Скачать PDF файл.

Формула / Реферат

1. Применение пептида орнитинкарбамоилтрансферазы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS4 с последовательностью SEQ ID NO:1, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В.

2. Применение пептида орнитинкарбамоилтрансферазы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS4 с последовательностью SEQ ID NO:1, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для скрининга потенциальных лекарственных средств, эффективных против бактерий Streptococcus группы В.

3. Применение пептида орнитинкарбамоилтрансферазы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS4 с последовательностью SEQ ID NO:1, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для получения лекарственного препарата для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В.

4. Применение по любому из пп.1-3, согласно которому указанный пептид имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2.

5. Применение по любому из пп.1-4, согласно которому указанный аналог имеет более чем 80%-ную структурную гомологию с указанным пептидом.

6. Применение по любому из пп.1-4, согласно которому указанный аналог имеет 95%-ную структурную гомологию с указанным пептидом.

7. Применение пептида нефосфорилирующей НАДФ-зависимой глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS10 с последовательностью SEQ ID NO:11, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В.

8. Применение пептида нефосфорилирующей НАДФ-зависимой глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS10 с последовательностью SEQ ID NO:11, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для скрининга потенциальных лекарственных средств, эффективных против бактерий Streptococcus группы В.

9. Применение пептида нефосфорилирующей НАДФ-зависимой глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS11 с последовательностью SEQ ID NO:11, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для получения лекарственного препарата для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В.

10. Применение по любому из пп.7-9, согласно которому указанный пептид имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO:12.

11. Применение по любому из пп.7-10, согласно которому указанный аналог имеет более чем 80%-ную структурную гомологию с указанным пептидом.

12. Применение по любому из пп.7-10, согласно которому указанный аналог имеет 95%-ную структурную гомологию с указанным пептидом.

13. Применение пептида фосфоглицераткиназы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS11 с последовательностью SEQ ID NO:3, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В.

14. Применение пептида фосфоглицераткиназы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS11 с последовательностью SEQ ID NO:3, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для скрининга потенциальных лекарственных средств, эффективных против бактерий Streptococcus группы В.

15. Применение пептида фосфоглицераткиназы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS11 с последовательностью SEQ ID NO:3, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для получения лекарственного препарата для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В.

16. Применение по любому из пп.13-15, согласно которому указанный пептид имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4.

17. Применение по любому из пп.13-16, согласно которому указанный аналог имеет более чем 80%-ную структурную гомологию с указанным пептидом.

18. Применение по любому из пп.13-16, согласно которому указанный аналог имеет 95%-ную структурную гомологию с указанным пептидом.

19. Применение пептида нуклеозидфосфатазы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS14 с последовательностью SEQ ID NO:9, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В.

20. Применение пептида нуклеозидфосфатазы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS14 с последовательностью SEQ ID NO:9, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для скрининга потенциальных лекарственных средств, эффективных против бактерий Streptococcus группы В.

21. Применение пептида нуклеозидфосфатазы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS14 с последовательностью SEQ ID NO:9, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для получения лекарственного препарата для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В.

22. Применение по любому из пп.19-21, согласно которому указанный пептид имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO:10.

23. Применение по любому из пп.19-22, согласно которому указанный аналог имеет более чем 80%-ную структурную гомологию с указанным пептидом.

24. Применение по любому из пп.19-22, согласно которому указанный аналог имеет 95%-ную структурную гомологию с указанным пептидом.

25. Применение пептида глюкозо-6-фосфатизомеразы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS16 с последовательностями SEQ ID NO:5 и SEQ ID NO:7 (для 5'-фрагмента и 3'-фрагмента, соответственно) или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В.

26. Применение пептида глюкозо-6-фосфатизомеразы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS16 с последовательностями SEQ ID NO:5 и SEQ ID NO:7 (для 5'-фрагмента и 3'-фрагмента, соответственно), или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для скрининга потенциальных лекарственных средств, эффективных против бактерий Streptococcus группы В.

27. Применение пептида глюкозо-6-фосфатизомеразы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS16 с последовательностями SEQ ID NO:5 и SEQ ID NO:7 (для 5'-фрагмента и 3'-фрагмента, соответственно), или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для получения лекарственного препарата для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В.

28. Применение по любому из пп.25-27, согласно которому указанный пептид имеет аминокислотные последовательности SEQ ID NO:6 и SEQ ID NO:8.

29. Применение яю любому из пп.25-28, согласно которому указанный аналог имеет более чем 80%-ную структурную гомологию с указанным пептидом.

30. Применение по любому из пп.25-28, согласно которому указанный аналог имеет 95%-ную структурную гомологию с указанным пептидом.

31. Применение полинуклеотида, кодирующего пептиды или их фрагменты, охарактеризованные в пп.1-30 формулы, для скрининга потенциальных лекарственных средств, эффективных против бактерий Streptococcus группы В.

32. Применение полинуклеотида, кодирующего пептиды или их фрагменты, охарактеризованные в пп.1-30 формулы, для получения лекарственного препарата для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В.

33. Применение по любому из пп.1, 3, 7, 9, 13, 15, 19, 21, 25, 27, 32, отличающееся тем, что инфекция представляет собой очаговую инфекцию.

34. Применение по любому из пп.1, 3, 7, 9, 13, 15, 19, 21, 25, 27, 32, отличающееся тем, что инфекция представляет собой инфекцию мочевыводящих путей.

35. Антитело, специфически взаимодействующее с пептидами или их фрагментами, охарактеризованными в пп.1-30 формулы.

36. Вакцина, содержащая пептиды или их фрагменты, охарактеризованные в пп.1-30 формулы, для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В.

37. Вакцина по п.36, отличающаяся тем, что инфекция представляет собой очаговую инфекцию.

38. Вакцина по п.36, отличающаяся тем, что инфекция представляет собой инфекцию мочевыводящих путей.

 

Текст

Смотреть все

009885 Область изобретения Данное изобретение относится к идентификации белков наружной поверхности бактерий, их генов и к их применению. Более конкретно, изобретение относится к применению пептидов поверхности бактерий в терапии, для иммунизации и скрининга лекарственных средств. Предпосылка изобретенияStreptococcus группы В (GBS), также известный как Streptococcus agalactiae, является возбудителем различных состояний. В частности, GBS вызывает следующие инфекции. Инфекция, возникающая в раннем неонатальном возрасте. Эта инфекция обычно начинается in utero и вызывает у младенцев тяжелую септицемию и пневмонию, которые являются летальными, если их не лечить, и даже при лечении коэффициент смертности соответствует 10-20%. Инфекция, возникающая в позднем неонатальном возрасте. Эта инфекция встречается в период вскоре после рождения и примерно до 3 месячного возраста. Она вызывает септицемию, которая в 90% случаев осложняется менингитом. Также возникают другие очаговые инфекции, включая остеомиелит, септический артрит, абсцесс и эндофтальмит. Инфекции у взрослых. Данные инфекции, по-видимому, становятся все более распространенными и наиболее часто возникают у женщин, которые только что родили ребенка, у пожилых людей и людей с нарушенной иммунологической реактивностью. Инфекции характеризуются септицемией и очаговыми инфекциями, включая остеомиелит, септический артрит, абсцесс и эндофтальмит. Инфекции мочевых путей.GBS является причиной инфекций мочевых путей и при беременности составляет примерно 10% всех инфекций. Ветеринарные инфекции.GBS вызывает хронический мастит у коров. Это, в свою очередь приводит к снижению продукции молока и поэтому имеет важное экономическое значение.GBS-инфекции можно лечить антибиотиками. Однако предпочтительна иммунизация. Поэтому желательно разработать иммуно-ген, который можно было бы использовать в терапевтически эффективной вакцине. Краткое изложение сути изобретения Данное изобретение основано на идентификации серии генов у GBS, а также у родственных организмов, продукты которых могут быть связаны с наружной поверхностью организма и поэтому могут использоваться в качестве мишеней для иммунотерапии. Согласно одному аспекту изобретения, пептидом является пептид, кодируемый опероном, включающим в себя любой из генов, обозначенных здесь MS4, MS10, MS11, MS14 и MS16, получаемых изStreptococcus группы В, или его гомолог или его функциональный фрагмент. Такой пептид пригоден для терапевтического применения, например, когда он выделен. Термин "функциональные фрагменты" используется здесь для обозначения части гена или пептида,которая сохраняет активность целого гена или пептида. Например, функциональный фрагмент пептида можно использовать в качестве антигенной детерминанты, пригодной для вакцины или для продукции антител. Фрагмент гена можно использовать для кодирования активного пептида. В альтернативном случае фрагмент гена может иметь применение в генной терапии, нацеленной на ген дикого типа in vivo, чтобы вызвать терапевтический эффект. Согласно данному изобретению, пептид может включать в себя различные аминокислотные последовательности, обозначенные здесь в виде SEQ ID NO. 2, 4, 6, 8, 10 и 12, или их функциональные фрагменты. Вследствие внеклеточной локализации или локализации на поверхности клеток пептиды данного изобретения могут быть подходящими кандидатами для получения терапевтически эффективных вакцин против GBS. Подразумевается, что термин "терапевтически эффективная" включает профилактическое действие вакцин. Например, вакцина может содержать пептид согласно изобретению или средства для его экспрессии, для лечения инфекции. Указанную вакцину можно вводить особям женского пола либо перед, либо во время беременности,чтобы защитить мать и новорожденного от инфекции, вызванной GBS. Согласно другому аспекту изобретения, пептиды или гены могут быть использованы для скрининга потенциальных антимикробных лекарственных средств или для определения вирулентности. Следующим аспектом данного изобретения является применение любого идентифицированного здесь продукта для лечения или предотвращения состояния, связанного с инфекцией штаммом стрептококков группы В. Несмотря на то, что описан белок для использования при лечении пациентов, в рамках данного изобретения также рассматриваются ветеринарные применения продуктов изобретения. В частности, пептиды или вакцины могут быть использованы при лечении хронического мастита, особенно у коров.-1 009885 Описание изобретения Данное изобретение описано в отношении штамма М 732 стрептококков группы В. Однако вероятно, что все штаммы GBS и многие другие бактериальные штаммы содержат родственные пептиды или белки, имеющие аминокислотную последовательность, гомологичную пептиду М 732. Вероятно, организмы, которые содержат данные пептиды, включают в себя, но не ограничиваются этим, S. pneumoniae,S. pyogenes, S. suis, S. milleri, Streptococci группы С и группы G и Enterococci. Вакцины для каждого из этих организмов могут быть разработаны таким же образом, как описано для GBS. Предпочтительно, чтобы пептиды, которые могут быть пригодны для получения вакцин, обладали сходством последовательности более чем на 40% с идентифицированными здесь пептидами. Более предпочтительно, если пептиды обладают сходством последовательностей более чем на 60%. Наиболее предпочтительно, когда пептиды обладают сходством последовательностей более чем на 80%, например 95% сходством. Охарактеризовав ген согласно изобретению, можно использовать последовательность гена для того,чтобы определить гомологи у других микроорганизмов. Таким образом, можно установить, имеют ли другие микроорганизмы сходные продукты наружной поверхности. Гомология последовательностей может быть установлена посредством поиска в существующих базах данных, например EMBL или Genbank. Пептиды или белки согласно изобретению могут быть очищены и выделены способами, известными в данной области. В частности, идентифицировав последовательность гена, можно будет применить рекомбинантные технологии, чтобы экспрессировать гены в подходящем хозяине. Можно идентифицировать и использовать в терапии активные фрагменты и гомологи. Например, пептиды или их активные фрагменты можно использовать в качестве антигенных детерминант в вакцине, чтобы вызвать иммунный ответ. Они также могут быть использованы для получения антител для пассивной иммунизации или для применения в диагностике. Подходящие антитела включают в себя моноклональные антитела или их фрагменты, включая одноцепочечные fv-фрагменты. Способы получения антител будут очевидны для специалистов в данной области. Специалистам в данной области известно получение вакцин на основе аттенуированных микроорганизмов. Композиции вакцин могут быть приготовлены при необходимости или при желании с подходящими носителями или адъювантами, например, квасцами, и использованы в терапии для того, чтобы обеспечить эффективную иммунизацию против Streptococci группы В или других родственных микроорганизмов. Приготовление композиций вакцин будет очевидным для специалистов. В более общем смысле и как хорошо известно специалистам в данной области, для терапевтического применения может быть выбрано подходящее количество активного компонента согласно изобретению, также могут быть выбраны подходящие носители или наполнители и пути введения. Указанные факторы будут выбраны или определены по известным критериям, таким как природа/тяжесть состояния, которое будут лечить, тип или здоровье субъекта и т.д. Продукты данного изобретения идентифицировали следующим образом. В бульон Todd-Hewitt инокулировали GBS и давали возможность расти в течение ночи при 37 С. Клетки собирали центрифугированием и промывали фосфатно-солевым буфером (PBS). Клетки снова суспендировали в осмотическом буфере (20% (мас./об.) сахарозы, 20 мМ трис-HCl рН 7,0, 10 мМ MgCl2),содержащем ингибиторы протеаз (1 мМ PMSF, 10 мкМ иодуксусной кислоты, 10 мМ 1,10-фенантролина,1 мкМ пепстатина А) и мутанолизин в конечной концентрации 4 единицы в микролитре. Суспензию инкубировали (встряхивание) при 37 С в течение 2 ч. Клетки и клеточные остатки удаляли сначала высокоскоростным центрифугированием, затем ультрацентрифугированием в течение 1 ч. Полученный в результате надосадок, содержащий белки клеточной стенки, концентрировали под давлением, используя устройство для ультрафильтрации (отделяемая молекулярная масса 10000). Образец диализовали против воды сверхвысокой степени очистки и лиофильно сушили. После повторного суспендирования в буфере для нанесения белки разделяли препаративным 2-мерным гельэлектрофорезом. После электрофореза выбирали отдельные пятна для исследования. Пятно подвергали триптическому перевариванию в геле. Полученные в результате пептиды экстрагировали из геля и очищали, используя ОФ-ВЭЖХ микропроб. Фракции собирали каждые 45 с, и часть фракций, совпадающих с районами поглощения УФ, анализировали времяпролетной масс-спектрометрией с матричной лазерной десорбцией образца с замедленным отбором (DE-MALDI-TOF-MS). Затем пептиды, не обнаруживаемые в контрольном препарате, подвергали секвенированию с использованием тандемной масс-спектрометрии(МС/МС) с ионизацией в наноспрее. Используя информацию о последовательности указанного пептида, конструировали вырожденные олигонуклеотиды, используемые затем в полимеразной цепной реакции (ПЦР), чтобы амплифицировать фрагмент ДНК, расположенный между идентифицированными последовательностями пептидов. Результатом ПЦР-амплификации было получение нескольких полинуклеотидных фрагментов, каждый из которых клонировали в векторе pCR 2.1-TOPO (Invitrogen BV, Netherlands), согласно протоколу производителей.-2 009885 Фрагмент ДНК в каждой плазмиде идентифицировали секвенированием и затем использовали для получения полноразмерной последовательности гена следующим образом. Используя идентифицированный фрагмент ДНК, конструировали олигонуклеотидные праймеры для секвенирования геномной ДНК. Указанные праймеры конструировали так, чтобы образовывать последовательность во "внешнем" направлении относительно полученной последовательности. Считав один раз, полученную последовательность проверяли, чтобы выяснить, были ли достигнуты 5'- и 3'концы гена. Наличие указанных характеристик определяли при сравнении с гомологичными последовательностями, и для 5'-конца по наличию стартового кодона AUG (или подходящей альтернативы), которому предшествует консенсусная последовательность Shine-Dalgarno, и для 3'-конца по наличию кодона терми-нации транскрипции (стоп-кодона). При идентификации полноразмерного гена конструировали праймеры для амплификации полноразмерного продукта с геномной ДНК GBS. Использованные праймеры включали в себя сайты узнавания ферментами рестрикции (NcoI на 5'-конце и Есо 0109I на 3'-конце), обеспечивая возможность последующего клонирования продукта в используемой системе экспрессии лактококков. Используя праймеры, проводили ПЦР, и продукты клонировали в клонирующем векторе pCR 2.1(In Vitrogen). После подтверждения наличия клонированного фрагмента ДНК вырезали, используя ферменты рестрикции NcoI и Есо 0109I. Вектор, в который встраивали указанный фрагмент, представлял собой модифицированную версиюpNZ8048 (Kuipers, О.P. et al., (1998) J. Biotech 64: 15-21). Указанный вектор, несущий начало репликации лактококков, маркер резистентности к хлорамфениколу, индуцируемый промотор низина и сайт множественного клонирования, был изменен заменой сайта множественного клонирования двумя 10 Х Hisметками, фланкированными на самом 5'-конце сайтом NcoI, разделенными в середине сайтом множественного клонирования (включая Есо 0109I-сайт), и стоп-кодоном (кодоном терминации) на 3'-конце Hisметок. Интересующий ген встраивали так, чтобы 10 Х His-метка была в 3'-положении относительно кодирующего района. После трансформации L. lactis (штамм NZ9000 - Kuipers, О. P. et al., (1998), выше) рекомбинантной плазмидой получали 400 мл жидкой культуры, и индуцировали трансляцию белка добавлением к культуре низина. После 2 ч инкубации клетки собирали и лизировали разбиванием шариками. Полученный в результате лизат очищали центрифугированием, затем пропускали через металлоаффинную колонку (Talon, Clonetech). Колонку многократно промывали перед тем, как связанные белки элюировали имидазолом. Чтобы идентифицировать фракции, содержащие меченный His рекомбинантный белок, аликвоту из каждой фракции анализировали в SDS-ПААГ, выполняли вестерн-блоттинг и исследовали с помощью анти-His-антител. Затем полученный рекомбинантный белок использовали для иммунизации новозеландских белых кроликов с доиммунной сывороткой, собранной до иммунизации. После повторной иммунизации кроликов забивали и собирали сыворотку. Указанную сыворотку использовали в вестерн-блоттах, ELISA и моделях иммунной защиты животных. Используя сыворотку, полученную при исследовании животных, проводили исследование иммуносорбции.Streptococcus группы В выращивали в 20 мл бульона Todd-Hewitt (THB) в течение 8 ч, собирали и повторно суспендировали в 5 мл PBS. Аликвоты суспензии объемом 50 мкл использовали для того, чтобы покрыть лунки 96-луночного планшета (Nunc Immuno-Sorb). Планшет оставляли при 4 С в течение ночи, давая возможность для абсорбции бактерий на планшете. Планшеты дважды промывали PBS, затем блокировали 3% БСА в течение 1 ч при 37 С. Планшеты снова промывали. Делали серийные 10 кратные разведения сыворотки в PBS, и по 50 мкл каждого из этих разведений добавляли в лунки планшета, в повторах. Планшет накрывали и инкубировали в течение 1 ч при 37 С. Планшет промывали, затем в каждую лунку добавляли 50 мкл вторичных антикроличьих антител, конъюгированных с щелочной фосфатазой, в концентрации 1:5000. После инкубации при 37 С в течение часа планшет снова промывали. В каждую лунку добавляли 50 мкл субстрата (PNPP) и давали реакции возможность продолжаться в течение 30 мин перед тем, как регистрировали оптическую плотность при 405 нм. Также проводили исследования иммунной защиты животных, чтобы тестировать эффективность защиты иммунизированных кроликов.GBS M732 выращивали в ТНВ до момента достижения середины лог-фазы - примерно 5 ч. Клетки считали в камере для подсчета, и бактерии разбавляли до получения концентрации 2107 бактерий в мл в сыворотке, полученной до иммунизации, или тестируемой сыворотке. 50 мкл суспензии инъецировали внутрибрюшинно мышам 0-1-дневного возраста. Следили за выживаемостью мышей в течение 48 ч. Следующие примеры иллюстрируют изобретение. Пример 1. Первая плазмида была названа MS4. Секвенировали клонированный фрагмент ДНК, и нуклеотидную и рассчитанную аминокислотную последовательность (SEQ ID NO. 1 и 2) использовали для поиска в базе данных белков.-3 009885 Гомологи продукта гена MS4 GBS можно идентифицировать в Clostridium perfingens, Haemophilusinfluenzae, Neisseria fla-vescens и Thermatoga maritima. Во всех случаях гомологи представляют собой гены орнитинкарбомоилтрансферазы (ОКТ). В эукариотических системах данный фермент катализирует второй этап в цикле мочевины, превращение орнитина в цитруллин, реакцию, требующую карбомоилфосфата. У прокариот ODC является одним из трех ферментов, вовлеченных в аргининдезаминазную активность-систему, которая защищает бактерии от повреждения кислотой. В частности, ODC ответственна за превращение цитруллина в орнитин и карбомилфосфат (роль, противоположная роли у эукариот) (Casiano-Colon, A and Marquis, R. E. 1988. Appl. Environ. Microbiol. 54: 1318-1324, Cunin, R. et al. 1986,Microbiol. Rev. 50: 314-352). Исследования иммунной защиты животных проводили, как описано выше. Результаты представляют собой следующее: Пример 2. Вторая плазмида была названа MS11. Нуклеотидную и рассчитанную аминокислотную последовательность (SEQ ID NO. 3 и 4) использовали для поиска в базе данных белков. Гомологи продукта гена MS11 GBS можно идентифицировать в Lactobacillus delbrueckii, Thermotoga maritima, Clostridium acetobulylicum, Bacillus megaterium, Triticum aestivium и SynechocystisPCC6803. Во всех случаях гомологи представляют собой гены белковой фосфоглицераткиназы (PGK). PGK представляет собой основной фермент гликолитического пути, являясь вовлеченной в превращение глицеральдегид-3-фосфата в фосфоенолпируват. В частности, этот фермент вовлечен в катализ реакции между глицерат-1,3-дифосфатом и 3-фосфоглицератом, высвобождая фосфат в прямой реакции. Пример 3. Третья плазмида была названа pMS16. Секвенировали 5'- и 3'-клонированные фрагменты, и нуклеотидная и рассчитанная аминокислотная последовательности для каждого случая показаны в SEQ ID NO. 5 и 6 для 5' -фрагмента и SEQ ID NO. 7 и 8 для 3'-фрагмента. Гомологи продукта гена MS4 GBS можно идентифицировать в Bacillus stearothermophilus, Bacillussubtilis и Mycoplasma genitalium. Во всех случаях гомологи представляют собой гены белка глюкозо-6-фосфатизомеразы (GPI). Фермент глюкозо-6-фосфатизомераза катализирует реакцию между глюкозо-6-фосфатом и фруктозо-6-фосфатом, как при гликолизе (G6P в F6P), так и при глюконеогенезе (F6P в G6P). Показано, что мутации в гене gpi придают организмам чувствительность к аналогам пурина. Пример 4. Четвертая плазмида была названа pMS14. Клонированный фрагмент ДНК секвенировали, и нуклеотидную и рассчитанную аминокислотную последовательность (SEQ ID NO. 9 и 10) использовали для поиска в базе данных белков. Гомологи продукта гена MS14 GBS можно идентифицировать в Bacillus subtilis, Bacillus stearothermophilus, Mus musculus, Bos taurus и Zea mays. Во всех случаях гомологи представляют собой гены белка нуклеозидфосфатазы (PNP). Функция этого фермента состоит в расщеплении нуклеозидов гуанозина или инозина до соответствующих им оснований и молекул сахаро-1-фосфата в присутствии ортофосфата. Пример 5. Пятая плазмида была названа pMS10. Клонированный фрагмент ДНК секвенировали. Нуклеотидную и рассчитанную аминокислотную последовательность (SEQ ID NO. 11 и 12) использовали для поиска в базе данных белков. Гомологи продукта гена MS10 GBS можно идентифицировать в Streptococcus mutans, Nicotianaplumb, Pisum sativum и Zea mays. Во всех случаях гомологи представляют собой белок нефосфорилирующей НАДФ-зависимой глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (NPGAP-3-DH). Сообщалось,что NPGAP-3-DH является важным средством создания НАДФН для реакций биосинтеза у S. mutans (что противоположно НАД-специфичной GAP-3-DH, которая удовлетворяет потребности гликолитического пути) (Boyd, D.A., Cvitkovitch, D. G. and Hamilton, I. r 1995 J. Bacteriol. 177: 2622-2727).- 23009885 ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ 1. Применение пептида орнитинкарбамоилтрансферазы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS4 с последовательностью SEQ ID NO:1, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В. 2. Применение пептида орнитинкарбамоилтрансферазы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS4 с последовательностью SEQ ID NO:1, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию,или их фрагмента для скрининга потенциальных лекарственных средств, эффективных против бактерийStreptococcus группы В. 3. Применение пептида орнитинкарбамоилтрансферазы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS4 с последовательностью SEQ ID NO:1, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию,или их фрагмента для получения лекарственного препарата для лечения или профилактики инфекции,вызываемой бактериями Streptococcus группы В. 4. Применение по любому из пп.1-3, согласно которому указанный пептид имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2. 5. Применение по любому из пп.1-4, согласно которому указанный аналог имеет более чем 80%ную структурную гомологию с указанным пептидом. 6. Применение по любому из пп.1-4, согласно которому указанный аналог имеет 95%-ную структурную гомологию с указанным пептидом. 7. Применение пептида нефосфорилирующей НАДФ-зависимой глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS10 с последовательностьюSEQ ID NO:11, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В. 8. Применение пептида нефосфорилирующей НАДФ-зависимой глицеральдегид-3 фосфатдегидрогеназы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS10 с последовательностью SEQ ID NO:11, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для скрининга потенциальных лекарственных средств, эффективных против бактерий Streptococcus группы В. 9. Применение пептида нефосфорилирующей НАДФ-зависимой глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS11 с последовательностью SEQID NO:11, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для получения лекарственного препарата для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В. 10. Применение по любому из пп.7-9, согласно которому указанный пептид имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO:12. 11. Применение по любому из пп.7-10, согласно которому указанный аналог имеет более чем 80%ную структурную гомологию с указанным пептидом. 12. Применение по любому из пп.7-10, согласно которому указанный аналог имеет 95%-ную структурную гомологию с указанным пептидом. 13. Применение пептида фосфоглицераткиназы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS11 с последовательностью SEQ ID NO:3, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В. 14. Применение пептида фосфоглицераткиназы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS11 с последовательностью SEQ ID NO:3, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для скрининга потенциальных лекарственных средств, эффективных против бактерий Streptococcus группы В. 15. Применение пептида фосфоглицераткиназы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS11 с последовательностью SEQ ID NO:3, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для получения лекарственного препарата для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В. 16. Применение по любому из пп.13-15, согласно которому указанный пептид имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4. 17. Применение по любому из пп.13-16, согласно которому указанный аналог имеет более чем 80%ную структурную гомологию с указанным пептидом. 18. Применение по любому из пп.13-16, согласно которому указанный аналог имеет 95%-ную структурную гомологию с указанным пептидом.- 24009885 19. Применение пептида нуклеозидфосфатазы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS14 с последовательностью SEQ ID NO:9, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В. 20. Применение пептида нуклеозидфосфатазы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS14 с последовательностью SEQ ID NO:9, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для скрининга потенциальных лекарственных средств, эффективных против бактерий Streptococcus группы В. 21. Применение пептида нуклеозидфосфатазы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS14 с последовательностью SEQ ID NO:9, или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для получения лекарственного препарата для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В. 22. Применение по любому из пп.19-21, согласно которому указанный пептид имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO:10. 23. Применение по любому из пп.19-22, согласно которому указанный аналог имеет более чем 80%ную структурную гомологию с указанным пептидом. 24. Применение по любому из пп.19-22, согласно которому указанный аналог имеет 95%-ную структурную гомологию с указанным пептидом. 25. Применение пептида глюкозо-6-фосфатизомеразы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS16 с последовательностями SEQ ID NO:5 и SEQ ID NO:7 (для 5'-фрагмента и 3'фрагмента, соответственно) или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В. 26. Применение пептида глюкозо-6-фосфатизомеразы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS16 с последовательностями SEQ ID NO:5 и SEQ ID NO:7 (для 5'-фрагмента и 3'фрагмента, соответственно), или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для скрининга потенциальных лекарственных средств, эффективных против бактерий Streptococcus группы В. 27. Применение пептида глюкозо-6-фосфатизомеразы бактерий Streptococcus группы В, кодируемого полинуклеотидом MS16 с последовательностями SEQ ID NO:5 и SEQ ID NO:7 (для 5'-фрагмента и 3'фрагмента, соответственно), или аналога указанного пептида, обладающего с ним по меньшей мере 70%-ной структурной гомологией и сохраняющего ту же функцию, или их фрагмента для получения лекарственного препарата для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В. 28. Применение по любому из пп.25-27, согласно которому указанный пептид имеет аминокислотные последовательности SEQ ID NO:6 и SEQ ID NO:8. 29. Применение по любому из пп.25-28, согласно которому указанный аналог имеет более чем 80%ную структурную гомологию с указанным пептидом. 30. Применение по любому из пп.25-28, согласно которому указанный аналог имеет 95%-ную структурную гомологию с указанным пептидом. 31. Применение полинуклеотида, кодирующего пептиды или их фрагменты, охарактеризованные в пп.1-30 формулы, для скрининга потенциальных лекарственных средств, эффективных против бактерийStreptococcus группы В. 32. Применение полинуклеотида, кодирующего пептиды или их фрагменты, охарактеризованные в пп.1-30 формулы, для получения лекарственного препарата для лечения или профилактики инфекции,вызываемой бактериями Streptococcus группы В. 33. Применение по любому из пп.1, 3, 7, 9, 13, 15, 19, 21, 25, 27, 32, отличающееся тем, что инфекция представляет собой очаговую инфекцию. 34. Применение по любому из пп.1, 3, 7, 9, 13, 15, 19, 21, 25, 27, 32, отличающееся тем, что инфекция представляет собой инфекцию мочевыводящих путей. 35. Антитело, специфически взаимодействующее с пептидами или их фрагментами, охарактеризованными в пп.1-30 формулы. 36. Вакцина, содержащая пептиды или их фрагменты, охарактеризованные в пп.1-30 формулы, для лечения или профилактики инфекции, вызываемой бактериями Streptococcus группы В. 37. Вакцина по п.36, отличающаяся тем, что инфекция представляет собой очаговую инфекцию. 38. Вакцина по п.36, отличающаяся тем, что инфекция представляет собой инфекцию мочевыводящих путей. Евразийская патентная организация, ЕАПВ Россия, 109012, Москва, Малый Черкасский пер., 2/6

МПК / Метки

МПК: C12N 9/22, C12N 15/53, C07K 14/315, C12N 15/61, C12N 15/54, C12N 15/62, C12N 9/92, C12N 15/55, C12N 9/02, C12N 9/10, C12N 9/12

Метки: streptococcus, вакцина, антитело, применение, бактерий, группы, полинуклеотида, кодирующего, пептидов

Код ссылки

<a href="https://eas.patents.su/26-9885-primenenie-peptidov-bakterijj-streptococcus-gruppy-v-kodiruyushhego-ih-polinukleotida-vakcina-i-antitelo.html" rel="bookmark" title="База патентов Евразийского Союза">Применение пептидов бактерий streptococcus группы в, кодирующего их полинуклеотида, вакцина и антитело</a>

Похожие патенты