-1, имеющим последовательность SEQ ID NO: 3.
54. Антитело или его фрагмент, содержащие последовательность SEQ ID NO: 50 вариабельной области тяжелой цепи и последовательность вариабельной области легкой цепи, выбранную из группы, состоящей из последовательности SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 54 и SEQ ID NO: 56, причем антитело или фрагмент антитела связывается с белком STEAP-1, имеющим последовательность SEQ ID NO: 3.
55. Антитело или его фрагмент, которое представляет собой гуманизированную или модифицированную форму моноклонального антитела Х92.1.30.1.1 (1) (АТСС РТА-5802), где антитело или его фрагмент специфически связывается с белком STEAP-1, имеющим последовательность SEQ ID NO: 3.
56. Антитело или его фрагмент, которое представляет собой гуманизированную или модифицированную форму моноклонального антитела Х120.545.1.1 (АТСС РТА-5803), где антитело или его фрагмент специфически связывается с белком STEAP-1, имеющим последовательность SEQ ID NO: 3.
57. Антитело или его фрагмент по пп.53-56, связанные с детектируемым маркером, токсином или терапевтическим средством.
58. Антитело или его фрагмент по п.57, где детектируемый маркер выбран из радиоактивного изотопа; соединения, образующего хелатные комплексы с металлами; фермента; флуоресцентного соединения; биолюминесцентного соединения или хемилюминесцентного соединения.
59. Антитело или его фрагмент по п.57, связанные с токсином.
60. Антитело или его фрагмент по п.59, где токсин выбран из рицина, А-цепи рицина, доксорубицина, даунорубицина, маутанзиноида, таксола, бромида этидия, митомицина, этопозида, тенопозида, винкристина, винбластина, колхицина, дигидроксиантрациндиона, актиномицина, дифтерийного токсина, экзотоксина Pseudomonas (РЕ) А, РЕ40, абрина, А-цепи абрина, А-цепи модексина, альфа-сарцина, гелонина, митогеллина, ретстриктоцина, феномицина, эномицина, курицина, кротина, калихимицина, ингибитора Sapaonaria officinalis, глюкокортикоида, ауристатина, ауромицина, иттрия, висмута, комбрестатина, дуокармицинов, долостатина, сс1065 и цисплатина.
61. Антитело или его фрагмент по п.60, связанные с ауристатином.
62. Способ ингибирования роста раковых клеток, которые экспрессируют STEAP-1, предусматривающий воздействие на клетки антителом или фрагментом антитела по п.59.
63. Способ по п.62, где антитело или его фрагмент связаны с токсином, выбранным из рицина, А-цепи рицина, доксорубицина, даунорубицина, майтанзиноида, таксола, бромида этидия, митомицина, этопозида, тенопозида, винкристина, винбластина, колхицина, дигидроксиантрациндиона, актиномицина, дифтерийного токсина, экзотоксина Pseudomonas (РЕ) А, РЕ40, абрина, А-цепи абрина, А-цепи модексина, альфа-сарцина, гелонина, митогеллина, ретстриктоцина, феномицина, эномицина, курицина, кротина, калихимицина, ингибитора Sapaonaria officinalis, глюкокортикоида, ауристатина, ауромицина, иттрия, висмута, комбрестатина, дуокармицинов, долостатина, сс1065 и цисплатина.
64. Способ по п.62, в котором токсином является ауристатин.
65. Способ по п.44, где раковые клетки представляют собой раковые клетки злокачественного заболевания ткани, приведенной в табл. I.
66. Способ по п.65, где раковые клетки представляют собой раковые клетки предстательной железы.
67. Способ лечения рака у субъекта, предусматривающий введение субъекту фармацевтической композиции, содержащей антитело или его фрагмент по п.59.
68. Способ по п.67, где антитело или его фрагмент связаны с токсином, выбранным из рицина, А-цепи рицина, доксорубицина, даунорубицина, майтанзиноида, таксола, бромида этидия, митомицина, этопозида, тенопозида, винкристина, винбластина, колхицина, дигидроксиантрациндиона, актиномицина, дифтерийного токсина, экзотоксина Pseudomonas (РЕ) А, РЕ40, абрина, А-цепи абрина, А-цепи модексина, альфа-сарцина, гелонина, митогеллина, ретстриктоцина, феномицина, эномицина, курицина, кротина, калихимицина, ингибитора Sapaonaria officinalis, глюкокортикоида, ауристатина, ауромицина, иттрия, висмута, комбрестатина, дуокармицинов, долостатина, сс1065 и цисплатина.
69. Способ по п.68, в котором токсином является ауристатин.
70. Способ по п.67, где раком является рак предстательной железы.
Текст
В настоящем изобретении приведено описание антител и полученных из них молекул, которые связываются с новым белком STEAP-1 и его вариантами, где STEAP-1 обладает тканеспецифической экспрессией в нормальных взрослых тканях и аберрантно экспрессируется в раковых тканях, перечисленных в табл. I. Следовательно, STEAP-1 представляет собой диагностическую,прогностическую, профилактическую и/или терапевтическую мишень для противораковой терапии. Ген STEAP-1, или его фрагмент, или кодируемый им белок, или его варианты, или его фрагменты можно использовать для индуцирования гуморального или клеточного иммунного ответа; антитела или Т-клетки, способные взаимодействовать со STEAP-1, можно использовать для активной или пассивной иммунизации. 014870 Права на изобретения, сделанные в результате исследований, финансируемых федеральным правительством В данном случае неприменимы. Область изобретения Описанное в данном документе изобретение относится к антителам, а также к их связывающим фрагментам и молекулам, полученным из них методом генной инженерии, которые связываются с белками, называемыми STEAP-1. Данное изобретение также относится к диагностическим, прогностическим, профилактическим и терапевтическим способам, а также к композициям, которые можно использовать для лечения злокачественных заболеваний, сопровождающихся экспрессией STEAP-1. Предпосылки создания изобретения Рак является второй из основных причин смертности среди людей после ишемической болезни сердца. Во всем мире каждый год от рака умирают миллионы людей. Только в Соединенных Штатах, по данным Американского общества по борьбе с раком, рак является причиной смерти более полумиллиона людей ежегодно, причем каждый год диагностируется более 1,2 миллионов новых случаев. В то время как смертность от сердечных заболеваний значительно снизилась, смертность от рака в целом возрастает. Ожидается, что в начале следующего столетия рак станет главной причиной смертности. Во всем мире выделяют несколько типов рака, как наиболее опасных для жизни. В частности, карциномы легких, простаты, молочной железы, толстой кишки, поджелудочной железы, яичников и мочевого пузыря являются основными причинами смерти от злокачественных заболеваний. Указанные и практически все другие карциномы имеют общий летальный характер. За немногими исключениями,метастатическая карцинома приводит к смертельному исходу. Кроме того, опыт показывает, что, даже если пациенты выживают после первичного злокачественного заболевания, их жизнь сильно изменяется. Многие раковые пациенты испытывают сильное беспокойство, сознавая возможность рецидива или того,что лечение может быть неудачным. После лечения многие раковые пациенты испытывают сильную слабость. Кроме того, у многих раковых пациентов наблюдаются рецидивы. Во всем мире рак простаты является четвертым по распространенности среди злокачественных заболеваний у мужчин. В Северной Америке и в Северной Европе он, несомненно, является наиболее распространенным злокачественным заболеванием у мужчин и второй из основных причин смертности среди мужчин. Только в Соединенных Штатах от данного заболевания ежегодно умирает значительно более 30000 мужчин - второе место по смертности после рака легких. Несмотря на величину данных цифр, пока еще не существует эффективного лечения метастазирующего рака простаты. Основными способами лечения продолжают оставаться хирургическая простатэктомия, лучевая терапия, антигормональная терапия, хирургическая кастрация и химиотерапия. К сожалению, данные способы лечения во многих случаях являются неэффективными и зачастую связаны с нежелательными последствиями. С точки зрения диагностики отсутствие маркера опухоли простаты, который позволяет осуществлять точную диагностику локализованных опухолей на ранней стадии, остается существенным препятствием для диагностики и лечения данного заболевания. Хотя анализ сывороточного специфического антигена простаты (PSA) является очень полезным инструментом, общепризнано, что в некоторых важных аспектах он обладает недостаточной специфичностью и недостаточной общей функциональностью. Прогресс в идентификации других маркеров, специфичных для рака простаты, был достигнут в результате применения ксенотрансплантатов рака простаты, которые позволяют воспроизводить разные стадии данного заболевания у мышей. Ксенотрансплантаты LAPC (Los Angeles Prostate Cancer) представляют собой ксенотрансплантаты рака простаты, которые перенесли пересадку мышам с тяжелым комбинированным иммунодефицитом (SCID) и которые способны имитировать переход от зависимости от андрогенов к независимости от андрогенов (Klein et al., 1997, Nat. Med. 3: 402). Идентифицированные позже маркеры рака простаты включают в себя РСТА-1 (Su et al., 1996, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93: 7252), простата-специфичный мембранный (PSM) антиген (Pinto et al., Clin. Cancer Res. 2 Sep., 1996 (9): 1445-51), STEAP (Hubert, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 7 Dec., 1999; 96(25): 14523-8) и антиген стволовых клеток, дифференцирующихся в клетки простаты (PSCA) (Reiter et al., 1998, Proc. Natl. Acad. Sci.USA, 95: 1735). Хотя ранее идентифицированные маркеры, такие как PSA, PSM, РСТА и PSCA, помогают диагностировать и лечить рак простаты, еще существует потребность в идентификации других маркеров и терапевтических мишеней, специфичных для рака простаты и родственных заболеваний, которые позволили бы усовершенствовать способы диагностики и лечения. Почечно-клеточная карцинома (RCC) составляет приблизительно 3% от злокачественных заболеваний взрослых. Если диаметр аденомы достигает 2-3 см, существует возможность злокачественного перерождения. У взрослых двумя основными злокачественными опухолями почек являются почечноклеточная аденокарцинома и переходно-клеточная карцинома почечной лоханки или мочеточника. В США зарегистрировано более 29000 случаев почечно-клеточной аденокарциномы, причем в 1998 г. от данного заболевания умерло более 11600 пациентов. Переходно-клеточная карцинома встречается реже,в Соединенных Штатах диагностируется приблизительно 500 случаев в год.-1 014870 В течение многих десятилетий хирургия была основным способом лечения почечно-клеточной аденокарциномы. До последнего времени метастазирующие заболевания не поддавались никакому системному лечению. Последние разработки в области системной терапии, в особенности иммунотерапии, позволили найти кардинальный подход к лечению метастазирующей почечно-клеточной карциномы у соответствующих пациентов, который обеспечивает вероятность устойчивых ответов. Тем не менее, остается потребность в эффективных способах лечения данных пациентов. Среди новых случаев рака, зарегистрированных в Соединенных Штатах, рак мочевого пузыря составляет приблизительно 5% у мужчин (пятое место среди наиболее распространенных новообразований) и 3% у женщин (восьмое место среди наиболее распространенных новообразований). Заболеваемость медленно возрастает с увеличением возраста популяции. В 1998 г. было зарегистрировано 54500 случаев, в том числе 39500 у мужчин и 15000 у женщин. Связанная с возрастом заболеваемость в Соединенных Штатах составляет 32 на 100000 у мужчин и 8 на 100000 у женщин. Исторически сложившееся соотношение заболеваемости у мужчин/женщин 3:1 может уменьшаться вследствие увеличения курящих женщин. В 1998 г. зарегистрировано 11000 смертей от рака мочевого пузыря (7800 у мужчин и 3900 у женщин). Заболеваемость раком мочевого пузыря и смертность от данного заболевания сильно увеличиваются с возрастом и представляют собой проблему, возрастающую по мере увеличения возраста популяции. Большинство злокачественных заболеваний мочевого пузыря рецидивируют в мочевом пузыре. Рак мочевого пузыря лечат сочетанием трансуретральной резекции мочевого пузыря (TUR) и внутрипузырной химиотерапии или иммунотерапии. Многоочаговый и рецидивирующий характер рака мочевого пузыря ограничивает применение TUR. Большинство проникающих в мышцы раковых опухолей нельзя вылечить с помощью одной TUR. Радикальная цистэктомия с отводом мочи является наиболее эффективным средством устранения раковой опухоли, но сопровождается нежелательным воздействием на мочевыводящие и половые функции. Соответственно, остается настоятельная потребность в способах лечения, благоприятно воздействующих на пациентов с раком мочевого пузыря. В 2000 г. в Соединенных Штатах зарегистрировано 130200 случаев колоректального рака, в том числе 93800 случаев рака толстой кишки и 36400 случаев рака прямой кишки. Колоректальный рак занимает третье место среди наиболее распространенных злокачественных заболеваний у мужчин и женщин. В период 1992-1996 гг. коэффициент заболеваемости значительно снизился (-2,1% в год). Исследования показывают, что данное снижение обусловлено увеличением скрининга населения и удалением полипов, позволяющим предотвратить их развитие до инвазивных злокачественных заболеваний. В 2000 г. зарегистрировано 56300 смертей (47700 от рака толстой кишки и 8600 от рака прямой кишки),что составляет приблизительно 11% от всех смертельных исходов злокачественных заболеваний в США. В настоящее время хирургия является наиболее распространенным способом лечения колоректального рака и при отсутствии метастазирования часто дает положительный результат. Химиотерапию, или химиотерапию в сочетании с лучевой терапией, назначают до или после хирургической операции большинству пациентов, у которых раковая опухоль глубоко проникает в стенки кишечника или метастазирует в лимфатические узлы. При раке толстой кишки и при раке прямой кишки иногда требуется постоянная колостомия (открытие брюшной полости для удаления экскрементов). Следовательно, существует потребность в эффективных способах диагностики и лечения колоректального рака. В 2000 г. зарегистрировано 164100 новых случаев рака легких и бронхов, что составляет 14% от всех раковых диагнозов в США. Коэффициент заболеваемости раком легких и бронхов значительно снизился: от 86,5 на 100000 человек в 1984 г. до 70,0 в 1996 г. В 1990-х гг. скорость увеличения заболеваемости среди женщин начала снижаться. В 1996 г. коэффициент заболеваемости у женщин составлял 42,3 на 100000 человек. В 2000 г. было зарегистрировано 156900 смертей от рака легких и бронхов, что составляет 28% от общей смертности от злокачественных заболеваний. В период 1992-1996 гг. смертность от рака легких среди мужчин значительно снизилась (-1,7% в год), тогда как смертность среди женщин еще заметно росла (0,9% в год). С 1987 г. от рака легких каждый год умирало больше женщин, чем от рака молочной железы, который в течение 40 лет был основной причиной смертей от злокачественных заболеваний среди женщин. Снижение заболеваемости раком легких и смертности от данного заболевания, скорее всего,является следствием уменьшения курения в течение предыдущих 30 лет; однако по уменьшению курения женщины отстают от мужчин. Интересно, что в то время как снижение употребления табака у взрослых замедляется, у подростков употребление табака снова увеличивается. Способы лечения рака легких и бронхов зависят от типа и стадии рака и включают в себя хирургическое лечение, лучевую терапию и химиотерапию. Для лечения многих локализованных раковых опухолей обычно выбирают хирургию. Поскольку данное заболевание обычно распространяется со времени его обнаружения, наряду с хирургическим лечением обычно требуется лучевая терапия и химиотерапия. При мелкоклеточном раке легких обычно выбирают химиотерапию, отдельно или в сочетании с лучевой терапией; при таком режиме лечения у пациентов часто наступает ремиссия, которая в некоторых случаях может быть длительной. Однако продолжает существовать потребность в эффективных способах лечения и диагностики рака легких и бронхов.-2 014870 В течение 2000 г. в США было зарегистрировано 182800 новых случаев инвазивного рака молочной железы. Кроме того, в 2000 г. было диагностировано приблизительно 1400 новых случаев рака молочной железы у мужчин. После увеличения приблизительно до 4% в год в 1980 г. коэффициент заболеваемости раком молочной железы у женщин снизился в 1990 г. приблизительно до 110,6 случаев на 100000 человек. В 2000 г. только в США было зарегистрировано 41200 смертей (40800 женщин, 400 мужчин) от рака молочной железы. Смертность от рака молочной железы занимает второе место среди смертности от злокачественных заболеваний у женщин. В соответствии с последними данными коэффициент смертности значительно снизился в период 1992-1996 гг., причем сильнее всего он снизился у молодых женщин как с белой кожей, так и с черной. Возможно, данное снижение является результатом более ранней диагностики и усовершенствования лечения. С учетом медицинских обстоятельств и предпочтений пациента лечение рака молочной железы может включать в себя лампэктомию (локальное удаление опухоли) и удаление лимфатических узлов под мышкой; мастэктомию (хирургическое удаление молочной железы) и удаление лимфатических узлов под мышкой; лучевую терапию; химиотерапию; или гормональную терапию. Часто используют сочетание двух или более способов. Многочисленные исследования показали, что в случае ранней стадии заболевания продолжительность жизни после лампэктомии в сочетании с лучевой терапией подобна продолжительность жизни после модифицированной радикальной мастэктомии. Значительные достижения в восстановительной технологии предоставляют некоторые возможности для воссоздания молочной железы после мастэктомии. Недавно такое воссоздание было осуществлено одновременно с мастэктомией. Локальное удаление протоковой карциномы in situ (DCIS) вместе с соответствующими количествами окружающей нормальной ткани молочной железы может предотвратить местный рецидив DCIS. Облучение молочной железы и/или обработка тамоксифеном могут уменьшить вероятность возникновенияDCIS в оставшейся ткани молочной железы. Это важно, поскольку DCIS, при отсутствии лечения, может развиться в инвазивный рак молочной железы. Тем не менее, указанные способы лечения имеют серьезные побочные эффекты или последствия. Следовательно, существует потребность в эффективных способах лечения рака молочной железы. В 2000 г. в Соединенных Штатах зарегистрировано 23100 новых случаев рака яичников. Данное заболевание составляет 4% от всех злокачественных заболеваний у женщин и занимает второе место среди гинекологических злокачественных заболеваний. В период 1992-1996 гг. коэффициент заболеваемости раком яичников значительно снизился. В 2000 г. зарегистрировано 14000 смертей от рака яичников. Рак яичников вызывает больше смертей, чем любое другое злокачественное заболевание женской репродуктивной системы. Для лечения рака яичников используют хирургию, лучевую терапию и химиотерапию. Хирургия обычно включает в себя удаление одного или обоих яичников, фаллопиевых труб (удаление придатков матки) и матки (гистерэктомия). В случае некоторых опухолей на ранней стадии удаляют только пораженный яичник, особенно если пациентом является молодая женщина, желающая иметь детей. В случае запущенного заболевания, чтобы увеличить эффект химиотерапии, делают попытку удалить все внутрибрюшинные пораженные органы. Таким образом, остается потребность в эффективных способах лечения рака яичников. В 2000 г. в Соединенных Штатах зарегистрировано 28300 новых случаев рака поджелудочной железы. В течение последних 20 лет заболеваемость раком поджелудочной железы у мужчин уменьшилась. Заболеваемость среди женщин остается приблизительно постоянной, но есть тенденция к уменьшению. В 2000 г. в Соединенных Штатах зарегистрировано 28200 смертей от рака поджелудочной железы. Смертность среди мужчин за последние 20 лет немного, но значимо уменьшилась (приблизительно -0,9% в год), в то время как смертность среди женщин несколько увеличилась. Для лечения рака поджелудочной железы используют хирургию, лучевую терапию и химиотерапию. Указанные способы лечения могут увеличивать выживаемость и/или облегчать симптомы у многих пациентов, но в большинстве случаев они не приводят к излечению. Существует настоятельная потребность в дополнительных способах лечения и диагностики злокачественных заболеваний. Указанные способы лечения включают в себя применение антител, вакцин и маленьких молекул. Кроме того, существует потребность в применении данных способов в качестве инструментов исследования для диагностики, детектирования, мониторинга и развития уровня техники во всех областях лечения и исследования злокачественных заболеваний.-3 014870 Краткое описание изобретения В данном изобретении предложены антитела, а также их связывающие фрагменты и молекулы, полученные из них методом генной инженерии, которые связываются с белками STEAP-1 и полипептидными фрагментами белков STEAP-1. В данном описании термин STEAP-1 является синонимом 8P1D4. Данное изобретение включает в себя поликлональные и моноклональные антитела, антитела мышей и других млекопитающих, химерные антитела, гуманизированные и полноразмерные человеческие антитела, а также антитела, меченные детектируемым маркером или терапевтическим средством. В некоторых воплощениях существует условие, что полная нуклеотидная последовательность (фиг. 2) не кодируется и/или полная аминокислотная последовательность (фиг. 2) не синтезируется. В других воплощениях полная нуклеотидная последовательность (фиг. 2) кодируется и/или полная аминокислотная последовательность (фиг. 2) синтезируется, каждая из которых входит в состав стандартных лекарственных форм для применения человеком. В данном изобретении также предложены способы детектирования присутствия и статуса полинуклеотидов и белков STEAP-1 в разных биологических образцах, а также способы идентификации клеток,экспрессирующих STEAP-1. В одном воплощении согласно изобретению предложены способы детектирования генных продуктов STEAP-1 в ткани или гематологическом образце, в котором имеет место, или предположительно имеет место, нарушение регуляции роста, например, в образце раковой ткани. В данном изобретении также предложены разные иммуногенные или терапевтические композиции и стратегии для лечения злокачественных заболеваний, при которых происходит экспрессия STEAP-1,таких как злокачественные заболевания тканей, перечисленные в табл. I, в том числе способы лечения,обспечивающие ингибирование транскрипции, трансляции, процессинга или функционированияSTEAP-1, а также противораковые вакцины. В одном аспекте согласно изобретению предложены композиции и способы с применением данных композиций для лечения рака, при котором происходит экспрессия STEAP-1, у человека, где композиция содержит носитель, подходящий для человека, и человеческую разовую дозу одного или нескольких средств, ингибирующих продукцию или функционированиеSTEAP-1. Предпочтительно носитель представляет собой однозначно человеческий носитель. В другом аспекте согласно изобретению средство представляет собой молекулу, обладающую иммунореактивностью по отношению к белку STEAP-1. Неограничивающие примеры таких молекул включают в себя, без ограничения, антитела (такие как одноцепочечные, моноклональные, поликлональные, гуманизированные, химерные или человеческие антитела), их функциональные эквиваленты (либо природные, либо синтетические) и их сочетания. Антитела можно конъюгировать с диагностическим или терапевтическим фрагментом. В другом аспекте средство представляет собой маленькую молекулу, как указано в данном описании. В другом воплощении средство включает в себя один или несколько пептидов, содержащих эпитоп цитотоксического Т-лимфоцита (CTL), который связывается с молекулой HLA класса I в организме человека и вызывает ответ CTL на STEAP-1, и/или один или несколько пептидов, содержащих эпитоп хелперного Т-лимфоцита (HTL), который связывается с молекулой HLA класса II в организме человека и вызывает ответ HTL. Пептиды согласно изобретению могут находиться на одной и той же или на одной или нескольких разных полипептидных молекулах. В другом аспекте согласно изобретению средство включает в себя одну или несколько молекул нуклеиновых кислот, экспрессирующих один или несколько пептидов, стимулирующих ответ CTL или HTL, как описано выше. В следующем аспекте согласно изобретению одна или несколько молекул нуклеиновых кислот могут экспрессировать фрагмент, обладающий иммунологической реактивностью в отношении STEAP-1, как описано выше. Одна или несколько молекул нуклеиновых кислот могут представлять собой молекулы, которые ингибируют продукцию STEAP-1, или они могут кодировать такие молекулы. Неограничивающие примеры таких молекул включают в себя, без ограничения, молекулы, комплементарные нуклеотидной последовательности,необходимой для продукции STEAP-1 (например, антисмысловые последовательности молекул, которые образуют тройную спираль с нуклеотидной двойной спиралью, необходимой для продукции STEAP-1),или рибозим, способный лизировать мРНК STEAP-1. Другое воплощение согласно изобретению относится к эпитопам антител, включающим в себя пептидные участки, или олигонуклеотидам, кодирующим пептидные участки, которые имеют один, два, три,четыре или пять из нижеследующих признаков:i) пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5 аминокислот конкретного пептида, приведенного на фиг. 3, с любым целочисленным приращением вплоть до полного размера белка, изображенного на фиг. 3, который содержит аминокислотное положение, имеющее значение по профилю гидрофильности, приведенному на фиг. 5, равное или превышающее 0,5, 0,6, 0,7, 0,8, 0,9 или равное 1,0;ii) пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5 аминокислот конкретного пептида, приведенного на фиг. 3, с любым целочисленным приращением вплоть до полного размера белка, изображенного на фиг. 3, который содержит аминокислотное положение, имеющее значение по профилю гидропатичности, приведенному на фиг. 6, равное или превышающее 0,5, 0,4, 0,3, 0,2, 0,1 или равное 0,0;iii) пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5 аминокислот конкретного пептида, приведенного на фиг. 3, с любым целочисленным приращением вплоть до полного размера белка, изображенного на фиг. 3, который содержит аминокислотное положение, имеющее значение по профилю процента доступных остатков, приведенному на фиг. 7, равное или превышающее 0,5, 0,6, 0,7, 0,8, 0,9 или равное 1,0;iv) пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5 аминокислот конкретного пептида, приведенного на фиг. 3, с любым целочисленным приращением вплоть до полного размера белка, изображенного на фиг. 3, который содержит аминокислотное положение, имеющее значение по профилю средней жесткости, приведенному на фиг. 8, равное или превышающее 0,5, 0,6, 0,7, 0,8, 0,9 или равное 1,0; илиv) пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5 аминокислот конкретного пептида, приведенного на фиг. 3, с любым целочисленным приращением вплоть до полного размера белка, изображенного на фиг. 3, который содержит аминокислотное положение, имеющее значение по профилю бета-складки, приведенному на фиг. 9, равное или превышающее 0,5, 0,6, 0,7, 0,8, 0,9 или равное 1,0. Настоящее изобретение также относится к гену, обозначаемому STEAP-1, сверхэкспрессия которого наблюдается при злокачественных заболеваниях, перечисленных в табл. I. Анализ экспрессии генаSTEAP-1 методом нозерн-блоттинга в нормальных тканях показывает ограниченный характер экспрессии во взрослых тканях. Приведены нуклеотидная (фиг. 2) и аминокислотная (фиг. 2 и 3) последовательности STEAP-1. Тканевый профиль STEAP-1 для нормальных взрослых тканей, наряду со сверхэкспрессией, наблюдающейся в тканях, перечисленных в табл. I, показывает, что, по меньшей мере, в некоторых раковых опухолях наблюдается аберрантная сверхэкспрессия STEAP-1, следовательно, STEAP-1 может служить мишенью в способах диагностики, профилактики, прогноза и/или лечения злокачественных заболеваний тканей, таких как перечисленные в табл. I. Данное изобретение предлагает полинуклеотиды, соответствующие или комплементарные полноразмерным или частичным генам, мРНК и/или кодирующим последовательностям STEAP-1, предпочтительно выделенные, в том числе полинуклеотиды, кодирующие белки, родственные STEAP-1, и фрагменты, содержащие 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 или более 25 последовательных аминокислот; по меньшей мере 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 80, 85, 90, 95, 100 или более 100 последовательных аминокислот белка, родственного STEAP-1, a также сами пептиды/белки; ДНК, РНК, ДНК/РНК гибриды и родственные молекулы, полинуклеотиды или олигонуклеотиды, комплементарные или по меньшей мере на 90% гомологичные последовательностям генов или мРНКSTEAP-1 или их частям, и полинуклеотиды или олигонуклеотиды, которые гибридизуются с генами и мРНК STEAP-1 или с полинуклеотидами, кодирующими STEAP-1. Также предлагаются способы выделения кДНК и генов, кодирующих STEAP-1. Кроме того, предлагаются рекомбинантные молекулы ДНК,содержащие полинуклеотиды STEAP-1, клетки, трансформированные или преобразованные такими молекулами, и системы хозяин-вектор для экспрессии генных продуктов STEAP-1. Краткое описание чертежей В данном описании термин STEAP-1 включает в себя все варианты, в том числе приведенные на фиг. 10, 11 и/или 12, если контекст однозначно не указывает иначе. Фиг. 1. SSH последовательность STEAP-1, содержащая 436 нуклеотидов. Фиг. 2 А. кДНК и аминокислотная последовательность 1 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 1" или "1 вариант STEAP-1"). Стартовый метионин подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 66-1085, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2 В. кДНК и аминокислотная последовательность 2 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 2"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2 С. кДНК и аминокислотная последовательность 3 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 3"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-944, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2D. кДНК и аминокислотная последовательность 4 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 4"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2 Е. кДНК и аминокислотная последовательность 5 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 5"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2F. кДНК и аминокислотная последовательность 6 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 6"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2G. кДНК и аминокислотная последовательность 7 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 7"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон."STEAP-1 v. 8"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2I. кДНК и аминокислотная последовательность 9 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 9"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2J. кДНК и аминокислотная последовательность 10 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 10"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2K. кДНК и аминокислотная последовательность 11 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 11"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2L. кДНК и аминокислотная последовательность 12 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 12"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2 М. кДНК и аминокислотная последовательность 13 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 13"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2N. кДНК и аминокислотная последовательность 14 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 14"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2O. кДНК и аминокислотная последовательность 15 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 15"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2 Р. кДНК и аминокислотная последовательность 16 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 16"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. Фиг. 2Q. кДНК и аминокислотная последовательность 17 варианта STEAP-1 (также называемого"STEAP-1 v. 17"). Кодон, кодирующий стартовый метионин, подчеркнут. В открытую рамку считывания входят нуклеотиды 96-872, в том числе стоп-кодон. В данном описании термин STEAP-1 включает в себя все варианты, в том числе приведенные на фиг. 10, 11 и/или 12, если контекст однозначно не указывает иначе. Фиг. 3A. Аминокислотная последовательность STEAP-1 v. 1, содержащая 339 аминокислот. Фиг. 3 В. Аминокислотная последовательность STEAP-1 v. 2, содержащая 258 аминокислот. Фиг. 3 С. Аминокислотная последовательность. STEAP-1 v. 3, содержащая 282 аминокислоты. Фиг. 3D. Аминокислотная последовательность STEAP-1 v. 4, содержащая 258 аминокислот. Фиг. 4 А. Сравнительный анализ первичной структуры аминокислотной последовательностиSTEAP-1 v. 1 и мышиного TNFoc-индуцированного белка жировой ткани (gi/16905133). Фиг. 4 В. Сравнительный анализ первичной структуры аминокислотной последовательностиSTEAP-1 v. 1 и крысиного белка pHyde (gi/21717655/). Фиг. 4 С. Показывает гомологию STEAP-1 и мышиного эпителиального антигена простаты, содержащего шесть трансмембранных доменов (gi20820492). Фиг. 5A. Гидрофильность аминокислотного профиля 1 варианта STEAP-1. Фиг. 5B. Гидрофильность аминокислотного профиля 3 варианта STEAP-1. Гидрофильность определена путем компьютерного анализа последовательности по способу Норрand Woods (Норр Т.P., Woods K.R., 1981. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 78: 3824-3828), который можно найти на web-сайте ProtScale, расположенном в глобальной сети URL ch/cgi-bin/protscale.pi), через сервер молекулярной биологии ExPasy. Фиг. 6A. Гидропатичность аминокислотного профиля 1 варианта STEAP-1. Фиг. 6B. Гидропатичность аминокислотного профиля 3 варианта STEAP-1, определенная путем компьютерного анализа последовательности по способу Kyte and Doolittle (Kyte J., Doolittle R.F., 1982. J.Mol. Biol. 157:105-132), который можно найти на web-сайте ProtScale, расположенном в глобальной сетиURL expasy.ch/cgi-bin/protscale.pi) через сервер молекулярной биологии ExPasy. Фиг. 7A. Профиль процента доступных аминокислотных остатков 1 варианта STEAP-1. Фиг. 7B. Профиль процента доступных аминокислотных остатков 3 варианта STEAP-1, определенный путем компьютерного анализа последовательности по способу Janin (Janin J., 1979 Nature,277: 491-492), который можно найти на web-сайте ProtScale, расположенном в глобальной сети URLexpasy.ch/cgi-bin/protscale.pi) через сервер молекулярной биологии ExPasy. Фиг. 8A. Аминокислотный профиль средней жесткости 1 варианта STEAP-1. Фиг. 8B. Аминокислотный профиль средней жесткости 3 варианта STEAP-1, определенный путем компьютерного анализа последовательности по способу Bhaskaran and Ponnuswamy (Bhaskaran R., andPonnuswamy P.K., 1988. Int. J. Pept. Protein Res. 32: 242-255), который можно найти на web-сайтеProtScale, расположенном в глобальной сети URL expasy.ch/cgi-bin/protscale.pi) через сервер молекулярной биологии ExPasy. Фиг. 9A. Аминокислотный профиль бета-складки 1 варианта STEAP-1. Фиг. 9B. Аминокислотный профиль бета-складки 3 варианта STEAP-1, определенный путем компьютерного анализа последовательности по способу Deleage and Roux (Deleage, G., Roux B. 1987 ProteinEngineering, 1: 289-294), который можно найти на web-сайте ProtScale, расположенном в глобальной сетиURL expasy.ch/cgi-bin/protscale.pi) через сервер молекулярной биологии ExPasy. Фиг. 10. Схематический сравнительный анализ вариантов SNP STEAP-1. Варианты STEAP-1 v. 4-v. 17 представляют собой варианты с единичными нуклеотидными различиями по сравнению со STEAP-1 v. 2. Хотя указанные варианты SNP показаны отдельно, они могут встречаться в любых сочетаниях и в любых транскрипционных вариантах, которые содержат пары оснований, например STEAP-1 v. 1 и v. 3. Нумерация соответствует нумерации STEAP-1 v. 2. Черные прямоугольники обозначают последовательности, совпадающие с последовательностями STEAP-1 v. 2. SNP указаны над прямоугольниками. Фиг. 11. Состав экзонов транскрипционных вариантов STEAP-1. На данной фигуре показана структура транскрипционных вариантов без хвоста поли А. ВариантыSTEAP-1 v. 1, v. 2 и v. 3 представляют собой транскрипционные варианты, содержащие одинаковые экзоны 2 и 3. Первый экзон STEAP-1 v. 1 на 30 оснований короче по 5'-концу, чем первые экзоны двух других транскрипционных вариантов. Четвертый экзон STEAP-1 v. 2 аналогичен объединенным экзону 4,интрону 4 и экзону 5 STEAP-1 v. 1. По сравнению со STEAP-1 v. 1 вариант STEAP-1 v. 3 имеет другой экзон, полученный в результате сплайсинга интрона 4 STEAP-1 v. 1. Интроны и экзоны имеют неодинаковую длину. Фиг. 12. Схематический сравнительный анализ первичных структур белковых вариантов STEAP-1. Белковые варианты соответствуют нуклеотидным вариантам. Нуклеотидные варианты STEAP-1v. 5 - v. 17, приведенные на фиг. 10, кодируют белок, аналогичный STEAP-1 v. 2. Белки, транслируемые из транскрипционных вариантов STEAP-1 v. 1 и v. 3, показанных на фиг. 11, в положении 169 могут содержать аминокислоту F (Phe) или L (Leu). Единичные аминокислотные различия указаны над рамками. Черными прямоугольниками отмечены последовательности, аналогичные последовательности STEAP-1v. 1. Прямоугольники, заштрихованные разными способами, обозначают разные последовательности. Номера под прямоугольниками соответствуют STEAP-1 v. 1. Фиг. 13A-13C. Прогнозирование вторичной структуры и трансмембранных доменов для белковых вариантов STEAP-1. Вторичную структуру белковых вариантов 1 STEAP-1(SEQ ID NO: 46), 2 (SEQ ID NO: 47) и 3 (SEQ ID NO: 48) (фиг. 13A-13C соответственно) прогнозируют по способу HNN - Hierarchical Neural Network (Guermeur, 1997, http://pbil.ibcp.fr/cgibin/npsaautomat.plpage=npsann.html), который можно найти через сервер молекулярной биологии ExPasy,расположенному в глобальной сети, на сайте (.expasy.ch/tools/). Данный способ позволяет прогнозировать присутствие и расположение альфа-спиралей, развернутых цепей и статистических клубков на основе первичной последовательности белка. Также приводится процент белковых молекул, имеющих данную вторичную структуру. Фиг. 13D-13H. Схематически показана вероятность существования трансмембранных участков и ориентация вариантов 1-3 STEAP-1 соответственно, полученные с помощью алгоритма TMpred, Hofmannspanning protein segments Biol. Chem. Hoppe-Seyler 374: 166, 1993). Фиг. 13E-13I. Схематически показана вероятность существования трансмембранных участков, а также внеклеточная и внутриклеточная ориентация вариантов 1-3 STEAP-1 соответственно, полученные с помощью алгоритма ТМНММ, Sonnhammer, von Heijne, and Krogh (Erik L.L. Sonnhammer, Gunnar vonIn Proc. of Sixth Int. Conf. on Intelligent Systems for Molecular Biology, p. 175-182, Ed. J. Glasgow,T. Littlejohn, F. Major, R. Lathrop, D. Sankoff, and C. Sensen Menlo Park, CA: AAAI Press, 1998). Алгоритмы TMpred и ТМНММ можно найти через сервер молекулярной биологии ExPasy в глобальной сети на сайте (.expasy.ch/tools/). Фиг. 14A. Экспрессия STEAP-1 в образце пациента с раком желудка. РНК экстрагируют из нормального желудка (N) и из образцов от 10 разных пациентов с раком желудка (Т). Наличие последовательности STEAP-1 определяют методом нозерн-блоттинга, используя 10 мкг общей РНК на полосу. Результаты показывают, что в тканях опухоли желудка происходит интенсивная экспрессия STEAP-1 размером приблизительно 1,6 т.о. На нижней панели представлено окрашивание блоттинга бромидом этидия, демонстрирующее качество образцов РНК. Фиг. 14B. Экспрессия STEAP-1 в тканях пациента с раком прямой кишки. РНК экстрагируют из нормальной прямой кишки (N), из опухолевых тканей пациентов с раком прямой кишки (Т) и из метастаз рака прямой кишки (М). Наличие последовательности STEAP-1 определяют методом нозерн-блоттинга, используя 10 мкг общей РНК на полосу. Результаты показывают, что в тканях пациентов с раком прямой кишки происходит интенсивная экспрессия STEAP-1. На нижней па-7 014870 нели представлено окрашивание блоттинга бромидом этидия, демонстрирующее качество образцов РНК. Фиг. 14C. Экспрессия STEAP-1 в эндотелиальных клетках пупочной вены человека (HUVEC). Одноцепочечную кДНК получают из клеток HUVEC, ксенотрансплантатов рака простатыLAPC-4AD и LAPC-9AD, а также из тканей мозга человека. Нормализацию проводят методом ПЦР, используя праймеры для актина и GAPDH. Полуколичественную ПЦР с праймерами для STEAP-1, проводят, используя 27 и 30 циклов амплификации (А). В качестве контроля проводят ПЦР с использованием праймеров для актина (В). Результаты показывают, что в клетках HUVEC происходит интенсивная экспрессия STEAP-1, как и в тканях ксенотрансплантатов рака простаты. Экспрессия STEAP-1 в клеткахHUVEC показывает, что STEAP-1 можно использовать в качестве маркера эндотелиальных клеток при реваскуляризации опухолей. Фиг. 14D и 14E. Экспрессия STEAP-1 в нормальных и раковых тканях. Одноцепочечную кДНК получают из нормальных тканей (мочевого пузыря, мозга, сердца, почек,печени, легких, простаты, селезенки, скелетной мускулатуры, яичек, поджелудочной железы, толстой кишки и желудка) и из пулов раковых тканей пациентов (из пула рака простаты, пула рака мочевого пузыря, пула рака почек, пула рака прямой кишки, пула рака легких, пула рака яичников, пула рака молочной железы, пула раковых метастаз, пула рака поджелудочной железы, пула ксенотрансплантатов рака простаты и пула метастаз рака простаты в лимфоузлах). Нормализацию проводят методом ПЦР с использованием праймеров для актина. Полуколичественную ПЦР с праймерами для STEAP-1 проводят, используя 26 и 30 циклов амплификации. Фиг. 14D. Изображение агарозного геля с продуктами ОТ-ПЦР. Фиг. 14E. Результаты количественного определения продуктов ПЦР с помощью программного обеспечения Alphalmager. Результаты показывают, что среди всех анализируемых нормальных тканей интенсивная экспрессия наблюдается в простате. Повышающая регуляция экспрессии STEAP-1 обнаружена в пуле рака простаты, пуле рака мочевого пузыря, пуле рака почек, пуле рака прямой кишки, пуле рака легких, пуле рака яичников, пуле рака молочной железы и пуле рака поджелудочной железы. Интенсивная экспрессияSTEAP-1 обнаружена в пуле раковых метастаз, пуле ксенотрансплантатов рака простаты и в пуле метастаз рака простаты в лимфоузлах. Фиг. 14F. Экспрессия STEAP-1 в лимфомных образцах пациентов. Нормализацию проводят методом ПЦР с использованием праймеров для актина. Полуколичественную ПЦР с праймерами для STEAP-1 проводят, используя 26 и 30 циклов амплификации. Образцы анализируют на агарозном геле и с помощью программного обеспечения Alphalmager определяют количество продуктов ПЦР. Экспрессию считают сильной или средней, если сигнал детектируется после 26 или 30 циклов амплификации соответственно, и считают, что экспрессия отсутствует, если сигнал не детектирутся даже после 30 циклов амплификации. Результаты показывают, что экспрессия STEAP-1 наблюдается в 8 из 11 анализируемых опухолевых образцов (72,7%). Фиг. 15. Специфическое окрашивание STEAP-1 на поверхности клеток с помощью Mab M2/92.30. Левые секторы: анализ методом FACS рекомбинантных клеток 3 Т 3 и RAT1, стабильно экспрессирующих либо STEAP-1 (темные линии), либо контрольный ген устойчивости к неомицину (светлые линии), где окрашивание проводят с помощью Mab M2/92.30 против STEAP (10 мкг/мл), а связанные с клеточной поверхностью Mab детектируют, используя в качестве вторичного реагента конъюгат козлиных антител против мышиных IgG с РЕ. Затем окрашенные клетки анализируют методом FACS. Сдвиг флуоресценции в клетках RAT1-STEAP-1 и 3T3-STEAP-1 по сравнению с контрольными клетками показывает, что Mab M2/92.30 специфически связываются со STEAP-1 на клеточной поверхности. Правый сектор: флуоресцентная микроскопия клеток 3T3-STEAP-1, окрашенных Mab M2/92.30,демонстрирует интенсивную флуоресценцию клеточной поверхности. Фиг. 16. STEAP-1 М 2/92.30 Mab распознает STEAP-1 на поверхности клеток ксенотрансплантатов рака простаты. Клетки рака простаты LAPC9 окрашивают, используя 10 мкг/мл либо Mab М 2/92.30, либо контрольные Mab против KLH. Связанные с поверхностью Mab детектируют, используя в качестве вторичных Ab конъюгат козлиных антител против мышиных IgG с РЕ. Затем окрашенные клетки анализируют методом FACS. Полученные результаты показывают, что Mab M2/120.545 против STEAP-1 специфически связывается с эндогенным STEAP-1, экспрессирующимся на поверхности клеток ксенотрансплантатов рака простаты. Фиг. 17. STEAP-1 М 2/92.30 Mab распознает мышиный STEAP-1. Клетки 293 Т транзиторно трансфицируют либо pCDNA3.1, кодирующим кДНК мышиногоSTEAP-1, либо пустым вектором. Через 2 дня клетки собирают и окрашивают Mab M2/92.30 противSTEAP-1 (10 мкг/мл), после чего связанные с клеточной поверхностью Mab детектируют, используя в качестве вторичного реагента конъюгат козлиных антител против мышиных IgG с РЕ. Затем клетки анализируют методом FACS. Сдвиг флуоресценции на клетках 293 Т, трансфицированных мышиным-8 014870 Фиг. 18. STEAP-1/120.545 Mab распознает STEAP-1 на клеточной поверхности. Сектор А и сектор В. Клетки 3 Т 3-neo (А, закрашенная гистограмма) и 3 Т 3-STEAP-1 (А, незакрашенная гистограмма) и клетки RAT1-neo (В, закрашенная гистограмма) и RAT1-STEAP (В, незакрашенная гистограмма) окрашивают Mab М 2/120.545 (10 мкг/мл) и связанные с поверхностью Mab детектируют, используя в качестве вторичных Ab конъюгат козлиных антител против мышиных IgG с РЕ. Затем клетки анализируют методом FACS. Сдвиг флуоресценции на клетках 3 Т 3-STEAP-1 и RAT1-STEAP-1 по сравнению с соответствующими neo-контролями показывает, что Mab M2/120.545 специфически связываются с STEAP-1 на клеточной поверхности. Сектор С. Клетки LNCaP окрашивают либо Mab М 2/120.545, либо контрольными Mab против KLH и анализируют методом FACS, как описано выше. Сектор D. Флуоресцентная микроскопия клеток LNCaP, окрашенных М 2/120.545, демонстрирует интенсивную флуоресценцию клеточной поверхности. Полученные результаты показывают, что Mab М 2/120.545 специфически связывается с эндогенным STEAP-1 на поверхности клеток LNCaP. Фиг. 19A. кДНК (SEQ ID NO: 49) и аминокислотная последовательность (SEQ ID NO: 50) М 2/Х 92.30 VH, клон 2. Фиг. 19B кДНК (SEQ ID NO: 51) и аминокислотная последовательность (SEQ ID NO: 52) М 2/Х 92.30 VL, клон 2. Фиг. 19C. кДНК (SEQ ID NO: 53) и аминокислотная последовательность (SEQ ID NO: 54) М 2/Х 92.30 VL, клон 6. Фиг. 19D. кДНК (SEQ ID NO: 55) и аминокислотная последовательность (SEQ ID NO: 56) М 2/Х 120.545 VL, клон 8. Фиг. 20A. Аминокислотная последовательность (SEQ ID NO: 57) М 2/Х 92.30 VH, клон 2. Фиг. 20B. Аминокислотная последовательность (SEQ ID NO: 58) М 2/Х 92.30 VL, клон 2. Фиг. 20C. кДНК (SEQ ID NO: 59) и аминокислотная последовательность (SEQ ID NO: 60) М 2/Х 92.30 VL, клон 6. Фиг. 20D. Сравнительный анализ амнокислотной последовательности М 2/Х 92.30 VL, клон 2(SEQ ID NO: 61), и М 2/М 92.30 VL, клон 6 (SEQ ID NO: 62). Фиг. 20E. Аминокислотная последовательность (SEQ ID NO: 63) М 2/Х 120.545 VL, клон 8. Последовательность сигнального пептида подчеркнута. Фиг. 21. STEAP-1 М 2/92.30 Mab распознает STEAP-1 на поверхности клеток ксенотрансплантатов рака простаты и мочевого пузыря человека. Клетки мочевого пузыря UGB1 (левый сектор) и клетки рака простаты LAPC9 (правый сектор) окрашивают, используя 10 мкг/мл либо Mab M2/92.30, либо контрольных Mab против KLH. Связанные с поверхностью Mab детектируют, используя в качестве вторичных Ab конъюгат козлиных антител против мышиных IgG с РЕ. Затем окрашенные клетки анализируют методом FACS. Полученные результаты показывают, что Mab M2/92.30 против STEAP-1 специфически связывается с эндогенным STEAP-1, экспрессирующимся на поверхности клеток ксенотрансплантатов рака мочевого пузыря и простаты. Фиг. 22. Интернализация STEAP-1 под действием STEAP-1/92.30 Mab. Клетки 3T3-STEAP-1 окрашивают при 4 С с помощью М 2/92.30 Mab (10 мкг/мл), промывают и инкубируют с конъюгатом козлиные антитела против мышиных IgG-РЕ в качестве вторичных Ab при 4 С. Половину клеток инкубируют при 37 С в течение 30 мин, а вторую половину оставляют при 4 С. Затем клетки из каждой партии анализируют методом флуоресцентной микроскопии. На поверхности клеток,оставленных инкубироваться при 4 С, наблюдается яркая "кольцеобразная" флуоресценция. На поверхности клеток, инкубировавшихся при 37 С, "кольцеобразная" флуоресценция отсутствует, а появление точечной и агрегированной флуоресценции указывает на кэпирование и интернализацию. Фиг. 23. Интернализация STEAP-1 под действием STEAP-1 М 2/120.545 Mab. Клетки PC3-STEAP-1 окрашивают при 4 С с помощью М 2/120.545 Mab (10 мкг/мл), промывают и инкубируют с конъюгатом козлиные антитела против мышиных IgG-РЕ в качестве вторичных Ab. Половину клеток инкубируют при 37 С в течение 30 мин, а вторую половину оставляют при 4 С. Затем клетки из каждой партии анализируют методом флуоресцентной микроскопии. На поверхности клеток, оставленных инкубироваться при 4 С, наблюдается яркая "кольцеобразная" флуоресценция. На поверхности клеток, инкубировавшихся при 37 С, "кольцеобразная" флуоресценция отсутствует, а появление точечной и агрегированной флуоресценции указывает на кэпирование и интернализацию. Фиг. 24. Интернализация STEAP-1. Для того чтобы продемонстрировать, что мышиный STEAP-1 M2/120.545 проникает в клеткимишени благодаря экспрессии STEAP-1 на поверхности клеток LNCaP, используют конъюгаты антител против мышиных IgG с сапорином (Advanced Targeting Systems, San Diego, CA). Анализ проводят следующим образом. Клетки LNCaP помещают в количестве 5000 клеток/90 мкл/лунку в 96-луночный планшет и инкубируют в течение ночи. Получают растворы конъюгатов вторичных антител с иммунотоксином (антитела против мышиных IgG-сапорин и антитела против козлиных IgG-сапорин) или антител против мышиных IgG в среде для культивирования клеток с конечной концентрацией 100 нг/мл. Добавляют первичное антитело в концентрации, варьирующей от 1 до 1000 нг/мл. Планшеты инкубируют в-9 014870 течение 72 ч, после чего методом МТТ определяют жизнеспособность. Результаты показывают, что клетки LNCaP погибают в присутствии М 2/120.545 и конъюгата антитело против мышиных IgG-сапорин. При использовании только вторичных антител (против мышиных IgG) или конъюгатов неспецифичных вторичных антител (антител против козлиных IgG с сапорином) эффект не детектируется. При использовании только первичного антитела (М 2/120.545) вплоть до концентрации 1 мкг/мл токсичность не наблюдается. Фиг. 25. Иммунопреципитация STEAP-1 под действием Mab против STEAP-1 M2/92.30 и М 2/120.545. Клетки 3T3-STEAP-1 и 3 Т 3-neo лизируют в буфере RIPA (25 мМ Tris-Cl pH 7,4; 150 мМ NaCl,0,5 мМ EDTA, 1% тритон Х-100, 0,5% дезоксихолевая кислота, 0,1% SDS и смесь ингибиторов протеаз). Клеточные лизаты предварительно осветляют с помощью гранул сефарозы, содержащих белок G, и затем инкубируют с 5 мкг Mab либо М 2/92.30, либо М 2/120.545 в течение 2 ч при комнатной температуре. Добавляют гранулы, содержащие белок G, и смесь инкубируют еще 1 ч. Иммунные комплексы промывают и солюбилизируют в буфере для SDS-PAGE. Затем солюбилизированные образцы анализируют методами SDS-PAGE и вестерн-блоттинга, используя кроличьи pAb против STEAP. В качестве положительного контроля используют лизаты целых клеток 293 Т, трансфицированных STEAP-1. Иммунореактивная полоса, соответствующая 37 кДа, наблюдается только в образцах, полученных из клеток 3T3-STEAP-1, и указывает на специфичную иммунопреципитацию STEAP-1 под действием как Mab М 2/92.30, так и Mab М 2/120.545. Фиг. 26. Влияние STEAP-1 Mab на рост ксенотрансплантатов рака простаты человека LAPC9 у мышей.STEAP-1 M2/92.30 и М 2/120.545 тестируют в двух разных дозах, 100 и 500 мкг. В качестве контролей используют PBS и Mab против KLH. В исследовании участвуют 6 групп по 10 мышей в каждой. Mab вводят в.б. два раза в неделю, всего 12 раз, начиная со дня инъекции опухолевых клеток. Размер опухоли измеряют штангенциркулем два раза в неделю. Объем опухоли рассчитывают по формуле W2L/2,где L - самый длинный размер; W - перпендикулярный ему размер. Концентрацию PSA в сыворотке измеряют на 40 день после начала обработки с помощью коммерческого набора ELISA. Чтобы учесть различия в росте опухоли и уровне PSA между группами, используют тест Крускала-Валлиса и U-тест Манна-Уитни. Все тесты являются двусторонними с =0,05. Полученные результаты показывают, чтоSTEAP-1 M2/92.30 и М 2/120.545 значительно замедляют рост ксенотрансплантата опухоли простаты человека в зависимости от используемой дозы. Фиг. 27. Влияние STEAP-1 Mab на рост ксенотрансплантатов рака простаты человека LAPC9 у мышей.STEAP-1 M2/92.30 и М 2/120.545 тестируют в двух разных дозах, 100 и 500 мкг. В качестве контролей используют PBS и Mab против KLH. В исследовании участвуют 6 групп по 10 мышей в каждой. Mab вводят в.б. два раза в неделю, всего 12 раз, начиная со дня инъекции опухолевых клеток. Размер опухоли измеряют штангенциркулем два раза в неделю. Измеряют самый длинный размер L и перпендикулярный ему размер W, после чего объем опухоли определяют по формуле W2L/2. Концентрацию PSA в сыворотке измеряют на 40 день после начала обработки с помощью коммерческого набора ELISA. Чтобы учесть различия в росте опухоли и уровне PSA между группами, используют тест Крускала-Валлиса иU-тест Манна-Уитни. Все тесты являются двусторонними с =0,05. Полученные результаты показывают,что STEAP-1 М 2/92.30 и М 2/120.545 значительно замедляют рост ксенотрансплантата опухоли простаты человека в дозозависимой манере. Фиг. 28. STEAP-1-индуцированное фосфорилирование ERK-1 и ERK-2. Левые секторы: клетки РС 3 трансфицируют геном устойчивости к неомицину отдельно или вместе с геном STEAP-1 в векторе pSR. Клетки выращивают в течение ночи в 0,5% FBS, затем стимулируют 10% FBS в течение 5 мин в присутствии или в отсутствие 10 мкг/мл ингибитора MEK PD98058. Клеточные лизаты анализируют методами 12,5% SDS-PAGE и вестерн-блоттинга с использованием антител против фосфо-ERK (Cell Signaling) и антител против ERK (Zymed). Правые секторы: клетки NIH-3T3 трансфицируют только геном устойчивости к неомицину илиSTEAP-1 в векторе pSR. Клетки обрабатывают, как описано выше, но в отсутствие ингибитора MEK. Кроме того, клетки NIH-3T3-neo обрабатывают 10 мг/мл салицилата Na. Экспрессия STEAP-1 индуцирует фосфорилирование ERK-1 и ERK-2 в сыворотке, которое ингибируется вышестоящим ингибитором киназы MEK PD98058. Фиг. 29. STEAP-1 опосредует межклеточное взаимодействие. Клетки РС 3 трансфицируют геном устойчивости к неомицину отдельно или вместе с геномSTEAP-1, или котрольным геном в векторе pSR. Реципиентные клетки метят конъюгатом декстрантехасовый красный в концентрации 1 мг/мл, а донорные клетки метят кальцеином AM в концентрации 2,5 мкг/мл. Донорные (зеленые) и реципиентные (красные) клетки совместно культивируют при 37 С в течение 18-24 ч, после чего с помощью микроскопии анализируют расположение флуоресцентных красителей.- 10014870 Левый сектор: в качестве доноров и реципиентов используют клетки РС 3-neo. Центральный сектор: в качестве доноров и реципиентов используют клетки PC3-STEAP-1. Правый сектор: в качестве доноров и реципиентов используют РС 3-контрольные клетки. STEAP-1 индуцирует перенос кальцеина в клетки,содержащие конъюгат декстран-техасовый красный, данный результат указывает на то, что STEAP-1 облегчает межклеточные взаимодействия. Фиг. 30. Для межклеточного взаимодействия требуется экспрессия STEAP-1 на донорных и реципиентных клетках. Клетки РС 3 трансфицируют геном устойчивости к неомицину отдельно или вместе с геномSTEAP-1 в векторе pSR. Реципиентные клетки метят конъюгатом декстран-техасовый красный в концентрации 1 мг/мл, а донорные клетки метят кальцеином AM в концентрации 2,5 мкг/мл. Донорные (зеленые) и реципиентные (красные) клетки совместно культивируют при 37 С в течение 18-24 ч, после чего с помощью микроскопии анализируют расположение флуоресцентных красителей. Верхние секторы: оптическая микроскопия; нижние секторы: УФ-флуоресценция. Левые секторы: в качестве доноров и реципиентов используют клетки РС 3-neo. Центральные секторы: в качестве донорных клеток используют РС 3-neo, а в качестве реципиентных клеток используют PC3-STEAP-1. Правые панели: в качестве доноров и реципиентов используют клетки PC3-STEAP-1. Межклеточные взаимодействия детектируют только в том случае, если STEAP-1 экспрессируется и на донорных, и на реципиентных клетках. Фиг. 31. Влияние Mab STEAP-1/120.545 на щелевой контакт. Клетки РС 3 трансфицируют геном устойчивости к неомицину отдельно или вместе с геномSTEAP-1 в векторе pSR. Реципиентные клетки метят конъюгатом декстран-техасовый красный в концентрации 1 мг/мл, а донорные клетки метят кальцеином AM в концентрации 2,5 мкг/мл. Донорные (зеленые) и реципиентные (красные) клетки совместно культивируют при 37 С в течение 18-24 ч, после чего с помощью микроскопии анализируют расположение флуоресцентных красителей. Во всех экспериментах в качестве доноров и реципиентов используют одинаковые клетки. Клетки инкубируют с указанными количествами Mab STEAP-1/120.545 в течение 10 мин перед внесением в планшеты, затем Mab оставляют в культуре на 24 ч до анализа. STEAP-1/120.545 уменьшает щелевой контакт, опосредованныйSTEAP-1, в зависимости от используемой дозы. Фиг. 32. Ингибирование фосфорилирования ERK-1 и ERK-2 под действием STEAP-1 Mab и РНКи. Клетки РС 3 трансфицируют геном устойчивости к неомицину отдельно или вместе с геномSTEAP-1 и Mab в векторе pSR. Для удаления РНКи клетки РС 3-STEAP-1 стабильно трансфицируют вектором pPUR-U6-27-STEAP-1, содержащим киРНК (короткие интерферирующие РНК) STEAP-1. Клетки держат в условиях недостаточного количества питательных веществ в 0,1% FBS в течение 18 ч при 37 С, затем помещают на лед, где держат в течение 10 мин в присутствии или в отсутствие 10 мкг/млMab M2/92.30, после чего в течение 3 мин нагревают до КТ и стимулируют 10% FBS в течение 5 мин. Клетки лизируют в буфере RIPA, лизаты целых клеток анализируют методом 12,5% SDS-PAGE, а белки детектируют методом вестерн-блоттинга. Фосфо-ERK детектируют с помощью кроличьей антисыворотки (Cell Signaling), a ERK детектируют с помощью кроличьих антител против ERK (Zymed). STEAP-1 детектируют с помощью овечьих антител против STEAP-1, а актин детектируют с помощью Mab против актина (Santa Cruz). Фосфорилирование ERK-1 и ERK-2, индуцированное 10% сывороткой, ингибируется под действием Mab M2/92.30 и киРНК STEAP-1. Фиг. 33. Влияние РНКи STEAP-1 на межклеточное взаимодействие. Клетки РС 3 трансфицируют геном устойчивости к неомицину отдельно или вместе с геномSTEAP-1 в векторе pSR. Для удаления РНКи клетки PC3-STEAP-1 стабильно трансфицируют векторомpPUR-U6-27-STEAP-1, содержащим киРНК STEAP-1, или пустым вектором. Реципиентные клетки метят конъюгатом декстран-техасовый красный в концентрации 1 мг/мл, а донорные клетки метят кальцеиномAM в концентрации 2,5 мкг/мл. Донорные (зеленые) и реципиентные (красные) клетки совместно культивируют при 37 С в течение 18-24 ч, после чего с помощью микроскопии анализируют расположение флуоресцентных красителей. Во всех экспериментах в качестве доноров и реципиентов используют одинаковые клетки. Специфичная РНКи STEAP-1, стабильно экспрессирующаяся в клетках PC3-STEAP-1,уменьшает межклеточное взаимодействие, индуцированное STEAP-1.- 11014870 Подробное описание изобретения Оглавление разделов.II.А.4. Выделение молекул нуклеиновых кислот, кодирующих STEAP-1.II.А.5. Молекулы рекомбинантных нуклеиновых кислот и системы векторов-хозяев.V. Клеточные иммунные ответы на STEAP-1.VIII. Способы определения статуса генов, родственных STEAP-1, и их продуктов.X. Терапевтические способы и композиции. Х.А. Противораковые вакцины. Х.В. STEAP-1 как мишень для терапии антителами. Х.С. STEAP-1 как мишень для клеточных иммунных ответов. Х.С.1. Вакцины на основе мини-генов. Х.С.2. Сочетания пептидов CTL с хелперными пептидами. Х.С.3. Сочетания пептидов CTL с факторами, сенсибилизирующими Т-клетки. Х.С.4. Вакцинные композиции, содержащие DC, сенсибилизированные пептидами CTL и/или HTL.X.D. Адоптивная иммунотерапия. Х.Е. Введение вакцин с целью лечения или профилактики.XII. Ингибирование белковой функции STEAP-1.XII.С. Ингибирование транскрипции или трансляции STEAP-1.XII.D. Общие положения стратегий лечения.XIV. РНКи и терапевтическое применение маленьких интерферирующих РНК (siRNA).I. Определения. Если не указано иначе, подразумевается, что все используемые в данном описании научные термины, номенклатура или терминология имеют значения, общепринятые в области, к которой относится данное изобретение. В некоторых случаях для ясности и/или в качестве справочного материала в данном описании приводятся определения терминов, имеющих общепринятые значения, но не следует считать,что включение таких определений в данное описание означает, что они существенно отличаются от общепринятых в данной области. Многие методы и процедуры, описанные в данном документе, являются хорошо известными и широко применяются специалистами в данной области в рамках традиционной методологии, такой, например, как широко используемые методы молекулярного клонирования, описанные в Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition (1989), Cold Spring HarborLaboratory Press, Cold Spring Harbor, N. Y. Если не указано иначе, процедуры, включающие в себя применение коммерческих наборов и реагентов, обычно проводят в соответствии с инструкциями и/или параметрами производителя. Термины "распространенный рак простаты", "местно распространенный рак простаты", "распространенное заболевание" и "местно распространенное заболевание" относятся к заболеваниям простаты,распространившимся из капсулы простаты, и включают в себя заболевания стадии С по системе американской урологической ассоциации (AUA), заболевания стадий С 1-С 2 по системе Уитмора-Джеветта(Whitmore-Jewett) и заболевания стадий Т 3-Т 4 и N+ по системе TNM (опухоль, узел, метастазы). Как правило, не рекомендуется применять хирургическое лечение для пациентов с местно распространенным заболеванием, такие пациенты имеют гораздо менее благоприятный исход, чем пациенты с клинически локализованным (ограниченным органом) раком простаты. Местно распространенное заболевание идентифицируют при обнаружении путем пальпации уплотнения за боковой границей простаты,- 12014870 или асимметрии, или уплотнения выше основания простаты. Местно распространенный рак простаты в настоящее время диагностируют патологически после радикальной простатэктомии, если опухоль внедряется или проникает в простатическую капсулу, простирается за границы оперируемой области или проникает в семенные пузырьки. Термин "изменение природного характера гликозилирования" в данном описании означает делецию одного или нескольких углеводных фрагментов, присутствующих в нативной последовательностиSTEAP-1 (либо в результате удаления нижестоящего участка гликозилирования, либо в результате делеции гликозилирования химическими или ферментативными способами), и/или добавление одного или нескольких участков гликозилирования, не присутствующих в нативной последовательности STEAP-1. Кроме того, данная фраза включает в себя количественные изменения в гликозилировании нативных белков, включающие в себя изменения природы и соотношения разных присутствующих углеводных фрагментов. Термин "аналог" относится к молекуле, которая имеет структуру, подобную структуре другой молекулы, или признаки, подобные или аналогичные признакам другой молекулы (например, белка, родственного STEAP-1). Например, аналог белка STEAP-1 может специфически связываться с антителом или Т-клеткой, которые специфически связываются со STEAP-1. Если однозначно не указано иначе, термин "антитело" используется в самом широком смысле. Следовательно, "антитело" может быть природным или искусственным, таким как моноклональные антитела, полученные с помощью традиционной гибридомной технологии. Антитела против STEAP-1 включают в себя моноклональные и поликлональные антитела, а также фрагменты, содержащие антигенсвязывающий домен и/или один или несколько гипервариабельных участков данных антител. В данном описании термин "антитело" относится к антителам любого вида или к их фрагментам, которые специфически связываются со STEAP-1 и/или обладают желательной биологической активностью, и, в частности,включает в себя моноклональные антитела (в том числе полноразмерные моноклональные антитела),поликлональные антитела, поливалентные антитела (например, биспецифические антитела) и фрагменты антител, которые специфически связываются со STEAP-1 и/или обладают желательной биологической активностью. В способах и композициях, описанных в данном документе, можно использовать любое специфическое антитело. Так, в одном воплощении термин "антитело" включает в себя молекулу, содержащую по меньшей мере один вариабельный участок легкой цепи молекулы иммуноглобулина и по меньшей мере один вариабельный участок тяжелой цепи, которые вместе образуют участок специфического связывания антигена-мишени. В одном воплощении антитело представляет собой антитело IgG. Например, антитело может представлять собой IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4. Антитела, используемые в способах и композициях согласно изобретению, могут быть получены в клеточной культуре, в фагах или в разных животных, включающих в себя, без ограничения, коров, кроликов, коз, мышей, крыс, хомяков,морских свинок, овец, собак, кошек, мартышек, шимпанзе, человекообразных обезьян. Таким образом, в одном воплощении антитело согласно изобретению представляет собой антитело млекопитающего. Для выделения исходного антитела или получения вариантов с измененными характеристиками специфичности или авидности можно использовать фаговые технологии. Такие технологии являются стандартными и хорошо известны в данной области. Например, рекомбинантное антитело можно получить путем трансфекции клетки-хозяина вектором, содержащим последовательность ДНК, кодирующую антитело. Для трансфекции последовательности ДНК, экспрессирующей по меньшей мере один VL- и одинVH-участок в клетке-хозяине, можно использовать один или несколько векторов. Примеры рекомбинантных способов получения и продукции антител описаны в Delves, ANTIBODY PRODUCTION: ESSENTIAL TECHNIQUES (Wiley, 1997); Shephard, et al., MONOCLONAL ANTIBODIES (Oxford UniversityPress, 2000); Goding, MONOCLONAL ANTIBODIES: PRINCIPLES AND PRACTICE (Academic Press,1993); CURRENT PROTOCOLS IN IMMUNOLOGY (John WileySons, most recent edition). Антитело согласно изобретению можно модифицировать рекомбинантными способами с увеличением эффективности антитела при опосредовании целевой функции. Таким образом, в объем согласно изобретению входят модификации антител путем замен с использованием рекомбинантных методов. Как правило,замены являются консервативными. Например, по меньшей мере одна аминокислота в константном участке антитела может быть заменена на другой остаток. См., например, патент США 5624821, патент США 6194551, заявка WO 9958572 и Angal, et al., Mol. Immunol. 30: 105-08 (1993). Модификации аминокислотного состава включают в себя делеции, добавления, замены аминокислот. В некоторых случаях такие изменения делают, чтобы уменьшить нежелательную активность, например комплементзависимую цитотоксичность. Зачастую антитела метят путем присоединения либо ковалентного, либо нековалентного, вещества, генерирующего детектируемый сигнал. Известен широкий ряд меток и методов присоединения, которые широко описаны в научной и патентной литературе. Данные антитела можно анализировать на связывание с нормальным или дефектным STEAP-1. См., например, ANTIBODYENGINEERING: A PRACTICAL APPROACH (Oxford University Press, 1996). Подходящие антитела с желательной биологической активностью можно идентифицировать с помощью in vitro анализов, включающих в себя, без ограничения, пролиферацию, миграцию, адгезию, выращивание в мягком агаре, ангиогенез, межклеточные взаимодействия, апоптоз, транспорт, передачу сигнала, а также с помощью invivo анализов, таких как ингибирование опухолевого роста. Антитела, предлагающиеся в данном описании, также можно использовать для диагностических целей. Улавливающие или не-нейтрализующие антитела можно анализировать на способность связываться со специфическим антигеном, при этом не ингибируя связывание с рецептором или биологическую активность антигена. Нейтрализующие антитела можно использовать в конкурентном анализе связывания. Их также можно использовать для количественного определения STEAP-1 или его рецептора."Фрагмент антитела" определяют по меньшей мере как часть вариабельного участка молекулы иммуноглобулина, которая связывается с мишенью антитела, т.е. как антигенсвязывающий участок. В одном воплощении данный термин, в частности, охватывает отдельные антитела против STEAP-1 и их клоны (в том числе агонистические, антагонистические и нейтрализующие антитела), а также композиции антител против STEAP-1 с полиэпитопной специфичностью. В способах и композициях согласно изобретению можно использовать моноклональные или поликлональные антитела. Антитело может находиться в виде антигенсвязывающего фрагмента антитела, включающего в себя фрагмент Fab, фрагментF(ab')2, одноцепочечный вариабельный участок и т.п. Фрагменты интактных молекул можно получить с помощью способов, хорошо известных в данной области и включающих в себя ферментативное расщепление и рекомбинантные способы. В данном описании для получения антитела, специфичного к STEAP-1, можно использовать любую форму "антигена". Так, антиген, вызывающий образование антител, может представлять собой один эпитоп, несколько эпитопов или целый белок и может использоваться один или в сочетании с одним или несколькими известными в данной области средствами, повышающими иммуногенность. Антиген, вызывающий образование антител, может представлять собой выделенный полноразмерный белок, белок клеточной поверхности (например, при иммунизации клетками, трансфицированными по меньшей мере частью антигена) или растворимый белок (например, при иммунизации только фрагментом внеклеточного домена белка). Антиген может продуцироваться в генетически модифицированных клетках. ДНК, кодирующая антиген, может быть геномной или негеномной (например, кДНК) и может кодировать по меньшей мере часть внеклеточного домена. В данном описании термин "фрагмент" относится к минимальному числу аминокислот или нуклеиновых кислот, по обстоятельствам, образующих иммуногенный эпитоп рассматриваемого антигена. Для трансформации клеток можно использовать любые подходящие генетические векторы, включающие в себя, без ограничения, аденовирусные векторы, плазмиды и невирусные векторы, такие как катионные липиды. В одном воплощении антитело, используемое в способах и композициях согласно изобретению, специфически связывается по меньшей мере с частью внеклеточного домена рассматриваемого STEAP-1. Описываемые в данном документе антитела или их антигенсвязывающие фрагменты можно конъюгировать с "биоактивным средством". В данном описании термин "биоактивное средство" относится к любому синтетическому или природному соединению, которое связывается с антигеном и/или усиливает или опосредует желательный биологический эффект, связанный с увеличением уровня цитотоксичных веществ. В одном воплощении связывающие фрагменты, используемые в настоящем изобретении, представляют собой биологически активные фрагменты. В данном описании термин "биологически активный" относится к антителу или фрагменту антитела, способному связываться с целевым антигенным эпитопом и непосредственно или косвенно оказывать биологический эффект. Непосредственные эффекты включают в себя, без ограничения, модуляцию, стимуляцию и/или ингибирование сигнала роста; модуляцию,стимуляцию и/или ингибирование антиапоптотического сигнала; модуляцию, стимуляцию и/или ингибирование апоптотического или некротического сигнала; модуляцию, стимуляцию и/или ингибирование каскада ADCC и модуляцию, стимуляцию и/или ингибирование каскада CDC. В способах и композициях согласно изобретению также используются "биспецифические" антитела. В данном описании термин "биспецифическое антитело" относится к антителу, как правило, моноклональному, способному специфично связываться по меньшей мере с двумя антигенными эпитопами. В одном воплощении эпитопы относятся к одному антигену. В другом воплощении эпитопы относятся к двум разным антигенам. Способы получения биспецифических антител известны в данной области. Например, биспецифические антитела можно получить рекомбинантными способами путем совместной экспрессии пар тяжелых и легких цепей двух иммуноглобулинов. См., например, Milstein et al., Nature,305: 537-39 (1983). Альтернативно, биспецифические антитела можно получить путем химического присоединения. См., например, Brennan, et al., Science, 229: 81 (1985). Биспецифические антитела включают в себя фрагменты биспецифических антител. См., например, Hollinger, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90: 6444-48 (1993), Gruber, et al., J. Immunol. 152: 5368 (1994).- 14014870 Описанные в данном документе моноклональные антитела, в частности, включают в себя "химерные" антитела, в которых фрагмент тяжелой и/или легкой цепи идентичен или гомологичен соответствующим последовательностям антител, полученных из конкретных видов или принадлежащих к конкретному классу или подклассу антител, тогда как другая цепь (цепи) идентична или гомологична соответствующим последовательностям антител, полученных из других видов или принадлежащих к другому классу или подклассу антител, а также фрагменты таких антител, пока они специфически связываются с целевым антигеном и/или обладают желательной биологической активностью (патент США 4816567 иMorrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 6851-6855 (1984. Термин "кодон-оптимизированные последовательности" относится к нуклеотидным последовательностям, оптимизированным для конкретных видов путем замены любых кодонов с периодичностью использования менее чем приблизительно 20%. Нуклеотидные последовательности, оптимизированные для экспрессии в определенных видах хозяев путем устранения мнимых последовательностей полиаденилирования, устранения сигналов сплайсинга экзонов/интронов, устранения транспозон-подобных повторов и/или оптимизации содержания GC в добавление к оптимизации кодонов, в данном описании называют"Комбинаторная библиотека" представляет собой набор разных химических соединений, полученных путем химического или биологического синтеза в результате объединения ряда химических "структурных элементов", таких как реагенты. Например, линейную комбинаторную химическую библиотеку,такую как библиотеку полипептидов (например, мутеина), получают путем соединения ряда химических структурных элементов, называемых аминокислотами, с получением молекулы заданной длины (т.е. полипептидного соединения, содержащего определенное число аминокислот). Многие химические соединения синтезируют путем такого комбинаторного смешивания химических структурных элементов(Gallop et al., J. Med. Chem. 37(9): 1233-1251 (1994. Способы получения и скрининга комбинаторных библиотек хорошо известны специалистам в данной области. Такие комбинаторные химические библиотеки включают в себя, без ограничения, библиотеки пептидов (см., например, патент США 5010175, Furka, Pept. Prot. Res. 37: 487-493 (1991),Houghton et al., Nature, 354: 84-88 (1991, пептоиды (публикация РСТWO 91/19735), кодированные пептиды (публикация РСТWO 93/20242), статистические биоолигомеры (публикация РСТWO 92/00091), бензодиазепины (патент США 5288514), диверсомеры, такие как гидантоины, бензодиазепины и дипептиды (Hobbs et al., Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 90: 6909-6913 (1993, винилогические полипептиды (Hagihara et al., J. Amer. Chem. Soc. 114: 6568 (1992, непептидные пептидомиметики с бета-D-глюкозным скелетом (Hirschmann et al., J. Amer. Chem. Soc. 114: 9217-9218 (1992, библиотеки маленьких соединений, полученные путем аналогового органического синтеза (Chen et al., J. Amer. Chem.(Campbell et al., J. Org. Chem. 59: 658 (1994. См., в общем, Gordon et al., J. Med. Chem. 37: 1385 (1994),библиотеки нуклеиновых кислот (см., например, Stratagene, Corp.), библиотеки пептидов и нуклеиновых кислот (см., например, патент США 5539083), библиотеки антител (см., например, Vaughn et al.,Nature Biotechnology, 14 (3), (1996) и PCT/US96/10287), библиотеки углеводов (см., например, Liang et al.,Science, 274: 1520-1522 (1996) и патент США 5593853) и библиотеки маленьких органических молекул, таких как бензодиазепины (Baum, CEN, Jan 18, p. 33 (1993; изопреноиды (патент США 5569588); тиазолидиноны и метатиазаноны (патент США 5549974); пирролидины (патенты США 5525735 и 5519134); морфолиновые соединения (патент США 5506337); бензодиазепины (патент США 5288514) и т.п. Устройства для получения комбинаторных библиотек имеются в продаже (см., например, 357 NIPS,390 NIPS, Advanced Chem Tech, Louisville KY; Symphony, Rainin, Woburn, MA; 433A, Applied Biosystems,Foster City, CA; 9050, Plus, Millipore, Bedford, NIA). Для решений фазовой химии также разработан ряд роботизированных систем. Данные системы включают в себя автоматизированные рабочие станции, такие как автоматизированные аппараты синтеза, разработанные Takeda Chemical Industries, LTD. (Osaka,Japan), а также многие системы, в которых используются роботизированные руки (Zymate Н., ZymarkCorporation, Hopkinton, Mass.; Orca, Hewlett-Packard, Palo Alto, Calif.), имитирующие синтетические операции, проводимые химиками. Любое из вышеуказанных устройств можно использовать в настоящем изобретении. Специалисты в данной области могут осуществлять модификации данных устройств (если таковые имеют место) в пределах их работоспособности в соответствии с настоящим изобретением. Кроме того, ряд комбинаторных библиотек является коммерчески доступным (см., например, ComGenex,Princeton, NJ; Asinex, Moscow, RU; Tripos, Inc., St. Louis, MO; ChemStar, Ltd., Moscow, RU; 3D Pharmaceuticals, Exton, PA; Martek Biosciences, Columbia, MD; etc.). В данном описании термин "консервативная замена" относится к заменам аминокислот, известным специалистам в данной области, которые, как правило, могут быть осуществлены без изменения биологической активности полученной молекулы. Специалистам в данной области известно, что единичные аминокислотные замены в неэссенциальных участках, как правило, не приводят к существенному изменению биологической активности (см., например, Watson, et al., MOLECULAR BIOLOGY OF THE- 15014870 Предпочтительные примеры таких замен описаны в табл. III(A), III(B). Например, такие замены включают в себя замещение любого из изолейцина (I), валина (V) и лейцина (L) на любую другую из указанных гидрофобных аминокислот: аспарагиновой кислоты (D) на глутаминовую кислоту (Е), и наоборот; глутамина (Q) на аспарагин (N), и наоборот; и серина (S) на треонин (Т), и наоборот. Другие замены также могут считаться консервативными, если это позволяет их окружение и роль в трехмерной структуре белка. Например, глицин (G) и аланин (А) часто являются взаимозаменяемыми, как и аланин(А) и валин (V). Метионин (М), который является относительно гидрофобным, как правило, можно заменить на лейцин и изолейцин, а иногда на валин. Лизин (K) и аргинин (R) часто являются взаимозаменяемыми по положениям, для которых имеет значение заряд аминокислотного остатка, но не pK. Консервативными можно считать и другие замены, в частности, в окружающей области (см., например,табл. III(A), приведенную в данном описании; p. 13-15 "Biochemistry", 2nd ed. Lubert Stryer ed. (StanfordUniversity); Henikoff et al., PNAS, 1992. Vol. 89, 10915-10919; Lei et al., J. Bio. Chem. 19 May, 1995; 270(20): 11882-6). Другие допустимые замены можно идентифицировать эмпирически или по аналогии с известными консервативными заменами. Термин "цитотоксическое средство" относится к веществу, которое ингибирует или предотвращает экспрессионную активность клеток, функционирование клеток и/или вызывает деструкцию клеток. Подразумевается, что данный термин включает в себя радиоактивные изотопы, химиотерапевтические средства и токсины, такие как токсины с маленькими молекулами или ферментативно активные токсины бактериального, грибкового, растительного или животного происхождения, в том числе их фрагменты и/или варианты. Примеры цитотоксических средств включают в себя, без ограничения, ауристатины, ауристатин е, ауромицины, маутанзиноиды, иттрий, висмут, рицин, А-цепь рицина, комбрестатин, дуокармицины, долостатины, доксорубицин, даунорубицин, таксол, цисплатин, сс 1065, бромид этидия, митомицин,этопозид, тенопозид, винкристин, винбластин, колхицин, дигидроксиантрациндион, актиномицин, дифтерийный токсин, экзотоксин Pseudomonas (РЕ) А, РЕ 40, абрин, А-цепь абрина, А-цепь модексина,альфа-сарцин, гелонин, митогеллин, ретстриктоцин, феномицин, эномицин, курицин, кротин, каличемицин, ингибитор Sapaonaria officinalis, глюкокортикоиды и другие химиотерапевтические средства, а также радиоактивные изотопы, такие как 211At, 131I, 125I, 90Y, 186Re, 188Re, 153Sm, 212 или 213Bi, 32p и радиоактивные изотопы Lu, в том числе 177Lu. К антителам также можно присоединить фермент, активирующий пролекарственную форму противоракого средства, который способен превращать пролекарство в активную форму. В данном описании термин "диантитела" относится к маленьким фрагментам антител с двумя антигенсвязывающими участками, данные фрагменты содержат вариабельный домен тяжелой цепи (VH), соединенный с вариабельным доменом легкой цепи (VL) в одной полипептидной цепи (VH-VL). Путем применения линкера, который является слишком коротким, чтобы позволить спариваться двум доменам на одной цепи, домены вынуждают спариваться с комплементарными доменами другой цепи с образованием двух антигенсвязывающих участков. Более подробно диантитела описаны, например, в ЕР 404097;WO 93/11161 и Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 6444-48 (1993). Термин "генный продукт" в данном описании обозначает пептид/белок или мРНК. Например, термин "генный продукт согласно изобретению" в данном описании иногда относится к "раковой аминокислотной последовательности", "раковому белку", "белку злокачественного заболевания", приведенного в табл. I, "раковой мРНК", "мРНК злокачественного заболевания, приведенного в табл. I" и др. В одном воплощении раковый белок кодируется нуклеиновой кислотой, приведенной на фиг. 2. Раковый белок может представлять собой фрагмент или, альтернативно, полноразмерный белок, кодируемый нуклеиновыми кислотами фиг. 2. В одном воплощении раковую аминокислотную последовательность используют для определения идентичности или подобия последовательностей. В другом воплощении последовательности представляют собой природные аллельные варианты белка, кодируемого нуклеиновой кислотой,приведенной на фиг. 2. В следующем воплощении последовательности представляют собой варианты последовательностей, как описано в данном документе ниже. В способах и композициях согласно изобретению можно использовать "гетероконъюгатные" антитела. В данном описании термин "гетероконъюгатное антитело" относится к двум ковалентно связанным антителам. Такие антитела можно получить с помощью известных способов белкового синтеза, в том числе путем использования сшивающих агентов. См., например, патент США 4676980. Способы проведения "высокопроизводительного скрининга" с целью определения присутствия, отсутствия количества или других характеристик конкретных нуклеиновых кислот или белковых продуктов хорошо известны специалистам в данной области. Подобным образом, хорошо извстны способы проведения анализов связывания и анализов репортерных генов. Так, например, патент США 5559410 раскрывает способы проведения высокопроизводительного скрининга белков; патент США 5585639 раскрывает способы проведения высокопроизводительного скрининга связывания нуклеиновых кислот(т.е. в массивах); а патенты США 5576220 и 5541061 раскрывают способы проведения высокопроизводительного скрининга на связывание лиганд/антитело.- 16014870 Кроме того, существуют коммерческие системы высокопроизводительного скрининга (см., например, Amersham Biosciences, Piscataway, NJ; Zymark Corp., Hopkinton, MA; Air Technical Industries, Mentor,OH; Beckman Instruments, Inc. Fullerton, CA; Precision Systems, Inc., Natick, MA; etc.). Как правило, в данных системах автоматизированы все процедуры, в том числе отмеривание пипетками всех образцов и реагентов, распределение жидкостей, инкубации в течение заданного времени и конечное считывание микропланшета в детекторе, используемом в данном анализе. Данные настраиваемые системы обеспечивают высокую пропускную способность, быстрый запуск и высокую степень приспособляемости и удовлетворения требований потребителя. Производители таких систем предоставляют подробные инструкции для разных систем с высокой пропускной способностью. Так, например, Zymark Corp. предлагает технические бюллетени, описывающие системы скрининга с детекцией модуляции транскрипции генов,связывания лиганда и т.п. Термин "гомолог" относится к молекуле, которая гомологична другой молекуле, т.е. такие молекулы имеют последовательности химических остатков, совпадающие или подобные по соответствующим положениям. В одном воплощении антитело, предлагаемое в данном описании, представляет собой "человеческое антитело". В данном описании термин "человеческое антитело" относится к антителу, в котором практически все последовательности легких и тяжелых цепей, включая гипервариабельные участки(CDRs), кодируются человеческими генами. В одном воплощении для получения человеческих моноклональных антител используют триомы, человеческие В-клетки (см., например, Kozbor, et al., Immunol.CANCER THERAPY, 77-96 (1985 или фаговые дисплеи (см., например, Marks et al., J. Mol. Biol. 222: 581 (1991. В отдельном воплощении человеческое антитело получают в трансгенной мыши. Можно использовать любые известные в данной области способы получения таких частично или полностью человеческих антител. В соответствии с особо предпочтительным воплощением последовательности полностью человеческого антитела получают в трансгенной мыши, несущей гены тяжелой и легкой цепей человеческого антитела. Примеры способов получения трансгенных мышей и их потомства, продуцирующих человеческие антитела, можно найти в заявкеWO 02/43478 и патенте США 6657103(Abgenix). В-клетки трансгенных мышей, продуцирующие целевое антитело, затем можно гибридизовать с получением гибридомных клеточных линий, непрерывно продуцирующих антитело (см., например,патенты США 5569825; 5625126; 5633425; 5661016 и 5545806; Jakobovits, Adv. Drug Del. Rev. 31: 3342 (1998); Green, et al., J. Exp. Med. 188: 483-95 (1998."Человеческий лейкоцитарный антиген", или "HLA" представляет собой человеческий белок главного комплекса гистосовместимости (МНС) класса I или класса II (см., например, Stites, et al.,IMMUNOLOGY, 8th ED., Lange Publishing, Los Altos, CA (1994. В данном описании термин "гуманизированное антитело" относится к формам антител, которые содержат последовательности не человеческих (например, мышиных) и человеческих антител. Такие антитела представляют собой химерные антитела, которые содержат минимальную последовательность не человеческого иммуноглобулина. В большинстве случаев гуманизированное антитело содержит, по существу, полностью по меньшей мере один, как правило, два вариабельных доменов, в которых все или почти все гипервариабельные петли относятся к не человеческому иммуноглобулину, а все или почти все участки FR представляют собой последовательности человеческого иммуноглобулина. Гуманизированное антитело также необязательно содержит по меньшей мере часть константного участка (Fc) иммуноглобулина, обычно человеческого иммуноглобулина. См., например, Cabilly патент США 4816567;PRACTICAL APPROACH (Oxford University Press, 1996). Подразумевается, что термины "гибридизовать", "гибридизация", "гибридизуется" и т.п., используемые в применении к полинуклеотидам, относятся к традиционным условиям гибридизации, предпочтительно таким, как гибридизация в 50% формамиде/6 SSC/0,1% SDS/100 мкг/мл ss-ДHK, где температура гибридизации выше 37 С, а температура промывания в 0,1 SSC/0,1% SDS выше 55 С. Фразы "выделенный" или "биологически чистый" относятся к веществу, которое по существу или практически не содержит компонентов, которые обычно окружают вещество в природном состоянии. Таким образом, выделенные пептиды в соответствии с данным изобретением предпочтительно не содержат веществ, обычно присутствующих в окружении пептидов in situ. Например, полинуклеотид считают"выделенным", если он практически не содержит примеси полинуклеотидов, соответствующих или комплементарных генам, отличным от генов STEAP-1, или кодирующих полипептиды, отличные от генного продукта STEAP-1 или его фрагментов. Опытный специалист может легко использовать способы выделения нуклеиновых кислот для получения выделенного полинуклеотида STEAP-1. Белок считают "выделенным", если, например, с помощью физических, механических или химических методов белокSTEAP-1 отделяют от компонентов клеток, обычно связанных с белком. Опытный специалист может легко использовать стандартные методы очистки для получения выделенного белка STEAP-1. Альтернативно, выделенный белок можно получить химическими методами.- 17014870 Подходящие "метки" включают в себя радионуклиды, ферменты, субстраты, кофакторы, ингибиторы, флуоресцентные фрагменты, хемилюминесцентные фрагменты, магнитные частицы и т.п. Патенты,описывающие применение таких меток, включают в себя патенты США 3817837; 3850752; 3939350; 3996345; 4277437; 4275149 и 4366241. Кроме того, антитела, предлагаемые в настоящем описании, можно использовать в качестве антигенсвязывающего компонента флуоресцентных антител. См., например,Zeytun et al., Nat. Biotechnol. 21: 1473-79 (2003). Термин "млекопитающее" относится к любому организму класса млекопитающих и включает в себя мышей, крыс, кроликов, собак, кошек, коров, лошадей и людей. В одном воплощении согласно изобретению млекопитающее представляет собой мышь. В другом воплощении согласно изобретению млекопитающее представляет собой человека. Термины "метастазирующий рак простаты" и "метастазирующее заболевание" относятся к раку простаты, распространившемуся в региональные лимфатические узлы или в отдаленные участки организма, и включает в себя заболевание стадии D по системе AUA и заболевание стадии TNM+ по системе TNM. Как и в случае с местно распространенным раком простаты, для пациентов с метастазирующим заболеванием хирургическая операция не рекомендуется, а предпочтительным способом лечения является гормональная (антиандрогенная) терапия. У пациентов с метастазирующим раком простаты с течением времени, через 12-18 месяцев после начала лечения, развивается андроген-устойчивое состояние. Приблизительно половина таких андроген-устойчивых пациентов умирает в течение 6 месяцев после развития данного состояния. Чаще всего рак простаты метастазирует в кости. Костные метастазы рака простаты чаще являются остеобластными, чем остеолитическими (т.е. приводят к образованию костей с сетчатой структурой). Костные метастазы чаще всего можно обнаружить в позвоночнике, затем в бедренной кости, тазовых костях, грудной клетке, черепе и плечевой кости. Другие распространенные участки метастазирования включают в себя лимфатические узлы, легкие, печень и мозг. Метастазирующий рак простаты обычно диагностируют путем открытия или лапароскопического иссечения тазовых лимфатичских узлов, радионуклидного анализа целой крови, радиографического исследования скелета и/или биопсии патологического изменения кости. Термины "модулятор", или "тестируемое соединение", или "лекарственное средство-кандидат", или используемые в данном описании грамматические эквиваленты относятся к любой молекуле, например белку, олигопептиду, маленькой органической молекуле, полисахариду, полинуклеотиду и т.п., тестируемым на способность непосредственно или косвенно изменять раковый фенотип, или экспрессию раковых последовательностей, например последовательностей нуклеиновых кислот или белков, или эффекты раковых последовательностей (например, сигнальные эффекты, экспрессию генов, взаимодействие белков и др.). В одном аспекте модулятор нейтрализует эффект ракового белка согласно изобретению. "Нейтрализация" означает ингибирование или блокировку активности белка, наряду с последующим эффектом на клетку. В другом аспекте модулятор нейтрализует эффект гена и соответствующего ему белка согласно изобретению путем нормализации уровней указанного белка. В предпочтительных воплощениях модуляторы изменяют профили экспрессии или профиль экспрессии нуклеиновых кислот или белков, предлагаемых в данном описании, или пути, лежащие ниже эффектора. В одном воплощении модулятор подавляет раковый фенотип, например, до нормальных характеристик ткани. В другом воплощении модулятор индуцирует раковый фенотип. Обычно несколько аналитических смесей анализируют в параллелях с разными концентрациями средства с получением разных ответов на разные концентрации. Как правило, одна из данных концентраций служит отрицательным контролем, т.е. нулевой концентрацией или концентрацией, вызывающей эффект ниже уровня детектирования. Модуляторы, лекарственные средства-кандидаты или тестируемые соединения охватывают разные классы химических соединений, однако обычно они представляют собой органические молекулы, предпочтительно маленькие органические соединения, имеющие молекулярную массу более 100 и менее чем приблизительно 2500 Да. Предпочтительные маленькие молекулы имеют молекулярную массу меньше 2000, меньше 1500 или меньше 1000 или 500 Да. Средства-кондидаты содержат функциональные группы, необходимые для структурного взаимодействия с белками, в особенности способные образовывать водородные связи, и обычно включают в себя, по меньшей мере, аминовую, карбонильную, гидроксильную или карбоксильную группу, предпочтительно, они содержат две функциональные химические группы. Средства-кандидаты часто содержат циклический атом углерода или гетероциклические структуры и/или ароматические или полиароматические структуры, замещенные одной или несколькими из вышеуказанных функциональных групп. Модуляторы также включают в себя такие биомолекулы, как пептиды, сахариды, жирные кислоты, стероиды, пурины, пиримидины, их производные, структурные аналоги или сочетания. Особенно предпочтительными молекулами являются пептиды. Одним классом модуляторов являются пептиды, например, содержащие приблизительно от 5 до 35 аминокислот, предпочтительно приблизительно от 5 до 20 аминокислот, особенно предпочтительно приблизительно от 7 до 15 аминокислот. Предпочтительно раковый модуляторный белок является растворимым, содержит участок, отличный от трансмембранного, и/или содержит N-концевой Cys, повышающий растворимость. В одном воплощении С-конец фрагмента держат в виде свободной кислоты, а N-конец - в виде свободного амина,чтобы обеспечить конденсацию, например, с цистеином. В одном воплощении раковый белок согласно- 18014870 изобретению конъюгируют с иммуногенным агентом, как описано в данном документе. В одном воплощении раковый белок конъюгируют с БСА. Пептиды согласно изобретению, например, имеющие предпочтительную длину, можно соединить друг с другом или с другой аминокислотой с получением более длинного пептида/белка. Модуляторные пептиды могут представлять собой продукты расщепления природных белков, как указано выше, рандомизированные пептиды или пептиды, рандомизированные "с отклонением". В предпочтительном воплощении пептидные/белковые модуляторы представляют собой антитела и их фрагменты, определенные в данном описании. Модуляторами злокачественного заболевания также могут быть нуклеиновые кислоты. Нуклеиновые модулирующие средства могут представлять собой природные нуклеиновые кислоты, рандомизированные нуклеиновые кислоты или нуклеиновые кислоты, рандомизированные "с отклонением". Например, в подходе, аналогичном описанному выше для белков, можно использовать продукты расщепления прокариотических или эукариотических геномов. В данном описании термин "моноклональное антитело" относится к антителу, полученному из популяции, по существу, гомогенных антител, т.е. отдельные антитела, составляющие популяцию, являются идентичными, за исключением возможных природных мутаций, которые могут присутствовать в минорных количествах. Моноклональные антитела являются высокоспецифичными по отношению к одному антигенному эпитопу. Наоборот, препараты традиционных (поликлональных) антител, как правило,включают в себя множество антител, направленных против разных эпитопов (или специфичных по отношению к разным эпитопам). В одном воплощении поликлональные антитела включают в себя совокупность моноклональных антител, обладающих специфичностью, аффинностью или авидностью по отношению к разным эпитопам в одном антигене, который содержит несколько антигенных эпитопов. Определение "моноклональный" указывает на характер антитела, полученного из практически гомогенной популяции антител, и не подразумевает получение антитела каким-либо конкретным способом. Например, моноклональные антитела, используемые в соответствии с настоящим изобретением, могут быть получены гибридомным методом, впервые описанным Kohler et al., Nature, 256: 495 (1975), или методами рекомбинантных ДНК (см., например, патент США 4816567). "Моноклональные антитела" также могут быть выделены из фаговых библиотек антител с помощью методов, описанных, например, в Clacksonet al., Nature, 352: 624-628 (1991) и Marks et al., J. Mol. Biol. 222: 581-597 (1991). Kd связывания указанных моноклональных антител составляет по меньшей мере приблизительно 1 мкМ, чаще по меньшей мере приблизительно 300 нМ, как правило, по меньшей мере приблизительно 30 нМ, предпочтительно по меньшей мере приблизительно 10 нМ, более предпочтительно по меньшей мере приблизительно 3 нМ или менее и обычно определяется методом ELISA. Термин "мотив", например биологический мотив белка, родственного STEAP-1, относится к любой образованной аминокислотами части первичной последовательности белка, которая связана с конкретной функцией (например, белок-белковым взаимодействием, взаимодействием белок-ДНК и др.), или модификацией (например, фосфорилированная, гликозилированная или амидированная часть), или локализацией (например, секреторная последовательность, последовательность ядерной локализации и др.),или к последовательности, связанной с иммунными функциями, либо гуморальными, либо клеточными. Мотив может быть либо смежным с некоторыми положениями, коррелирующими с определенной функцией или определенным свойством, либо совпадать с такими положениями. В контексте мотивов HLA данный термин относится к совокупности остатков в пептиде определенной длины, как правило, содержащем приблизительно от 8 до 13 аминокислот в случае мотива HLA класса I и приблизительно от 6 до 25 аминокислот в случае мотива HLA класса II, которая распознается конкретной молекулой HLA. Пептидные мотивы для связывания HLA обычно различаются в белках, кодируемых разными аллелями человеческого HLA, и различаются по совокупности первичных и вторичных анкорных остатков. Термин "фармацевтический наполнитель" включает в себя такие вещества, как вспомогательные средства, носитель, средства, регулирующие рН, и забуферивающие средства, средства, регулирующие тоничность, увлажняющие средства, консерванты и т.п. Термин "фармацевтически приемлемый" относится к нетоксичной и/или инертной композиции, физиологически совместимой с людьми или другими млекопитающими. Термин "полинуклеотид" относится к полимерной форме нуклеотидов длиной по меньшей мере в 10 оснований или пар оснований, либо рибонуклеотидов, либо дезоксинуклеотидов, либо модифицированных нуклеотидов любого типа, подразумевается, что данный термин включает в себя одно- или двухцепочечные формы ДНК и/или РНК. В данной области указанный термин часто используется как взаимозаменяемый с термином "олигонуклеотид". Полинуклеотид может содержать нуклеотидную последовательность, раскрытую в данном описании, где тимидин (Т), как показано, например, на фиг. 2, может быть заменен на урацил (U); данное определение связано с различиями в химических структурах ДНК и РНК, в особенности относится к тому, что одним из четырех доминирующих оснований в РНК является урацил (U), вместо которого в ДНК присутствует тимидин (Т).- 19014870 Термин "полипептид" относится к полимеру, содержащему по меньшей мере приблизительно 4, 5,6, 7 или 8 аминокислот. В данном описании для обозначения аминокислот используют стандартные трехбуквенные или однобуквенные символы. В данной области указанный термин часто используется как взаимозаменяемый с терминами "пептид" или "белок"."Первичный анкорный остаток" HLA представляет собой аминокислоту в конкретном положении пептидной последовательности, которая, как полагают, участвует в образовании точки контакта между иммуногенным пептидом и молекулой HLA. От одного до трех, как правило два, первичных анкорных остатковв пептиде определенной длины обычно образуют "мотив" иммуногенного пептида. Полагают,что данные остатки находятся в тесном контакте с пептидсвязывающей бороздкой молекулы HLA, причем их боковые цепи погружены в специфические карманы связывающей бороздки. В одном воплощении, например, первичные анкорные остатки молекулы HLA класса I расположены в положении 2 (с аминоконца), а с карбоксильной стороны - в положениях 8, 9, 10, 11 или 12 пептидного эпитопа в соответствии с данным изобретением. Альтернативно, в другом воплощении первичные анкорные отатки пептида, связывающие молекулу HLA класса II, отдалены в пространстве друг от друга в большей степени, чем от концов пептида, где длина пептида обычно составляет по меньшей мере 9 аминокислот. Первичные анкорные положения для каждого мотива и супермотива приведены в табл. IV(A). Например,аналоговые пептиды можно создать путем изменения присутствия или отсутствия конкретных остатков в первичных и/или вторичных анкорных положениях, приведенных в табл. IV. Такие аналоги используют для модуляции связывающего сродства и/или установления популяционного распределения пептида,содержащего конкретный мотив или супермотив HLA."Радиоактивные изотопы" включают в себя, без ограничения, нижеследующие неограничивающие примеры применения, которые приведены в табл. IV(I). Под термином "рандомизированный" или его грамматическими эквивалентами в данном описании понимают нуклеиновые кислоты и белки, состоящие, по существу, из случайных нуклеотидов и аминокислот соответственно. Данные рандомизированные пептиды (или нуклеиновые кислоты, описанные в данном документе) в каждом положении могут содержать любой нуклеотид или любую аминокислоту. Можно разработать способ синтеза рандомизированных белков или нуклеиновых кислот, содержащих все или почти все возможные сочетания по всей длине последовательности, с получением библиотеки рандомизированных биологически активных белковых средств-кандидатов. В одном воплощении библиотека является "полностью рандомизированной" и не имеет последовательностей отнесения или постоянных элементов в каком-либо положении. В другом воплощении библиотека представляет собой библиотеку, "рандомизированную с отклонением". То есть некоторые положения в последовательности либо оставляют постоянными, либо выбирают из ограниченного числа вариантов. Например, нуклеотидные или аминокислотные остатки рандомизируют в пределах определенного класса, например гидрофобных аминокислот, гидрофильных остатков, стерически отклоняющихся(либо маленьких, либо больших) остатков, для создания доменов, связывающих нуклеиновые кислоты,для введения остатков цистеина, для образования поперечных связей, для введения остатков пролина в домены SH-3, остатков серина, треонина, тирозина или гистидина в участки фосфорилирования и др.,или в пределах класса пуринов и др."Рекомбинантная" молекула ДНК или РНК представляет собой молекулу ДНК или РНК, полученную в результате молекулярных манипуляций in vitro. В данном описании термин "одноцепочечный Fv" или "scFv", или "одноцепочечное" антитело относится к фрагментам антитела, содержащим домены антитела VH и VL, где указанные домены находятся на одной полипептидной цепи. Обычно полипептид Fv содержит также полипептидный линкер между доменами VH и VL, который позволяет scFv образовывать структуру, необходимую для связывания антигена. Обзор по scFv см. в Pluckthun, THE PHARMACOLOGY OF MONOCLONAL ANTIBODIES, vol. 113,Rosenburg and Moore eds. Springer-Verlag, New York, p. 269-315 (1994). Неограничивающие примеры "маленьких молекул" включают в себя соединения, которые связывают STEAP-1 или взаимодействуют с ним, лиганды, в том числе гормоны, нейропептиды, хемокины, отдушки, фосфолипиды и их функциональные эквиваленты, которые связывают и предпочтительно ингибируют белковую функцию STEAP-1. Такие маленькие молекулы, без ограничения, предпочтительно имеют молекулярную массу менее чем приблизительно 10 кДа, более предпочтительно менее чем приблизительно 9, приблизительно 8, приблизительно 7, приблизительно 6, приблизительно 5 или приблизительно 4 кДа. В некоторых воплощениях маленькие молекулы физически связаны с белком STEAP-1 или связывают данный белок; не обнаружены в природных метаболических путях и/или лучше растворяются в водных, чем в неводных растворах. В данном описании термин "специфический" относится к селективному связыванию антитела с целевым антигенным эпитопом. Специфичность связывания антител можно анализировать путем сравнения связывания с целевым антигеном со связыванием с другим антигеном или смесью антигенов в заданной комбинации условий. Если антитело связывается с целевым антигеном по меньшей мере в 2, 5, 7 и предпочтительно в 10 раз лучше, чем с другим антигеном или смесью антигенов, то оно считается специфическим. В одном воплощении специфическое антитело представляет собой антитело, которое свя- 20014870 зывает только антиген STEAP-1, но не связывает другие антигены. В другом воплощении специфическое антитело представляет собой антитело, которое связывает человеческий антиген STEAP-1, но не связывает антиген STEAP-1, отличный от человеческого и обладающий 70, 75, 80, 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96,97, 98, 99% или более аминокислотной гомологией с антигеном STEAP-1. В другом воплощении специфическое антитело представляет собой антитело, которое связывает человеческий антиген STEAP-1 и связывает мышиный антиген STEAP-1, но в большей степени оно связывает человеческий антиген. В другом воплощении специфическое антитело представляет собой антитело, которое связывает человеческий антиген STEAP-1 и антиген STEAP-1 приматов, но в большей степени оно связывает человеческий антиген. В следующем воплощении специфическое антитело связывает человеческий антиген STEAP-1 и любой отличный от человеческого антиген STEAP-1 или любое их сочетание, но в большей степени оно связывает человеческий антиген."Жесткость" гибридизации легко определяется рядовым специалистом в данной области и, как правило, эмпирически рассчитывается в зависимости от длины зонда, температуры промывания и концентрации соли. Как правило, для соответствующего отжига более длинных зондов требуется более высокая температура, тогда как более короткие зонды требуют более низких температур. Как правило, гибридизация зависит от способности денатурированных последовательностей нуклеиновых кислот к повторному отжигу, если комплементарные цепи присутствуют в среде при температуре ниже точки плавления. Чем выше степень желаемой гомологии между зондом и гибридизующейся с ним последовательностью,тем выше относительная температура, которую можно использовать. Следовательно, более высокая относительная температура может делать условия реакции более жесткими, а более низкая температура менее жесткими. Дополнительные подробности и разъяснения, касающиеся жесткости реакций гибридизации, можно найти в Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, Wiley Interscience Publishers,(1995).(1) применение низкой ионной силы и высокой температуры для промывания, например, 0,015 М хлорид натрия/0,0015 М цитрат натрия/0,1% додецилсульфат натрия при 50 С;(2) применение в процессе гибридизации денатурирующего средства, такого как формамид, например 50% (об./об.) формамид и 0,1% бычий сывороточный альбумин/0,1% фиколл/0,1% поливинилпирролидон/50 мМ натрий-фосфатный буфер, рН 6,5, содержащий 750 мМ хлорид натрия, 75 мМ цитрат натрия, при 42 С или(3) применение 50% формамида, 5 SSC (0,75 М NaCl, 0,075 М цитрат натрия), 50 мМ фосфата натрия (рН 6,8), 0,1% пирофосфата натрия, 5 раствора Денхардта, ДНК спермы лосося, обработанной ультразвуком (50 мкг/мл), 0,1% SDS и 10% сульфата декстрана при 42 С с промыванием при 42 С в 0,2 SSC (хлорид натрия/цитрат натрия) и 50% формамиде при 55 С и затем с промыванием в условиях высокой жесткости, включающих в себя применение 0,1 SSC, содержащей EDTA, при 55 С. "Условия средней жесткости" описаны, например, в Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, NewYork: Cold Spring Harbor Press, 1989 и включают в себя применение раствора для промывания и условий гибридизации (например, температуры, ионной силы и % SDS), менее жестких, чем описанные выше. Примером условий средней жесткости является инкубация в течение ночи при 65 С в растворе, содержащем 1% бычий сывороточный альбумин, 0,5 М фосфат натрия, рН 7,5, 1,25 мМ EDTA и 7% SDS 5 SSC (150 мМ NaCl, 15 мМ трицитрат натрия), с последующим промыванием фильтров в 2 SSC/1%SDS при 50 С и 0,2 SSC/0,1% SDS при 50 С. Специалисту в данной области известно, как выбрать температуру, ионную силу и др. в зависимости от таких факторов, как длина зонда и т.п."Супермотив" HLA представляет собой пептидсвязывающий специфичный участок, общий для молекул HLA, кодируемых двумя или более аллелями HLA. Общая частота фенотипической встречаемостиHLA в разных этнических популяциях приведена в табл. IV(F). Разные супертипы включают в себя, без ограничения, следующие разновидности:- 21014870 Рассчитанное популяционное распределение разных сочетаний супертипов HLA приведено в табл. IV(G). В данном описании термины "лечить" или "терапевтический", а также грамматически родственные им термины относятся к какому-либо улучшению любого последствия заболевания, такому как повышение выживаемости, уменьшение процента смертности и/или уменьшение побочных эффектов, свойственных альтернативным терапевтическим средствам; специалистам в данной области известно, что полное излечение заболевания является предпочтительным, но не обязательным требованием для акта лечения."Трансгенное животное" (например, мышь или крыса) представляет собой животное, несущее клетки, содержащие трансген, который вводят животному или его предку в пренатальном периоде, например на эмбриональной стадии. "Трансген" представляет собой ДНК, интегрированную в геном клетки, из которой развивается трансгенное животное. В данном описании HLA или "вакцина" клеточного иммунного ответа представляет собой композицию, которая содержит или кодирует один или несколько пептидов согласно изобретению. Существует несколько воплощений таких вакцин, например смесь одного или нескольких отдельных пептидов; один или несколько пептидов согласно изобретению, содержащих полиэпитопный пептид; или нуклеиновые кислоты, которые кодируют такие отдельные пептиды или полипептиды, например мини-ген, который кодирует полиэпитопный пептид. Термин "один или несколько пептидов" может включать в себя любое целое число от 1 до 150 или больше, например по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15,16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45,46, 47, 48, 49, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, 110, 115, 120, 125, 130, 135, 140, 145 или 150,пептидов согласно изобретению. Пептиды или полипептиды, необязательно, можно модифицировать,например, путем липидизации, добавления меток или других последовательностей. Пептиды HLA классаI согласно изобретению можно смешать или связать с пептидами HLA класса II, чтобы обеспечить активацию как цитотоксических, так и хелперных Т-лимфоцитов. HLA вакцины также могут содержать сенсибилизированные пептидом клетки, экспонирующие антиген, например дендритные клетки. Термин "вариант" относится к молекуле, которая отличается от описываемого или нормального типа, такой как белок, который содержит один или несколько других аминокислотных остатков в соответствующем положении (соответствующих положениях) конкретно описываемого белка (например, белкаSTEAP-1, приведенного на фиг. 2 или 3). Аналог является примером вариантного белка. Другими примерами вариантов являются изоформы, образующиеся в результате сплайсинга и полиморфизма отдельных нуклеотидов (SNP)."STEAP-1-родственные белки" согласно изобретению включают в себя белки, конкретно описанные в данном документе, а также их аллельные варианты, варианты, содержащие консервативные замены,аналоги и гомологи, которые могут быть выделены/получены и охарактеризованы без проведения излишних экспериментов с помощью способов, описанных в данном документе или хорошо известных в данной области. В объем изобретения также входят гибридные белки, в которых объединены части разных белков или их фрагментов, а также гибридные белки, состоящие из белка STEAP-1 и гетерологичного полипептида. Такие белки STEAP-1 в совокупности называют белками, родственными STEAP-1, белками согласно изобретению или STEAP-1. Термин "белок, родственный STEAP-1", относится к полипептидному фрагменту или белковой последовательности STEAP-1, содержащей 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23,24, 25 или более аминокислот или по меньшей мере 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 80, 85, 90, 95, 100,105, 110, 115, 120, 125, 130, 135, 140, 145, 150, 155, 160, 165, 170, 175, 180, 185, 190, 195, 200, 225, 250,275, 300, 325, 330, 335, 339 или более аминокислот.II) Полинуклеотиды STEAP-1. В одном аспекте данное изобретение предлагает полинуклеотиды, соответствующие или комплементарные полноразмерным гену, мРНК и/или кодирующей последовательности STEAP-1 или их части,предпочтительно в выделенном виде, в том числе полинуклеотиды, кодирующие белок, родственныйSTEAP-1, и его фрагменты, ДНК, РНК, гибрид ДНК/РНК и родственные молекулы, полинуклеотиды или олигонуклеотиды, комплементарные гену STEAP-1 или последовательности мРНК или ее части, и полинуклеотиды или олигонуклеотиды, гибридизующиеся с геном STEAP-1, мРНК или с полинуклеотидом,кодирующим STEAP-1 (вместе их называют "полинуклеотиды STEAP-1"). Во всех случаях упоминаемый в данном разделе Т может быть заменен на U на фиг. 2.- 22014870 Воплощения полинуклеотида STEAP-1 включают в себя полинуклеотид STEAP-1, имеющий последовательность, изображенную на фиг. 2, причем в нуклеотидной последовательности STEAP-1, изображенной на фиг. 2, Т может обозначать U; по меньшей мере 10 смежных нуклеотидов полинуклеотида,имеющего последовательность, изображенную на фиг. 2; или по меньшей мере 10 смежных нуклеотидов полинуклеотида, имеющего последовательность, изображенную на фиг. 2, где Т может обозначать U. Например, воплощения нуклеотидов STEAP-1 включают в себя, без ограничения:(I) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2, где Т также может обозначать U;(II) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2 А, от нуклеотидного остатка номер 66 до нуклеотидного остатка номер 1085, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(III) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2 В, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(IV) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2 С, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 944, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(V) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2D, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(VI) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2 Е, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(VII) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2F, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(VIII) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2G, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(IX) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2 Н, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(X) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2I, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стоп-кодон,где Т также может обозначать U;(XI) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2J, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стоп-кодон,где Т также может обозначать U;(XII) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2K, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(XIII) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2L, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(XIV) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2 М, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(XV) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2N, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(XVI) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2O, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(XVII) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2 Р, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стопкодон, где Т также может обозначать U;(XVIII) полинуклеотид, по существу содержащий или содержащий последовательность, изображенную на фиг. 2Q, от нуклеотидного остатка номер 96 до нуклеотидного остатка номер 872, включая стоп-кодон, где Т также может обозначать U;(XIX) полинуклеотид, кодирующий белок, родственный STEAP-1, который по меньшей мере на 90,91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% гомологичен полноразмерной аминокислотной последовательности, изображенной на фиг. 2A-2Q;(XX) полинуклеотид, кодирующий белок, родственный STEAP-1, который по меньшей мере на 90,91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентичен полноразмерной аминокислотной последовательности, изображенной на фиг. 2A-2Q;(XXI) полинуклеотид, кодирующий по меньшей мере один из пептидов, приведенных в табл. V-XVIII и XXII-LI, как описано в патентной заявке США 10/236878, поданной 6 сентября 2002 г.,конкретное содержание которой полностью включено в данное описание в качестве ссылки;(XXII) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 А с любым целочисленным приращением вплоть до 339, который содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28,29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислотных положений со значением больше 0,5 по профилю гидрофильности, приведенному на фиг. 5;(XXIII) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 А с любым целочисленным приращением вплоть до 339, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33,34, 35 аминокислотных положений со значением меньше 0,5 по профилю гидрофобности, приведенному на фиг. 6;(XXIV) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 А с любым целочисленным приращением вплоть до 339, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33,34, 35 аминокислотных положений со значением больше 0,5 по профилю процента доступных остатков,приведенному на фиг. 7;(XXV) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 А с любым целочисленным приращением вплоть до 399, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33,34, 35 аминокислотных положений со значением больше 0,5 по профилю средней жесткости, приведенному на фиг. 8;(XXVI) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 А с любым целочисленным приращением вплоть до 339, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33,34, 35 аминокислотных положений со значением больше 0,5 по профилю бета-складки, приведенному на фиг. 9;(XXVII) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 В и 3D с любым целочисленным приращением вплоть до 258, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31,32, 33, 34, 35 аминокислотных положений со значением больше 0,5 по профилю гидрофильности, приведенному на фиг. 5;(XXVIII) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 В и 3D с любым целочисленным приращением вплоть до 258, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31,32, 33, 34, 35 аминокислотных положений со значением меньше 0,5 по профилю гидрофобности, приведенному на фиг. 6;(XXIX) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 В и 3D с любым целочисленным приращением вплоть до 258, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31,32, 33, 34, 35 аминокислотных положений со значением больше 0,5 по профилю процента доступных остатков, приведенному на фиг. 7;(XXX) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 В и 3D с любым целочисленным приращением вплоть до 258, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31,32, 33, 34, 35 аминокислотных положений со значением больше 0,5 по профилю средней жесткости, приведенному на фиг. 8;(XXXI) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 В и 3D с любым целочисленным приращением вплоть до 258, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31,32, 33, 34, 35 аминокислотных положений со значением больше 0,5 по профилю бета-складки, приведенному на фиг. 9;(XXXII) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 С с любым целочисленным приращением вплоть до 282, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33,34, 35 аминокислотных положений со значением больше 0,5 по профилю гидрофильности, приведенному на фиг. 5;(XXXIII) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 С с любым целочисленным приращением вплоть до 282, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33,34, 35 аминокислотных положений со значением меньше 0,5 по профилю гидрофобности, приведенному на фиг. 6;(XXXIV) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 С с любым целочисленным приращением вплоть до 282, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33,34, 35 аминокислотных положений со значением больше 0,5 по профилю процента доступных остатков,приведенному на фиг. 7;(XXXV) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 С с любым целочисленным приращением вплоть до 282, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33,34, 35 аминокислотных положений со значением больше 0,5 по профилю средней жесткости, приведенному на фиг. 8;(XXXVI) полинуклеотид, кодирующий пептидный участок, состоящий по меньшей мере из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 аминокислот пептида фиг. 3 С с любым целочисленным приращением вплоть до 282, который содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33,34, 35 аминокислотных положений со значением больше 0,5 по профилю бета-складки, приведенному на фиг. 9;(XXXVII) полинуклеотид, полностью комплементарный полинуклеотиду по любому из пп.(I)-(XXXVI);(XXXVIII) полинуклеотид, полностью комплементарный полинуклеотиду по любому из пп.(I)-(XXXVII);(XXXIX) пептид, который кодируется полинуклеотидом по любому из пп.(I)-(XXXVIII); и(XL) композиция, содержащая полинуклеотид по любому из пп.(I)-(XXXVIII) или пептид по п.(XXXIX) вместе с фармацевтическим наполнителем и/или в составе человеческой стандартной лекарственной формы;(XLI) способ применения полинуклеотида по любому из пп.(I)-(XXXVIII), или пептида по п.(XXXIX), или композиции по п.(XL) для модуляции экспрессии STEAP-1 в клетке;(XLII) способ применения полинуклеотида по любому из пп.(I)-(XXXVIII), или пептида по п.(XXXIX), или композиции по п.(XL) для диагностики, профилактики, прогнозирования или лечения субъекта, несущего клетку, экспрессирующую STEAP-1;(XLIII) способ применения полинуклеотида по любому из пп.(I)-(XXXVIII), или пептида по п.(XXXIX), или композиции по п.(XL) для диагностики, профилактики, прогнозирования или лечения субъекта, несущего клетку, экспрессирующую STEAP-1, где указанная клетка относится к раковой ткани, приведенной в табл. I;(XLIV) способ применения полинуклеотида по любому из пп.(I)-(XXXVIII), или пептида по п.(XXXIX), или композиции по п.(XL) для диагностики, профилактики, прогнозирования или лечения рака;(XLV) способ применения полинуклеотида по любому из пп.(I)-(XXXVIII), или пептида по п.(XXXIX), или композиции по п.(XL) для диагностики, профилактики, прогнозирования или лечения рака ткани, приведенной в табл. I; и(XLVI) способ применения полинуклеотида по любому из пп.(I)-(XXXVIII), или пептида по п.(XXXIX), или композиции по п.(XL) для идентификации или характеристики модулятора экспрессии- 25014870 В данном описании подразумевается, что интервал конкретно включает в себя все находящиеся внутри него целочисленные значения. Типичные воплощения согласно изобретению, раскрытые в данном описании, включают в себя полинуклеотиды STEAP-1, которые кодируют конкретные фрагменты последовательностей мРНК STEAP-1(а также полинуклеотиды, комплементарные таким последовательностям), такие как полинуклеотиды,кодирующие, например, нижеследующие белки и/или их фрагменты: 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15,16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, 110, 115,120, 125, 130, 135, 140, 145, 150, 155, 160, 165, 170, 175, 180, 185, 190, 195, 200, 225, 250, 275, 300, 325,330, 335, 339 или больше смежных аминокислот STEAP-1, вариант 1; другие варианты имеют следующую максимальную длину: вариант 2 - 258 аминокислот; вариант 3 - 282 аминокислот и вариант 4 - 258 аминокислот. Например, типичные воплощения согласно изобретению, раскрытые в данном описании, включают в себя полинуклеотиды и кодируемые ими пептиды, полинуклеотиды, кодирующие фрагменты приблизительно от аминокислоты 1 до аминокислоты 10 белка STEAP-1, изображенного на фиг. 2 или 3; полинуклеотиды, кодирующие фрагменты приблизительно от аминокислоты 10 до аминокислоты 20 белкаSTEAP-1, изображенного на фиг. 2 или 3; полинуклеотиды, кодирующие фрагменты приблизительно от аминокислоты 20 до аминокислоты 30 белка STEAP-1, изображенного на фиг. 2 или 3, полинуклеотиды,кодирующие фрагменты приблизительно от аминокислоты 30 до аминокислоты 40 белка STEAP-1, изображенного на фиг. 2 или 3; полинуклеотиды, кодирующие фрагменты приблизительно от аминокислоты 40 до аминокислоты 50 белка STEAP-1, изображенного на фиг. 2 или 3; полинуклеотиды, кодирующие фрагменты приблизительно от аминокислоты 50 до аминокислоты 60 белка STEAP-1, изображенного на фиг. 2 или 3; полинуклеотиды, кодирующие фрагменты приблизительно от аминокислоты 60 до аминокислоты 70 белка STEAP-1, изображенного на фиг. 2 или 3; полинуклеотиды, кодирующие фрагменты приблизительно от аминокислоты 70 до аминокислоты 80 белка STEAP-1, изображенного на фиг. 2 или 3; полинуклеотиды, кодирующие фрагменты приблизительно от аминокислоты 80 до аминокислоты 90 белка STEAP-1, изображенного на фиг. 2 или 3; полинуклеотиды, кодирующие фрагменты приблизительно от аминокислоты 90 до аминокислоты 100 белка STEAP-1, изображенного на фиг. 2 или 3, с приращением приблизительно 10 аминокислот, заканчивая аминокислотой карбоксильного конца, изображенной на фиг. 2 или 3. Соответственно полинуклеотиды, кодирующие фрагменты аминокислотной последовательности (приблизительно из 10 аминокислот), включающие в себя аминокислоты белкаSTEAP-1 от 100 до С-концевой аминокислоты, являются воплощениями согласно изобретению, где подразумевается, что каждое конкретное аминокислотное положение включает в себя указанное положение плюс или минус пять аминокислотных остатков. Полинуклеотиды, кодирующие относительно длинные фрагменты белка STEAP-1, также входят в объем согласно изобретению. Например, полинуклеотиды, кодирующие фрагмент приблизительно от аминокислоты 1 (или 20, или 30, или 40 и т.д.) до аминокислоты 20 (или 30, или 40, или 50 и т.д.) белка или "варианта" STEAP-1, изображенного на фиг. 2 или 3, можно получить с помощью ряда методов, хорошо известных в данной области. Данные полинуклеотидные фрагменты могут содержать любой фрагмент последовательности STEAP-1, изображенной на фиг. 2. Другие иллюстративные воплощения согласно изобретению, раскрытые в данном описании, включают в себя фрагменты полинуклеотида STEAP-1, кодирующие один или несколько биологических мотивов, входящих в состав последовательности белка или варианта STEAP-1, включающей в себя одну или несколько из мотив-несущих субпоследовательностей белка или варианта STEAP-1, приведенных в табл. V-XVIII и XXII-LI. В другом воплощении типичные полинуклеотидные фрагменты согласно изобретению кодируют один или несколько участков белка или варианта STEAP-1, гомологичных известной молекуле. В другом воплощении согласно изобретению типичные полинуклеотидные фрагменты могут кодировать один или несколько участков N-гликозилирования белка или варианта STEAP-1, участков фосфорилирования под действием цАМФ- и цГМФ-зависимой протеинкиназы, участков фосфорилирования под действием казеинкиназы II или участков N-миристоилирования и амидирования. Чтобы определить исходное положение любого пептида, приведенного в табл. V-XVIII и XXII-LI(собирательные таблицы пептидов HLA), относительно родительского белка, например варианта 1, варианта 2 и др., следует учитывать три фактора: конкретный вариант, длину пептида, приведенную в таблице пептидов HLA, и поисковые пептиды, приведенные в табл. LII. Как правило, поисковые пептиды используют для получения пептидов HLA конкретного варианта. Положение каждого поискового пептида относительно соответствующей родительской молекулы приведено в табл. LII. Соответственно, если поисковый пептид начинается в положении "X", нужно добавить значение "X минус 1" к каждому положению в табл. V-XVIII и XXII-LI, чтобы определить действительное положение пептидов HLA в родительской молекуле. Например, если конкретный поисковый пептид начинается в положении 150 родительской молекулы, нужно добавить 150-1, т.е. 149, к каждому аминокислотному положению пептидаHLA, чтобы рассчитать положение аминокислоты в родительской молекуле.II.A.1. Выявление генетических нарушений. Полинуклеотиды, описанные в предыдущих разделах, имеют ряд конкретных применений. Хромосомное расположение человеческого гена STEAP-1 описано в примере, озаглавленном "Хромосомное картирование STEAP-1". Например, поскольку ген STEAP-1 находится в определенной хромосоме, полинуклеотиды, кодирующие разные участки белков STEAP-1, используют для характеристики цитогенетических нарушений в данном хромосомном регионе, например нарушений, которые, как установлено,связаны с различными раковыми заболеваниями. Было обнаружено, что ряд хромосомных нарушений в некоторых генах, включающих в себя реаранжировки, представляют собой цитогенетические нарушения,часто наблюдающиеся при разных злокачественных заболеваниях (см., например, Krajinovic et al., Mutat.Res. 382(3-4): 81-83 (1998); Johansson et al., Blood, 86(10): 3905-3914 (1995) и Finger et al., P.N.A.S. 85(23): 9158-9162 (1988. Так, полинуклеотиды, кодирующие конкретные участки белков STEAP-1, можно использовать для более точного, чем это было возможно ранее, выявления цитогенетических нарушений в хромосомном участке, кодирующем STEAP-1, которые могут вносить вклад в формирование злокачественного фенотипа. В данном контексте указанные полинуклеотиды удовлетворяют существующую в данной области потребность в увеличении чувствительности скрининга хромосом, которая позволила бы идентифицировать более трудноуловимые и менее распространенные хромосомные нарушения (см., например, Evans et al., Am. J. Obstet. Gynecol. 171(4): 1055-1057 (1994. Далее, поскольку было обнаружено, что STEAP-1 интенсивно экспрессируется при раке простаты и других злокачественных заболеваниях, полинуклеотиды STEAP-1 можно использовать для определения статуса генных продуктов STEAP-1 в нормальной ткани по сравнению с раковой. Как правило, полинуклеотиды, кодирующие конкретные участки белков STEAP-1, используют для оценки изменений (таких как делеции, вставки, точечные мутации или изменения, приводящие к утрате антигена, и др.) в конкретных участках гена STEAP-1, таких как участки, содержащие один или несколько мотивов. Примеры анализов включают в себя анализы ОТ-ПЦР и анализы полиморфизма одноцепочечной конформации(SSCP) (см., например, Marrogi et al., J. Cutan. Pathol. 26(8): 369-378 (1999, в которых используются полинуклеотиды, кодирующие конкретные участки белка, для идентификации данных участков в белке.II.А.2. Антисмысловые воплощения. Другие конкретные воплощения нуклеиновых кислот согласно изобретению, раскрытые в данном описании, представляют собой геномные ДНК, кДНК, рибозимы и антисмысловые молекулы, а также молекулы нуклеиновых кислот с альтернативным скелетом или содержащие альтернативные основания либо полученные из природных источников, либо синтезированные и включают в себя молекулы, способные ингибировать экспрессию РНК или белка STEAP-1. Например, антисмысловые молекулы могут представлять собой РНК или другие молекулы, в том числе пептидные нуклеиновые кислоты (PNAs) или молекулы, отличные от нуклеиновых кислот, такие как фосфотиоатные производные, которые специфически связываются с ДНК или РНК по принципу комплементарности оснований. Специалист в данной области может легко получить указанные классы молекул нуклеиновых кислот с использованием полинуклеотидов STEAP-1 и полинуклеотидных последовательностей, описанных в данном документе. Антисмысловая технология включает в себя введение экзогенных олигонуклеотидов, которые связываются с целевым полинуклеотидом, расположенным в клетках. Термин "антисмысловой" относится к олигонуклеотидам, комплементарным их внутриклеточным мишеням, например STEAP-1. См., например, Jack Cohen, Oligodeoxynucleotides, Antisense Inhibitors of Gene Expression, CRC Press, 1989 иSynthesis, 1: 1-5 (1988). Антисмысловые олигонуклеотиды STEAP-1 согласно изобретению включают в себя такие производные, как S-олигонуклеотиды (фосфоротиоатные производные или S-олиги, см., JackCohen, приведено выше), которые ингибируют рост раковых клеток с повышенной эффективностью.S-олигонуклеотиды (нуклеозидфосфоротиоаты) являются изоэлектронными аналогами олигонуклеотидов (О-олигонуклеотид), в которых не мостиковый атом кислорода фосфатной группы заменен на атом серы. S-олигонуклеотиды согласно изобретению можно получить путем обработки соответствующих О-олигонуклеотидов 3 Н-1,2-бензодитиол-3-он-1,1-диоксидом, который представляет собой реагент, переносящий серу. См., например, Iyer, R.P. et al., J. Org. Chem. 55: 4693-4698 (1990) и Iyer, R.P. et al., J.Am. Chem. Soc. 112: 1253-1254 (1990). Другие антисмысловые олигонуклеотиды STEAP-1 согласно изобретению включают в себя известные в данной области антисмысловые морфолиноолигонуклеотиды(см., например, Partridge et al., 1996, AntisenseNucleic Acid Drug Development, 6: 169-175). Антисмысловые олигонуклеотиды STEAP-1 согласно изобретению, как правило, представляют собой РНК или ДНК, комплементарные первым 100 5'-кодонам, или последним 100 3'-кодонам геномной последовательности STEAP-1, или соответствующей мРНК, или стабильно гибридизующиеся с ними. Абсолютная комплементарность не требуется, хотя высокая степень комплементарности является предпочтительной. Применение олигонуклеотида, комплементарного к данному участку, обеспечивает селективную гибридизацию с мРНК STEAP-1, но не с мРНК, кодирующей другие регуляторные субъединицы протеинкиназы. В одном воплощении антисмысловые олигонуклеотиды STEAP-1 согласно изобретению представляют собой фрагменты антисмысловой молекулы ДНК, содержащие от 15 до 30 мономеров, которые имеют последовательности, гибридизующиеся с мРНК STEAP-1.STEAP-1. Альтернативно, антисмысловые молекулы модифицируют, чтобы использовать рибозимы для ингибирования экспрессии STEAP-1, см., например, L.A. CoutureD.Т. Stinchcomb; Trends Genet. 12: 510-515 (1996).II.A.3. Праймеры и пары праймеров. Другие конкретные воплощения нуклеотидов согласно изобретению включают в себя праймеры и пары праймеров, обеспечивающие специфическую амплификацию полинуклеотидов согласно изобретению или любых конкретных фрагментов указанных полинуклеотидов, а также зонды, которые селективно или специфично гибридизуются с молекулами нуклеиновых кислот согласно изобретению или с любыми их фрагментами. Зонды можно пометить детектируемым маркером, таким как, например, радиоактивный изотоп, флуоресцентное соединение, биолюминесцентное соединение, хемилюминесцентное соединение, соединение, способное образовывать комплексы с металлами, или фермент. Такие зонды и праймеры используют для детектирования присутствия полинуклеотида STEAP-1 в образце и в качестве средств, позволяющих детектировать клетки, экспрессирующие белок STEAP-1. Примеры таких зондов включают в себя полинуклеотиды, содержащие полноразмерную последовательность кДНК человеческого STEAP-1, изображенную на фиг. 2, или ее часть. Примеры пар праймеров, способных обеспечить специфическую амплификацию мРНК STEAP-1, также описаны в примерах. Для опытного специалиста очевидно, что на основе последовательностей, описанных в данном документе, можно получить большое количество разных праймеров и зондов, которые можно эффективно использовать для амплификации и/или детектирования мРНК STEAP-1. Полинуклеотиды STEAP-1 согласно изобретению используют для разных целей, включающих в себя, без ограничения, применение в качестве зондов и праймеров для амплификации и/или детектирования гена (генов) STEAP-1, мРНК или его (их) фрагментов; применение в качестве реагентов для диагноза и/или прогнозирования рака простаты и других злокачественных заболеваний; применение в качестве кодирующих последовательностей, способных управлять экспрессией полипептидов STEAP-1; применение в качестве средств, модулирующих или ингибирующих экспрессию гена (генов) STEAP-1 и/или трансляцию транскрипта (транскриптов) STEAP-1; применение в качестве терапевтических средств. Настоящее изобретение включает в себя применение любого описанного в данном документе зонда для идентификации и выделения нуклеотидной последовательности STEAP-1 или нуклеотидной последовательности, родственной STEAP-1, из природного источника, такого как человек или другие млекопитающие, а также самой выделенной нуклеотидной последовательности, которая содержит полноразмерную последовательность, присутствующую в используемом зонде, или ее большую часть.II.A.4. Выделение молекул нуклеиновых кислот, кодирующих STEAP-1. Последовательности кДНК STEAP-1, описанные в данном документе, можно использовать для выделения других полинуклеотидов, кодирующих генные продукты STEAP-1, а также для выделения полинуклеотидов, кодирующих гомологи генных продуктов STEAP-1, изоформ, образующихся в результате альтернативного сплайсинга, аллельных вариантов и мутантных форм генного продукта STEAP-1, а также полинуклеотидов, кодирующих аналоги белков, родственных STEAP-1. Для выделения полноразмерных кДНК, кодирующих ген STEAP-1, можно использовать хорошо известные методы молекулярного клонирования (см., например, Sambrook, J. et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition,Cold Spring Harbor Press, New York, 1989; Current Protocols in Molecular Biology. Ausubel et al., Eds., Wileyand Sons, 1995). Например, можно использовать методы клонирования на основе лямбда-фага с помощью коммерчески доступных систем клонирования (например, Lambda ZAP Express, Stratagene). Фаговые клоны, содержащие кДНК генов STEAP-1, можно идентифицировать путем зондирования меченой кДНКSTEAP-1 или ее фрагментом. Например, в одном воплощении кДНК STEAP-1 (например, показанная на фиг. 2), или ее фрагмент, можно синтезировать и использовать в качестве зонда для идентификации перекрывающихся и полноразмерных кДНК, соответствующих гену STEAP-1. Сам ген STEAP-1 можно выделить путем скрининга библиотек геномных ДНК, библиотек бактериальных искусственных хромосом (ВАС), библиотек дрожжевых искусственных хромосом (YAC) и т.п. с использованием зондов или праймеров на основе ДНК STEAP-1.II.А.5. Рекомбинантные молекулы нуклеиновых кислот и системы векторов-хозяев. Данное изобретение также предлагает рекомбинантные молекулы ДНК или РНК, содержащие полинуклеотид STEAP-1, его фрагмент, аналог или гомолог, включающие в себя, без ограничения, фаги,плазмиды, фагмиды, космиды, YAC, ВАС, разные вирусные и невирусные векторы, хорошо известные в данной области, а также клетки, трансформированные или трансфицированные такими рекомбинантными молекулами ДНК или РНК. Способы получения таких молекул хорошо известны в данной области- 28014870 Данное изобретение также предлагает систему вектора-хозяина, включающую в себя рекомбинантную молекулу ДНК, содержащую полинуклеотид STEAP-1, его фрагмент, аналог или гомолог в подходящей прокариотической или эукариотической клетке-хозяине. Примеры подходящих эукариотических клеток-хозяев включают в себя дрожжевую клетку, растительную клетку или животную клетку, такую как клетка млекопитающего или клетка насекомого (например, клетку, которую можно инфицировать бакуловирусом, такую как клетка Sf9 или клетка HighFive). Примеры подходящих клеток млекопитающих включают в себя различные клеточные линии рака простаты, такие как DU145 и TsuPr1, другие клеточные линии рака простаты, которые можно трансфицировать или трансдуцировать, первичные клетки(PrEC), a также ряд клеток млекопитающих, обычно используемых для экспрессии рекомбинантных белков (таких как клетки COS, CHO, 293, 293 Т). Более конкретно, полинуклеотид, включающий в себя кодирующую последовательность STEAP-1 или ее фрагмент, аналог или гомолог, можно использовать для получения белков STEAP-1 или их фрагментов с использованием любого числа традиционно используемых и широко известных в данной области систем векторов-хозяев. Широкий ряд систем векторов-хозяев, подходящих для экспрессии белков STEAP-1 или их фрагментов, является доступным (см., например, Sambrook et al., 1989, приведено выше; Current Protocols inMolecular Biology, 1995, приведено выше). Векторы, предпочтительные для экспрессии в клетках млекопитающих, включают в себя, без ограничения, ркДНК 3.1 myc-His-tag (Invitrogen) и ретровирусный вектор pSRtkneo (Muller et al., 1991, MCB, 11: 1785). С помощью указанных векторов экспрессии STEAP-1 можно экспрессировать в некоторых клеточных линиях рака простаты и клеточных линиях, не связанных с простатой, включающих в себя, например, 293, 293 Т, RAT1, NIH 3 Т 3 и TsuPr1. Системы векторовхозяев согласно изобретению можно использовать для получения белка STEAP-1 или его фрагмента. Такие системы векторов-хозяев можно также использовать для изучения функциональных свойствSTEAP-1 и мутантов или аналогов STEAP-1. Рекомбинантный человеческий белок STEAP-1 или его аналог, гомолог или фрагмент также можно получить с использованием клеток млекопитающих, трансфицированных конструкцией, кодирующей нуклеотид, родственный STEAP-1. Например, клетки 293 Т можно трансфицировать экспрессионной плазмидой, кодирующей STEAP-1 или его фрагмент, аналог или гомолог, с последующими экспрессией белка, родственного STEAP-1, в клетках 293 Т и выделением рекомбинантного белка STEAP-1 с помощью стандартных методов очистки (таких как аффинная очистка с использованием антител противSTEAP-1). В другом воплощении последовательность, кодирующую STEAP-1, субклонируют в ретровирусном векторе pSRMSVtkneo и используют для инфицирования различных клеточных линий млекопитающих, таких как NIH 3 Т 3, TsuPrl, 293 и RAT1, с последующей экспрессией STEAP-1 в клеточных линиях. Можно использовать и другие системы экспрессии, хорошо известные в данной области. Для получения секретируемой формы рекомбинантного белка STEAP-1 можно использовать экспрессионные конструкции, включающие в себя последовательность, кодирующую лидерный пептид, и объединенную с ней в рамке считывания последовательность, кодирующую STEAP-1. Как указано в данном описании, избыточность генетического кода приводит к возникновению вариаций в генных последовательностях STEAP-1. В частности, как известно в данной области, конкретные виды-хозяева часто имеют характерные кодоновые предпочтения, и, следовательно, раскрываемую последовательность можно адаптировать для определенного хозяина. Например, в предпочтительных аналоговых кодоновых последовательностях редкие кодоны (т.е. кодоны, периодичность встречаемости которых в известных последовательностях конкретного хозяина составляет менее чем приблизительно 20%) обычно заменяют на кодоны с более высокой встречаемостью. Кодоновые предпочтения для конкретных видов рассчитывают, например, с помощью таблиц использования кодонов, которые можно найти в Интернете, например, на сайте URL dna.affrc.go.jp/-nakamura/codon.html. Известны другие модификации последовательности с целью увеличения экспрессии белка в клеткехозяине. Данные модификации включают в себя удаление последовательностей, кодирующих мнимые сигналы полиаденилирования, сигналы сплайсинга экзонов/интронов, транспозон-подобные повторы и/или другие подобные хорошо охарактеризованные последовательности, которые оказывают неблагоприятное влияние на экспрессию генов. Содержание GC в последовательности доводят до среднего уровня, характерного для конкретной клетки-хозяина, который рассчитывают по известным генам, экспрессирующимся в данном хозяине. По возможности последовательность модифицируют так, чтобы избежать прогнозированного образования шпилек во вторичной структуре мРНК. Другие полезные модификации включают в себя добавление консенсусной последовательности инициации трансляции в начало открытой рамки считывания, как описано Kozak, Mol. Cell Biol., 9: 5073-5080 (1989). Опытные специалисты понимают, что общее правило, согласно которому эукариотические рибосомы инициируют трансляцию исключительно по 5'-проксимальному кодону AUG, нарушается только в редких случаях
МПК / Метки
МПК: C12N 15/63, A61K 39/00, C12Q 1/00, G01N 33/53, A01K 67/00, C07K 14/00, C07H 21/04, C07K 16/30, C12N 5/24
Метки: белку, steap-1, антитела, применение
Код ссылки
<a href="https://eas.patents.su/30-14870-antitela-k-belku-steap-1-i-ih-primenenie.html" rel="bookmark" title="База патентов Евразийского Союза">Антитела к белку steap-1 и их применение</a>
Антитела повышенной продуктивности к белку активации фибробластов и способы их применения
Номер патента: 5401
Опубликовано: 24.02.2005
Авторы: Бамбергер Уве, Реттиг Вольфганг Й., Салдана Джоуз, Гарин-Чеса Пилар, Парк Джон Эдуард, Леже Оливье
МПК: A61P 35/00, C07K 16/40, A61K 47/48...
Метки: антитела, фибробластов, повышенной, белку, активации, применения, продуктивности, способы
Формула / Реферат:
1. Антитело, имеющее гипервариабельные участки моноклонального антитела F19 мыши (ATCC HB 8269), специфически связывающееся с белком активации фибробластов, отличающееся тем, что оно имеет модификации каркасного участка, которые приводят к повышенной продуктивности данного антитела в клетках-хозяевах по сравнению с химерным антителом, содержащим вариабельные области указанного антитела F19 и чужеродные константные области, причем уровень его...
Ассоциированные с ганглиозидами рекомбинантные антитела и их применение в диагностике и лечении опухолей
Номер патента: 6310
Опубликовано: 27.10.2005
Авторы: Лопес Рекена Алехандро, Роке Наварро Лоурдес Татьяна, Матео Де Акоста Дель Рио Кристина Мария, Ломбардеро Вальядарес Хосефа
МПК: C07K 16/30
Метки: лечении, ассоциированные, рекомбинантные, антитела, применение, опухолей, ганглиозидами, диагностике
Формула / Реферат:
1. Химерное моноклональное антитело, полученное из мышиного моноклонального антитела MAb P3, которое узнает ганглиозиды, содержащие N-гликолилированную сиаловую кислоту, и которое продуцируется гибридомной клеточной линией с депозитным номером ECACC 94113026, где гипервариабельные домены его тяжелой и легкой цепей содержат следующие последовательности: 2. Химерное моноклональное антитело по п.1, где области рамки считывания (FR) его тяжелой и...
Антиидиотипические моноклональные антитела, их применение в активной иммунотерапии злокачественных опухолей и содержащие их композиции
Номер патента: 3366
Опубликовано: 24.04.2003
Авторы: Перес Родригес Роландо, Бомбино Лопес Гумерсинда, Васкес Лопес Ана Мария, Перес Гонсалес Алексис, Босолей Дельгадо Ирене, Иглесиас Сьерра Эладио
МПК: A61K 39/395, C07K 16/42, A61P 35/00...
Метки: злокачественных, содержащие, антиидиотипические, активной, иммунотерапии, антитела, применение, опухолей, композиции, моноклональные
Формула / Реферат:
1. Штамм гибридных клеток ECACC ь 97112901, продуцирующий антиидиотипическое моноклональное антитело 1E10, специфичное в отношении антител мыши к N-гликолилсодержащим ганглиозидным опухолевым антигенам. 2. Антиидиотипическое моноклональное антитело 1E10, специфичное в отношении антител мыши к N-гликолилсодержащим ганглиозидным опухолевым антигенам, продуцируемое штаммом гибридных клеток по п.1 и обладающее защитным действием в отношении...
Антитела к тенасцину-с человека и их применение
Номер патента: 13537
Опубликовано: 30.06.2010
Авторы: Силачи Мичела, Брак Симон, Нери Дарио
МПК: A61P 35/00, C07K 16/28, A61K 39/395...
Метки: применение, антитела, человека, тенасцину-с
Формула / Реферат:
1. Антитело, специфично связывающее домен А1 тенасцина-С человека, которое содержитвариабельную область тяжелой цепи антитела, включающую один или более гипервариабельных участков CDR 1, CDR 2, CDR 3 вариабельной области тяжелой цепи, гдеCDR 1 соответствует SEQ ID NO: 5 или SEQ ID NO: 13;CDR 2 соответствует SEQ ID NO: 6;CDR 3 соответствует SEQ ID NO: 7; ивариабельную область легкой цепи антитела, включающую один или более гипервариабельных...
Рекомбинантные антитела и фрагменты, узнающие n-гликолил gm3 ганглиозид и их применение в диагностике и лечении злокачественных опухолей
Номер патента: 8353
Опубликовано: 27.04.2007
Авторы: Морено Фриас Эрнесто, Рохас Дорантес Гертрудис, Роке Наварро Лоудес Татьяна, Матео Де Акоста Дель Рио Кристина Мария, Родригес Гонсалес Мабель, Талавера Перес Арьель
МПК: C07K 16/46, A61K 39/395
Метки: опухолей, антитела, узнающие, применение, n-гликолил, фрагменты, лечении, диагностике, рекомбинантные, злокачественных, ганглиозид
Формула / Реферат:
1. Рекомбинантное антитело, полученное из мышиного моноклонального антитела 14F7, продуцируемое гибридомой с инвентарным номером ЕСАСС 98101901, характеризуемое последовательностями гипервариабельных областей (CDR) тяжелой и легкой цепей, приведенных ниже. ТЯЖЕЛАЯ ЦЕПЬ CDR1: SYWIH CDR2: YIDPATAYTESNQKFKD CDR3: ESPRLRRGIYYYAMDY ЛЕГКАЯ ЦЕПЬ CDR1: RASQSISNNLH CDR2: YASQSIS CDR3: QQSNRWPLT 2. Антитело по п.1, отличающееся тем, что является химерным...
Предыдущий патент: Фурнитурная система для окна, двери или т. п.
Следующий патент: Способ получения 4-азастероидов
Случайный патент: Экранирующее устройство с приводным двигателем и его применение